データウェアハウスとタンパク質予測情報を組み合わせた創薬標的探索システムの開発

• 研究課題/領域番号: 25430186
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: システムゲノム科学
• 研究機関: 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所
• 研究代表者: 水口 賢司 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所, 医薬基盤研究所 バイオインフォマティクスプロジェクト, プロジェクトリーダー (50450896)
• 連携研究者: 村上 洋一 国立研究開発法人 医薬基盤・健康・栄養研究所, 医薬基盤研究所, プロジェクト研究員 (20548424)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円); 2015年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円); 2014年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2013年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
• キーワード: データベース / 創薬ターゲット / タンパク質相互作用

研究成果の概要

本研究では、申請者が開発した統合データウェアハウスTargetMineと個々のタンパク質の機能や相互作用を予測する方法を統合し、創薬標的やバイオマーカー探索を効率的に実行するプラットフォームを開発することを目的とした。アミノ酸配列のみからそのタンパク質がDNAに結合するかどうかや、相互作用するタンパク質を予測する方法をヒトゲノム全体に適用し、予測によるアノテーションとTargetMineに格納している実験的なアノテーションとを統合して解析できるシステムを構築した。このシステムを呼吸器疾患の病態モデルマウスの網羅的遺伝子発現データの解析などに応用し、老化や炎症と関連する新規経路の抽出に成功した。

研究成果

• [国際共同研究] University College London(英国)
• [国際共同研究] Merck Research Laboratories, Merck & Co(米国)
• [雑誌論文] An integrative data analysis platform for gene set analysis and knowledge discovery in a data warehouse framework (2016)
  • 著者名/発表者名: Chen Y. A., Tripathi L. P., Mizuguchi K.
  • 雑誌名: Database (Oxford) 巻: - ページ: baw009-baw009
  • DOI: 10.1093/database/baw009
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] The diversity of H3 loops determines the antigen-binding tendencies of antibody CDR loops (2016)
  • 著者名/発表者名: Tsuchiya Y., Mizuguchi K.
  • 雑誌名: Protein Sci 巻: 25 号: 4 ページ: 815-825
  • DOI: 10.1002/pro.2874
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Integration of Ligand and Structure Based Approaches for CSAR-2014 (2015)
  • 著者名/発表者名: Prathipati P., Mizuguchi K.
  • 雑誌名: J. Chem. Inf. Model 巻: - 号: 6 ページ: 974-987
  • DOI: 10.1021/acs.jcim.5b00477
  • NAID: 120007001200
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Profiles of microRNA networks in intestinal epithelial cells in a mouse model of colitis. (2015)
  • 著者名/発表者名: Lee J, Park EJ, Yuki Y, Ahmad S, Mizuguchi K, Ishii KJ, Shimaoka M, Kiyono H.
  • 雑誌名: Sci Rep 巻: 5 号: 1 ページ: 18174-18174
  • DOI: 10.1038/srep18174
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Integration of Disease Entries Across OMIM, Orphanet, and a Proprietary Knowledge Base (2015)
  • 著者名/発表者名: Ito M., Nakagawa S., Mizuguchi K., Okumura T.
  • 雑誌名: Current Approaches in Applied Artificial Intelligence (Lecture Note in Computer Science) 巻: 9101 ページ: 120-130
  • DOI: 10.1007/978-3-319-19066-2_12
  • ISBN: 9783319190655, 9783319190662
  • 査読あり
• [雑誌論文] BIG3 inhibit the estrogen-dependent nuclear translocation of PHB2 via multiple Karyopherin-alpha proteins in breast cancer cells. (2015)
  • 著者名/発表者名: Kim NH, Yoshimaru T, Chen YA, Matsuo T, Komatsu M, Miyoshi Y, Tanaka E, Sasa M, Katagiri T
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 10 号: 6 ページ: e0127707-e0127707
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0127707
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Retinoblastoma Binding Protein 4-Regulated Classical Nuclear Transport Is Involved in Cellular Senescence (2015)
  • 著者名/発表者名: Tsujii A., Miyamoto Y., Moriyama T., Tsuchiya T., Obuse C., Mizuguchi K., Oka M., Yoneda Y.
