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希少糖生産酵素群の基質複合体のX線構造に基づく包括的な触媒反応機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 25440028
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 構造生物化学
研究機関香川大学

研究代表者

吉田 裕美  香川大学, 総合生命科学研究センター, 准教授 (10313305)

研究分担者 神鳥 成弘  香川大学, 総合生命科学研究センター, 教授 (00262246)
吉原 明秀  香川大学, 希少糖研究センター, 助教 (40548765)
連携研究者 何森 健  香川大学, 農学部, 名誉教授 (80035998)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円)
2015年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2014年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2013年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
キーワードX線結晶構造解析 / 単糖異性化酵素 / 希少糖 / L-リボースイソメラーゼ / D-タガトース 3-エピメラーゼ / 触媒反応機構 / 酵素・基質複合体 / 微小重力環境タンパク質結晶化 / X線結晶解析 / L-リボースイソメラーゼ
研究成果の概要

天然に微量にしか存在しない「希少糖」の生産に関与する単糖異性化酵素について、X線結晶解析により基質複合体構造の決定、触媒反応機構の解明に関する研究を行った。L-リボースとL-リブロース間の異性化反応を触媒する、希少糖生産酵素Acinetobacter sp.由来L-リボースイソメラーゼ(L-RI)、Cellulomonas parahominis由来L-RIの構造を決定し、それぞれの野生型および変異酵素における複数の基質複合体構造から、L-RIの糖環開環機構を含めた触媒反応機構を提唱し、L-RIのホモ四量体構造は酵素の分子構造の安定性に関与し、酵素活性には不可欠であることを明らかにした。

報告書

(4件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2016 2015 2014 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (9件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Essentiality of tetramer formation of Cellulomonas parahominis L-ribose isomerase involved in novel L-ribose metabolic pathway.2015

    • 著者名/発表者名
      Yuji Terami, Hiromi Yoshida, Keiko Uechi, Kenji Morimoto, Goro Takata, Shigehiro Kamitori
    • 雑誌名

      Applied Microbiology and Biotechnology

      巻: - 号: 15 ページ: 6303-6313

    • DOI

      10.1007/s00253-015-6417-4

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] X-ray structure of a novel L-ribose isomerase acting on a non-natural sugar L-ribose as its ideal substrate.2014

    • 著者名/発表者名
      Yoshida H., Yoshihara A., Teraoka M., Terami Y., Takata G., Izumori K., Kamitori S.
    • 雑誌名

      FEBS J.

      巻: 281 号: 14 ページ: 3150-3164

    • DOI

      10.1111/febs.12850

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 希少糖生産酵素Arthrobacter 属由来 D-プシコース 3- エピメラーゼの結晶化およびX 線結晶解析2016

    • 著者名/発表者名
      吉田裕美、吉原明秀、大谷耕平、秋光和也、何森健、神鳥成弘
    • 学会等名
      2016年度農芸化学会大会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター、札幌
    • 年月日
      2016-03-29
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 宇宙空間で得られた希少糖生産酵素D-tagatose 3-epimerase 変異酵素の結晶とデオキシ希少糖との複合体構造2015

    • 著者名/発表者名
      吉田裕美,吉原明秀,田仲広明,伊中浩治,古林直樹,山田貢, 太田和敬, 何森健,神鳥成弘
    • 学会等名
      第15回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      あわぎんホール、徳島
    • 年月日
      2015-06-24
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 希少糖生産酵素Pseudomonas cichorii D-タガトース 3-エピメラーゼとデオキシ希少糖との複合体のX線結晶解析2015

    • 著者名/発表者名
      吉田裕美,吉原明秀,石井知彦,何森健,神鳥成弘
    • 学会等名
      第56回日本生化学会中国・四国支部例会
    • 発表場所
      島根大学大学会館 (松江キャンパス)、松江
    • 年月日
      2015-05-30
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 希少糖生産酵素Pseudomonas cichorii由来 D-タガトース 3-エピメラーゼの変異酵素を用いた糖アルコールおよびデオキシ希少糖との複合体構造解析2015

    • 著者名/発表者名
      吉田裕美,吉原明秀,石井 知彦,何森健,神鳥成弘
    • 学会等名
      2015年度農芸化学会大会
    • 発表場所
      岡山大学(岡山)
    • 年月日
      2015-03-29
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] Cellulomonas parahominis 由来L-リボースイソメラーゼの基質複合体構造解析および四量体形成の必要性の解明2015

    • 著者名/発表者名
      寺見 優司、上地 敬子、森本 兼司、吉田 裕美、神鳥 成弘、高田 悟郎
    • 学会等名
      2015年度農芸化学会大会
    • 発表場所
      岡山大学(岡山)
    • 年月日
      2015-03-27
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] X-ray structure analysis of Acinetobacter sp. L-ribose isomerase for metabolizing non-natural sugar L-ribose2014

    • 著者名/発表者名
      Hiromi Yoshida, Akihide Yoshihara, Misa Teraoka, Yuji Terami, Goro Takata, Ken Izumori and Shigehiro Kamitori
    • 学会等名
      FEBS-EMBO 2014
    • 発表場所
      Paris (France)
    • 年月日
      2014-09-02
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] Crystal structure of L-ribose isomerase from Cellulomonas parahominis MB4262014

    • 著者名/発表者名
      Yuji Terami, Hiromi Yoshida, Kiko Uechi, Goro Takata, Shigehiro Kamitori
    • 学会等名
      23rd Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography (IUCr2014)
    • 発表場所
      Montreal (Canada)
    • 年月日
      2014-08-07
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] 宇宙空間を利用した希少糖生産酵素の結晶化2014

    • 著者名/発表者名
      吉田裕美,吉原明秀,寺岡美沙,林順司,田仲広明,伊中浩治,太田和敬, 何森健,神鳥成弘
    • 学会等名
      第14回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      ワークピア横浜、横浜産貿ホールマリネリア(横浜)
    • 年月日
      2014-06-25
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] 希少糖生産酵素Acinetobacter sp.由来 L-リボースイソメラーゼのX線結晶構造解析

    • 著者名/発表者名
      吉田裕美,吉原明秀,寺岡美沙,何森健,神鳥成弘
    • 学会等名
      2014年度農芸化学会大会
    • 発表場所
      明治大学(生田)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [備考] 香川大学総合生命科学研究センター分子構造解析研究部門ホームページ

    • URL

      http://www.med.kagawa-u.ac.jp/~xraylab/

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

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