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分岐年代推定に関わる諸問題

研究課題

研究課題/領域番号 25440219
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 生物多様性・分類
研究機関統計数理研究所

研究代表者

長谷川 政美  統計数理研究所, 統計思考院, 名誉教授 (60011657)

研究分担者 足立 淳  統計数理研究所, データ科学研究系, 准教授 (30370092)
連携研究者 米澤 隆弘  復旦大学, 生命科学学院, 副教授 (90508566)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
2015年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2014年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2013年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワード分岐年代推定 / 分子系統学 / 古顎類 / エピオルニス / 古代DNA解析 / ゴンドワナ超大陸 / エピオルニス科 / 分岐年代 / 二ホンツキノワグマ / アジアクロクマ / 真獣類 / 古代DNA / 種サンプリング密度 / ベイズ法 / ロバストな推定 / ゲノム / 化石証拠 / 年代制約
研究成果の概要

ダチョウなど古顎類鳥類はゴンドワナ大陸起源だと考えられてきた。われわれはマダガスカルの巨大絶滅鳥類エピオルニスの古代DNA解析を行い、これまで蓄積されてきた古顎類のDNAデータとあわせて系統・分岐年代解析をした結果、従来とは違った仮説を得た。リトルニスという古顎類の古い化石が北半球で見つかっているが、われわれの分子系統樹の枠組みに当てはめると、古顎類系統樹の根元に位置づけられる。このことから、北半球で進化した古顎類が、北米から南米に渡り、当時陸続きであった南極、オーストラリアに渡ったと考えられる。その後、これらの大陸とは分離していたマダガスカルやニュージーランドにも海を越えて渡った。

報告書

(4件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2016 2015 2014 2013 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 2件、 査読あり 7件、 オープンアクセス 4件、 謝辞記載あり 4件) 図書 (1件)

  • [国際共同研究] 復旦大学生命科学学院(中国)

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [雑誌論文] Cretaceous origin of the giant rhinoceros beetles (Dynastini; Coleoptera) and the correlation of their evolution with Pangean breakup2016

    • 著者名/発表者名
      Haofei Jin, Takahiro Yonezawa, Yang Zhong, Hirohisa Kishino, Masami Hasegawa
    • 雑誌名

      Genes & Genetic Systems

      巻: 0 ページ: 0-0

    • NAID

      130005450123

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Phylogeographic and demographic analysis of the Asian black bear (Ursus thibetanus) based on mitochondrial DNA2015

    • 著者名/発表者名
      Jiaqi Wu, Naoki Kohno, Shuhei Mano, Yukio Fukumoto, Hideyuki Tanabe, Masami Hasegawa, Takahiro Yonezawa
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 10 (9) 号: 9 ページ: e0136398-e0136398

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0136398

    • NAID

      120006667793

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Importance of synonymous substitutions under dense taxon sampling and appropriate modeling in reconstructing the mitogenomic tree of Eutheria2014

    • 著者名/発表者名
      Wu, J., Hasegawa, M., Zhong, Y., Yonezawa, T.
    • 雑誌名

      Genes & Genetic Systems

      巻: 89 号: 5 ページ: 237-251

    • DOI

      10.1266/ggs.89.237

    • NAID

      130005060734

    • ISSN
      1341-7568, 1880-5779
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Polyphyletic origins of schizothoracine fish (Cyprinidae, Osteichthyes) and adaptive evolution in their mitochondrial genomes2014

    • 著者名/発表者名
      Yonezawa, T., Hasegawa, M., Zhong, Y.,
    • 雑誌名

      Genes & Genetic Systems

      巻: 89 号: 4 ページ: 187-191

    • DOI

      10.1266/ggs.89.187

    • NAID

      130004750048

    • ISSN
      1341-7568, 1880-5779
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Extreme nearly neutral evolution in mitochondrial genomes of laboratory mouse strains2014

    • 著者名/発表者名
      T. Yonezawa, M. Hasegawa
    • 雑誌名

      Gene

      巻: 534 号: 2 ページ: 444-338

    • DOI

      10.1016/j.gene.2013.08.022

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Ancestral polymorphisms and sex-biased migration shaped the demographic history of brown bears and polar bears2013

    • 著者名/発表者名
      Shigeki Nakagome
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 8(11): e78813 号: 11 ページ: 1-7

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0078813

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Domestication process of the goat revealed by an analysis of the nearly complete mitochondrial protein-encoding genes2013

    • 著者名/発表者名
      K. Nomura, T. Yonezawa, S. Mano, S. Kawakami, A.M. Shedlock, M. Hasegawa, T. Amano
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 8 (8) 号: 8 ページ: e67775-e67775

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0067775

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [図書] 系統樹をさかのぼって見えてくる進化の歴史2014

    • 著者名/発表者名
      長谷川政美
    • 総ページ数
      192
    • 出版者
      ベレ出版
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書

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公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

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