  • 雑誌名: The Journal of Biological Chemistry 巻: 290 号: 49 ページ: 29375-29388
  • DOI: 10.1074/jbc.m115.681908
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Systems Biology Approaches to a Rational Drug Discovery Paradigm (2015)
  • 著者名/発表者名: Prathipati P., Mizuguchi K.
  • 雑誌名: Current Topics in Medicinal Chemistry 巻: 16(9) 号: 9 ページ: 1009-1025
  • DOI: 10.2174/1568026615666150826114524
  • NAID: 120007001199
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of potential inhibitors based on compound proposal contest: Tyrosine-protein kinase Yes as a target (2015)
  • 著者名/発表者名: Chiba S, Akiyama Y, Sekijima M.
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 5 号: 1 ページ: 1-13
  • DOI: 10.1038/srep17209
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Crystal structure of FtsA from Staphylococcus aureus (2014)
  • 著者名/発表者名: J. Fujita, Y. Maeda, C. Nagao, Y. Tsuchiya, Y. Miyazaki, M. Hirose, E. Mizohata, Y. Matsumoto, T. Inoue, K. Mizuguchi, and H. Matsumura
  • 雑誌名: FEBS Lett. 巻: 588 号: 10 ページ: 1879-1885
  • DOI: 10.1016/j.febslet.2014.04.008
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Homology-based prodection of interactions between proteins using Averaged One-Dependence Estimators (2014)
  • 著者名/発表者名: Mizuguchi K., Murakami Y.
  • 雑誌名: BMC bioinformatics 巻: 15 号: 1 ページ: 213-213
  • DOI: 10.1186/1471-2105-15-213
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3 (BIG3) is predicted to interact with its partner through an ARM-type α-helical structure (2014)
  • 著者名/発表者名: Mizuguchi K., Chen Y. A., Murakami Y., Ahmad S., Yoshimaru T., Katagri T.
  • 雑誌名: BMC Res Notes 巻: 7 号: 1 ページ: 435-435
  • DOI: 10.1186/1756-0500-7-435
  • NAID: 120006864075
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] High-resolution modeling of antibody structures by a combination of bioinformatics, expert knowledge, and molecular simulations. (2014)
  • 著者名/発表者名: Hiroki Shirai, Kazuyoshi Ikeda, Kazuo Yamashita, Yuko Tsuchiya, Jamica Sarmiento, Shide Liang, Tatsuaki Morokata, Kenji Mizuguchi, Junichi Higo, Daron M. Standley, Haruki Nakamura
  • 雑誌名: Proteins 巻: 印刷中 号: 8 ページ: 1624-1635
  • DOI: 10.1002/prot.24591
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Dextran sulfate-resistant A/Puerto Rico/8/34 influenza virus is associated with the emergence of specific mutations in the neuraminidase glycoprotein (2014)
  • 著者名/発表者名: Yamada H, Nagao C, Haredy AM, Mori Y, Mizuguchi K, Yamanishi K, Okamoto S
  • 雑誌名: Antiviral Research 巻: 111 ページ: 69-77
  • DOI: 10.1016/j.antiviral.2014.09.002
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Altered Actions of Memantine and NMDA-Induced Currents in a New Grid2-Deleted Mouse Line. (2014)
  • 著者名/発表者名: Ayako Kumagai, Akira Fujita, Tomoki Yokoyama, Yuki Nonobe, Yasuhiro Hasaba, Tsutomu Sasaki, Yumi Itoh, Minako Koura, Osamu Suzuki, Shigeki Adachi, Haruko Ryo, Arihiro Kohara, Lokesh P. Tripathi, Masato Sanosaka, Toshiki Fukushima, Taisei Nomura, Hiroshi Takemori, et al.
  • 雑誌名: Genes 巻: 5 号: 4 ページ: 1095-1114
  • DOI: 10.3390/genes5041095
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Integrated pathway clusters with coherent biological themes for target prioritisation. (2014)
  • 著者名/発表者名: Chen YA.,Tripathi LP.,Dessailly BH.,Nyström-Persson J.,Ahmad S.,Mizuguchi K.,
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 9 号: 6 ページ: e99030-e99030
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0099030
  • 査読あり
• [雑誌論文] 計算生物学によるシステムの理解から創薬へ、 (2014)
  • 著者名/発表者名: 水口賢司
  • 雑誌名: 生命科学から創薬へのイノベーション 巻: 1 ページ: 82-88
• [雑誌論文] Sagace 創薬・疾患研究のためのデータベース横断検索サービス (2014)
  • 著者名/発表者名: 水口賢司、伊藤真和吏
  • 雑誌名: 今日から使える！データベース・ウェブツール達人になるための実践ガイド 巻: 1 ページ: 60-61
• [雑誌論文] Prediction of detailed enzyme functions and identification of specificity determining residues by random forests (2014)
  • 著者名/発表者名: Nagao C., Nagano N., Mizuguchi K.
