Hfq結合型小分子RNAの機能構造の解析

• 研究課題/領域番号: 25440012
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 分子生物学
• 研究機関: 鈴鹿医療科学大学
• 研究代表者: 森田 鉄兵 鈴鹿医療科学大学, 薬学部, 助手 (10444366)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円); 2015年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2014年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2013年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
• キーワード: 小分子RNA / 転写後制御 / Hfq / 大腸菌

研究成果の概要

本課題研究は、大腸菌小分子RNA（sRNA）の機能構造を明らかにすることを目的にした。幅広い生物に存在するsRNAと同様に、大腸菌sRNAは、mRNAと塩基対を形成することによりmRNAを抑制する。sRNA/mRNA間の塩基対の形成は、Hfqタンパク質により促進される。本課題研究のもっとも大きな成果は、Hfqとの機能的結合において、sRNAのHfq結合領域が3’末端に位置することの重要性を示したことである。また、sRNAの合成が誘導されるストレス条件で、転写終結効率が上昇していることを明らかにした。これらのことは、sRNA合成機構の理解に貢献する。

研究成果

• [雑誌論文] Insights into transcription termination of Hfq-binding sRNAs of Escherichia coli and characterization of read through products (2015)
  • 著者名/発表者名: Teppei MORITA, Masaki UEDA, Kento KUBO, and Hiroji AIBA
  • 雑誌名: RNA 巻: 21 号: 8 ページ: 1490-1501
  • DOI: 10.1261/rna.051870.115
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [学会発表] 大腸菌小分子RNAによるmRNA抑制に関わる因子の探索系の構築 (2015)
  • 著者名/発表者名: 森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: 第52回日本細菌学会中部支部総会
  • 発表場所: 名古屋市立大学医学部（愛知）
  • 年月日: 2015-10-23
• [学会発表] 大腸菌Hfq結合性小分子RNA遺伝子の転写終結、及び転写終結領域の読み飛ばし産物の解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 森田鉄兵、上田真煕、久保建人、饗場弘二
  • 学会等名: 第17回日本RNA学会年会
  • 発表場所: ホテルライフォート札幌（北海道）
  • 年月日: 2015-07-15
• [学会発表] Modulation of transcription termination of Hfq-binding sRNA genes and nature of 3’ extended sRNAs (2015)
  • 著者名/発表者名: 森田鉄兵
  • 学会等名: 第88回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 長良川国際会議場（岐阜県岐阜市）
  • 年月日: 2015-03-26 – 2015-03-28
• [学会発表] Modulation of transcription termination of Hfq-binding sRNA genes and nature of 3’ extended sRNAs (2015)
  • 著者名/発表者名: 森田鉄兵、上田真煕、久保建人、饗場弘二
  • 学会等名: 第9回長野ミーティング：生物資源の有効利用を目指して
  • 発表場所: ラフォーレ倶楽部白馬八方（長野県白馬村）
  • 年月日: 2015-01-25 – 2015-01-28
• [学会発表] Biotin修飾RNAとstreptavidin磁気ビーズを用いたin vitro RNA結合実験系の構築 (2015)
  • 著者名/発表者名: 上田真煕、久保建人、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: 第9回長野ミーティング：生物資源の有効利用を目指して
  • 発表場所: ラフォーレ倶楽部白馬八方（長野県白馬村）
  • 年月日: 2015-01-25 – 2015-01-27
• [学会発表] 大腸菌sRNAの生合成過程における転写終結の重要性 (2014)
  • 著者名/発表者名: 森田鉄兵、松井香予、近藤良樹、饗場弘二
  • 学会等名: 第8回日本ゲノム微生物学会若手の会研究会
  • 発表場所: うきん研修所富士センター（静岡県駿東郡）
  • 年月日: 2014-09-28 – 2014-09-29
• [学会発表] sRNAの機能構造から明らかになったsRNA遺伝子の新規発現制御機構 (2014)
  • 著者名/発表者名: 森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: 第67回日本細菌学会九州支部会
  • 発表場所: 城山観光ホテル（鹿児島市）
  • 年月日: 2014-09-05 – 2014-09-06
• [学会発表] 大腸菌小分子RNA遺伝子の転写終結制御 (2014)
  • 著者名/発表者名: 森田鉄兵、近藤良樹、松井香予、饗場弘二
  • 学会等名: 第8回細菌学若手コロッセウム
  • 発表場所: ホテルニセコ（北海道虻田郡）
  • 年月日: 2014-08-06 – 2014-08-08
• [学会発表] 大腸菌小分子RNA遺伝子の転写終結制御 (2014)
  • 著者名/発表者名: 森田鉄兵、近藤良樹、松井香予、饗場弘二
  • 学会等名: 第16回日本RNA学会年会
  • 発表場所: ウインクあいち（愛知県名古屋市）
  • 年月日: 2014-07-23 – 2014-07-25
• [学会発表] 大腸菌小分子RNA遺伝子の転写終結制御 (2014)
  • 著者名/発表者名: 森田鉄兵、近藤良樹、松井香予、饗場弘二
  • 学会等名: 第11回21世紀大腸菌研究会
  • 発表場所: ホテル大観（岩手県盛岡市）
  • 年月日: 2014-06-05 – 2014-06-06
• [学会発表] Functional organization of Hfq-binding small RNAs (2014)
  • 著者名/発表者名: 〇森田鉄兵
  • 学会等名: 第8回長野ミーティング：生物資源の有効利用を目指して
  • 発表場所: 長野、ラフォーレ倶楽部白馬八方
• [学会発表] Molecular events at Rho-independent terminator of sRNA gene and the nature of 3’ extended sRNAs in intact cells. (2013)
  • 著者名/発表者名: 〇Teppei MORITA, Hironori Otaka, Hirokazu Ishikawa & Hiroji AIBA.
  • 学会等名: 3rd International Conference on Regulating with RNA in Bacteria
  • 発表場所: Wurzburg, Germany.
• [学会発表] 大腸菌小分子RNA遺伝子における転写終結、及び3’末端が伸長したsRNAの機能解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 〇森田鉄兵、大鷹弘紀、石川博一、饗場弘二
  • 学会等名: 第10回21世紀大腸菌研究会
  • 発表場所: 静岡、ラフォーレ修善寺
• [学会発表] 大腸菌小分子RNA遺伝子における転写終結、及び3’末端が伸長したsRNAの機能解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 〇森田鉄兵、大鷹弘紀、石川博一、饗場弘二
  • 学会等名: 第15回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 愛媛、ひめぎんホール
• [学会発表] 大腸菌小分子RNA遺伝子における転写終結、及び3’末端が伸長したsRNAの機能解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 〇森田鉄兵、大鷹弘紀、石川博一、饗場弘二
  • 学会等名: 第7回細菌学若手コロッセウム
  • 発表場所: 広島、広島エアポートホテル
• [学会発表] 大腸菌小分子RNA遺伝子における転写終結、及び3’末端が伸長したsRNAの機能解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 〇森田鉄兵、大鷹弘紀、石川博一、饗場弘二
  • 学会等名: 第7回日本ゲノム微生物学会
  • 発表場所: 静岡、ろうきん研修所富士センター