研究課題/領域番号 |
25430183
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研究種目 |
基盤研究(C)
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配分区分 | 基金 |
応募区分 | 一般 |
研究分野 |
システムゲノム科学
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研究機関 | 長崎大学 |
研究代表者 |
三嶋 博之 長崎大学, 原爆後障害医療研究所, 助教 (10513319)
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連携研究者 |
吉浦 孝一郎 長崎大学, 原爆後障害医療研究所, 教授 (00304931)
片山 俊明 情報, システム研究機構DBCLS, 助教 (60396869)
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研究期間 (年度) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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研究課題ステータス |
完了 (2015年度)
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配分額 *注記 |
5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
2015年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2014年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
2013年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
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キーワード | ヒトゲノム / バイオインフォマティクス / 次世代シークエンサー / ワークフロー / データベース生物学 / Ruby / TogoWS / ゲノム / REST API / UCSCゲノムデータベース |
研究成果の概要 |
本研究は大規模シークエンサーによる疾患責任変異の探索はのためのワークフローの構築を目的とする。このために本研究では公共サービスであるTogoWSの拡張によるUCSC Genome Databaseのサポート、各種オープンソースツール公開、Bio-Virtuosoの公開を行った。また、12名の全ゲノムシークエンシングデータにワークフローを応用した。
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