  • 雑誌名: PloS One 巻: 9 号: 1 ページ: e84623-e84623
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0084623
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functional site plasticity in domain superfamilies (2013)
  • 著者名/発表者名: Dessailly B.H., Dawson N.L., Mizuguchi K., Orengo C.A.
  • 雑誌名: Biochim Biophys Acta 巻: 1834 号: 5 ページ: 874-89
  • DOI: 10.1016/j.bbapap.2013.02.042
  • 査読あり
• [雑誌論文] Understanding the biological context of NS5A-host interactions in HCV infection: a network-based approach. (2013)
  • 著者名/発表者名: Tripathi LP, Kambara H, Chen YA, Nishimura Y, Moriishi K, Okamoto T, Morita E, Abe T, Mori Y, Matsuura Y, Mizuguchi K
  • 雑誌名: J Proteome Res 巻: 12 号: 6 ページ: 2537-2551
  • DOI: 10.1021/pr3011217
  • 査読あり
• [雑誌論文] Toxygates: Interactive Toxicity Analysis on a Hybrid Microarray and Linked Data Platform (2013)
  • 著者名/発表者名: Johan Nyström-Persson, Yoshinobu Igarashi, Maori Ito, Mizuki Morita, Noriyuki Nakatsu, Hiroshi Yamada, Kenji Mizuguchi
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 29 号: 23 ページ: 3080-3086
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/btt531
  • NAID: 130005468755
  • 査読あり
• [雑誌論文] Targeting BIG3-PHB2 interaction to overcome tamoxifen resistance in breast cancer cells (2013)
  • 著者名/発表者名: T. Yoshimaru, M. Komatsu, T. Matsuo, Y.-A. Chen, Y. Murakami, K. Mizuguchi, E. Mizohata, T. Inoue, M. Akiyama, R. Yamaguchi, S. Imoto, S. Miyano, Y. Miyoshi, M. Sasa, Y. Nakamura, and T. Katagiri
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 4 号: 1 ページ: 2433-2433
  • DOI: 10.1038/ncomms3443
  • 査読あり
• [学会発表] 構造からネットワークへ：計算生物学による創薬研究 (2016)
  • 著者名/発表者名: 水口賢司
  • 学会等名: 日本学術振興会構造生物169委員会 第４９回研究会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2016-03-09
• [学会発表] アジュバント空間の解析を可能にする統合データベース (2016)
  • 著者名/発表者名: 水口賢司
  • 学会等名: 第9回次世代アジュバント研究会
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2016-01-19
  • 招待講演
• [学会発表] Analysis of serum microRNA expression and cytokine production profiles for understanding febrile episodes after vaccination (2016)
  • 著者名/発表者名: Natsume-Kitatani Y., Ozasa K., Nakayama T., Ishii K., Mizuguchi K.
  • 学会等名: 第９回次世代アジュバント研究会
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2016-01-19
• [学会発表] 健康な日本人の生活習慣と腸管免疫・腸内細菌データベースの構築：バイオインフォマティクスの視点から (2016)
  • 著者名/発表者名: 水口賢司
  • 学会等名: シリーズ「薬づくりの新しいR&Dモデルを探る」第１１回「薬づくりと健康食品開発を結ぶ」
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2016-01-15
  • 招待講演
• [学会発表] 医薬基盤・健康・栄養研究所の創薬支援データベースとツール (2015)
  • 著者名/発表者名: 水口賢司, 坂手龍一, 深川明子, 五十嵐芳暢, 陳怡安, 長尾知生子
  • 学会等名: 第38回日本分子生物学会年会 第88回日本分子生化学会大会 合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2015-12-01
• [学会発表] データ統合と計算の融合による創薬研究 (2015)
  • 著者名/発表者名: 水口賢司
  • 学会等名: バイオスーパーコンピューティング神戸2015
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2015-11-30
  • 招待講演
• [学会発表] 計算システム生物学によるポリファーマコロジーへのアプローチと新たな合理的創薬パラダイム (2015)
  • 著者名/発表者名: 水口賢司
  • 学会等名: CBI学会2015年大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2015-10-28
  • 招待講演
• [学会発表] The integration of biological data and its application to drug discovery (2015)
  • 著者名/発表者名: Tsuchiya Y., Prathipati P., Mizuguchi K.
  • 学会等名: CBI学会2015年大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2015-10-27
• [学会発表] A systems biology framework for the identification of the molecular basis of immune adjuvanticity (2015)
  • 著者名/発表者名: Prathipati P., Aoshi T.,Igarashi K., Mizuguchi K.
  • 学会等名: 9th Vaccine & ISV Congress
  • 発表場所: ソウル（韓国）
  • 年月日: 2015-10-18
  • 国際学会
• [学会発表] A systems level analysis of adjuvant transcriptomes for biomarker and target discovery (2015)
  • 著者名/発表者名: Tripathi L. P., .Ito J., Aoshi T., Ishii J. K., Mizuguchi K.
  • 学会等名: 9th Vaccine & ISV Congress
  • 発表場所: ソウル（韓国）
  • 年月日: 2015-10-18
  • 国際学会
• [学会発表] 創薬・疾患研究のためのデータベース検索システム Sagace & Toxygates (2015)
  • 著者名/発表者名: 長尾知生子, 五十嵐芳暢, 森田瑞樹, 陳怡安, 深川明子, 坂手龍一, 水口賢司
  • 学会等名: トーゴーの日シンポジウム2015
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2015-10-06
• [学会発表] トキシコゲノミクスデータの統合化を目指したOpen TG-GATEsの再RDF化について (2015)
  • 著者名/発表者名: 五十嵐芳暢, 伊藤真和吏, 川島秀一, 山田弘, 水口賢司
  • 学会等名: トーゴーの日シンポジウム2015
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2015-10-06
• [学会発表] 創薬・疾患研究への活用に向けたデータベース連携 (2015)
  • 著者名/発表者名: 坂手龍一, 深川明子, 水口賢司, 山田弘, 塩谷恭子, 松田潤一郎, 宮本恵宏, 梅垣敬三, 小原有弘, 松山晃文
  • 学会等名: トーゴーの日シンポジウム2015
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2015-10-05
• [学会発表] 創薬の初期研究における統合データウェアハウスTargetMine (2015)
  • 著者名/発表者名: 陳怡安，ロケシュ テリパチ，水口賢司
  • 学会等名: トーゴーの日シンポジウム2015
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2015-10-05
• [学会発表] Ligand-induced conformational changes in STING are essential for its signal transduction（リガンド結合による構造変化がもたらすSTINGシグナル伝達系への影響） (2015)
  • 著者名/発表者名: 土屋裕子，水口賢司
  • 学会等名: 第53回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 金沢
  • 年月日: 2015-09-13
• [学会発表] 計算生物学による分子認識と生体応答の予測：がん創薬に向けて (2015)
  • 著者名/発表者名: 水口賢司
  • 学会等名: 第２回 次世代がんインフォマティクス研究会
  • 発表場所: 岡山
  • 年月日: 2015-09-11
  • 招待講演
• [学会発表] Effective characterisation of adjuvant transcriptomes for biomarker and target discovery (2015)
  • 著者名/発表者名: Tripathi L.P., Ito J., Aoshi T., Ishii J. K., Mizuguchi K.
  • 学会等名: The 12th [BC]2 - the Basel Computational Biology Conference
  • 発表場所: バーゼル（スイス）
  • 年月日: 2015-06-07
  • 国際学会
• [学会発表] Pose and affinity predictions of fXa,SYK and TrmD ligands for CSAR-2014: application of an integrated ligand and protein structure based approach (2015)
  • 著者名/発表者名: Prathipati P., Mizuguchi K.
  • 学会等名: JCUP VI, OpenEye Scientific Software meeting
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2015-06-04
• [学会発表] データウェアハウスによる創薬関連データ統合と解析の実際 (2015)
  • 著者名/発表者名: 水口賢司
  • 学会等名: 第361回 CBI学会研究講演会
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2015-04-24
  • 招待講演
• [学会発表] 計算生物学によるシステムの理解から創薬へ (2014)
  • 著者名/発表者名: 水口賢司
  • 学会等名: 第２回 関西ライフサイエンス・リーディングサイエンティストセミナー
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2014-12-15
  • 招待講演
• [学会発表] 計算生物学による創薬を目指して (2014)
  • 著者名/発表者名: 水口賢司
  • 学会等名: IPABシンポジウム
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2014-12-05
• [学会発表] 創薬・疾患研究のたまのビッグデータ探索 (2014)
  • 著者名/発表者名: 水口賢司、 坂手龍一、深川明子、五十嵐芳暢、長尾知生子、陳怡安、伊藤真和吏
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2014-11-25
• [学会発表] 乳癌細胞増殖の分子機構解明から創薬へ：タンパク質構造と相互作用予測による主導 (2014)
  • 著者名/発表者名: 水口賢司
  • 学会等名: CBI学会2014年大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2014-10-29
• [学会発表] Adjuvant Database Project: comprehensive transcriptome analysis in animal models (2014)
  • 著者名/発表者名: Aoshi T., Nakatsu N., Igarashi Y., Wijaya E., Ito J., Kishishita N., Standley D., Yamada H., Mizuguchi K., Ishii K.,
  • 学会等名: Keystone Symposium on The Modes of Action of Vaccine Adjuvants
  • 発表場所: Seattle, Washington, USA,
  • 年月日: 2014-10-08
• [学会発表] アジュバントデータベースの開発とトキシコゲノミクスデータの統合に向けて (2014)
  • 著者名/発表者名: 水口賢司、五十嵐芳暢、山田弘、石井健、Nystrom J.,
  • 学会等名: トーゴ－の日シンポジウム
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2014-10-05
• [学会発表] 創薬・疾患研究のための生物資源・疫学研究データベースの開発 (2014)
  • 著者名/発表者名: 水口賢司、深川明子、坂手龍一、山田弘、増井徹、塩谷恭子、松田潤一郎、宮本恵宏、松山晃文
  • 学会等名: トーゴーの日シンポジウム
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2014-10-05
• [学会発表] Integrated pathway clusters for gene set analysis and target prioritization (2014)
  • 著者名/発表者名: 陳怡安, Tripathi L., Dessailly B.H., Nystrom J., Ahmad S., 水口賢司,
  • 学会等名: トーゴーの日シンポジウム2014
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2014-10-05
• [学会発表] 創薬・疾患研究のためのデータベース横断検索システム Sagace (2014)
  • 著者名/発表者名: 伊藤真和吏, 森田瑞樹, 五十嵐芳暢, 陳怡安, 長尾知生子, 深川明子, 坂手龍一, 水口賢司
  • 学会等名: トーゴーの日シンポジウム2014
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2014-10-05
• [学会発表] Elucidation of antigen recognition by antibodies toward the development of a method for antibody design (2014)
  • 著者名/発表者名: Mizuguchi K., Tsuchiya Y.
  • 学会等名: 生命医薬情報学連合大会2014年大会
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2014-10-02
• [学会発表] 抗体デザイン手法の開発に向けた抗原認識機構の解明 (2014)
  • 著者名/発表者名: 水口賢司、土屋裕子
  • 学会等名: 第52回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 札幌
  • 年月日: 2014-09-27
• [学会発表] The Potential of Serum miRNA Signatures to Understand the Immune Responses to Influenza Vaccines Diseases, Systems Biology of Infectious Diseases (2014)
  • 著者名/発表者名: Mizuguchi K., Ito J., Ishii J.
  • 学会等名: Systems Biology of Infectious Diseases,
  • 発表場所: Seattel, WA,USA
  • 年月日: 2014-08-18
• [学会発表] Methods for the Integration of structure based and ligand based approaches to screen ‘Yes kinase inhibitors’ (2014)
  • 著者名/発表者名: Prathipati P., Ito J., Tsuchiya Y., Mizuguchi K.
  • 学会等名: Level-5
  • 発表場所: Tokyo
  • 年月日: 2014-07-18
  • 招待講演
• [学会発表] Tosygates トキシコゲノミクスデータ解析プラットフォームの実装 (2014)
  • 著者名/発表者名: 水口賢司,五十嵐芳暢, Nystrom J., 森田瑞樹，伊藤真和吏，中津則之，山田弘
  • 学会等名: 第41回日本毒性学会学術年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2014-07-03
• [学会発表] 抗体デザイン手法の開発に向けた抗原認識機構の解明 (2014)
  • 著者名/発表者名: 水口賢司、土屋裕子
  • 学会等名: 第14回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2014-06-26
• [学会発表] Kotai Antibody Builder: Automated, high-resolution structural modeling of antibodies (2014)
  • 著者名/発表者名: Yamashita K., Ikeda K., Sarmiento J., Liang S., Tsuchiya Y., Mizuguchi K., Higo J., Nakamura H., Shirai H., Standley D. M.
  • 学会等名: 第14回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2014-06-26
• [学会発表] Identification Of Anti-Myxovirus Resistance Protein-1 Autoantibody As A Specific Marker For Idiopathic Nonspecific Interstitial Pneumonia (2014)
  • 著者名/発表者名: Mizuguchi K., Kida H., Nishikawa H., Tripathis L., Ihara S., Arai T., Hirose M., Tada Y., Suenaga T., Mori M., Yano Y., Arase H., Sakaguchi S., Inoue Y., Kumanogoh A.
  • 学会等名: EULAR 2014
  • 発表場所: Paris
  • 年月日: 2014-06-12
• [学会発表] Toxygates: Applying a Toxicology Software Platform to Wheat 'omics (2014)
  • 著者名/発表者名: Igarashi Y., Morita M., Ito M., Nakatsu N., Yamada H., Mizuguchi K.
  • 学会等名: Plant&Genome Asia 2014
  • 発表場所: Singapore
  • 年月日: 2014-05-19
• [学会発表] バイオインフォマティクスによるシステムの理解から創薬へ (2014)
  • 著者名/発表者名: 水口賢司
  • 学会等名: 徳島大学 疾患プロテオゲノム研究センター
  • 発表場所: 徳島
  • 年月日: 2014-05-16
  • 招待講演
• [学会発表] Computational and systems approaches to early stage drug discovery (2014)
  • 著者名/発表者名: 水口賢司
  • 学会等名: 中国科学院 上海生命科学研究院
  • 発表場所: 上海（中国）
  • 年月日: 2014-05-06
  • 招待講演
• [学会発表] TargetMine, a data warehouse system for target discovery
  • 著者名/発表者名: 陳怡安, Tripathi L., 水口賢司
  • 学会等名: トーゴーの日シンポジウム2013
  • 発表場所: 時事通信ホール(東京都)
• [学会発表] A random-forest based method that can predict detailed enzyme functions and also identify specificity determining residues
  • 著者名/発表者名: 長尾知生子, 長野希美, 水口賢司
  • 学会等名: CBI学会2013大会
  • 発表場所: タワーホール船堀（東京都）
• [学会発表] Applications of an integrated data warehouse system to investigate complex biological systems
  • 著者名/発表者名: 陳怡安, Tripathi L., 水口賢司
  • 学会等名: CBI学会2013大会
  • 発表場所: タワーホール船堀（東京都）
• [学会発表] Data integration and protein network analysis for early stage drug discovery
  • 著者名/発表者名: 水口賢司
  • 学会等名: Structural Life Science 7th International Conference on Structural Genomics (ICSG2013-SLS)
  • 発表場所: 京王プラザホテル（札幌）
  • 招待講演
• [備考] TargetMineトップページ
  • URL: http://targetmine.mizuguchilab.org
• [備考] TargetMine解析ワークフロー機能
  • URL: http://targetmine.mizuguchilab.org/auxiliary-toolkit
• [備考] TargetMineパスウェイクラスタリング機能
  • URL: http://targetmine.mizuguchilab.org/integrated-pathway-clusters
• [備考] PSOPIA - アミノ酸配列のみからの相互作用タンパク質の予測プログラム
  • URL: http://mizuguchilab.org/PSOPIA/
• [備考] Research | Mizuguchi Laboratory
  • URL: http://mizuguchilab.org/research
• [備考] Mizuguchi Lab Research
  • URL: http://mizuguchilab.org/research
• [備考] Mizuguchi Lab, Research
  • URL: http://mizuguchilab.org/research