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性染色体ゲノムの比較によるパパイヤ性決定遺伝子の探索

研究課題

研究課題/領域番号 25450004
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 遺伝育種科学
研究機関信州大学

研究代表者

松村 英生  信州大学, 学術研究院繊維学系, 准教授 (40390885)

連携研究者 浦崎 直也  沖縄県農業研究センター, 研究企画班, 上席主任研究員 (20504591)
太郎良 和彦  沖縄県農業研究センター, 研究企画班, 主任研究員 (10504772)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円)
2015年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2014年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2013年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワード性決定 / 性染色体 / ゲノム解析 / MADS-box / パパイヤ / MADS box / アグロインフィルトレーション / 遺伝子発現解析 / MADS-boxタンパク質 / DNA多型
研究成果の概要

三性異株であるパパイヤについてその性決定機構を解明すべく、性染色体のゲノム配列の比較解析を行った。YおよびYh染色体のゲノム配列を独自に解析して両配列の比較を行った結果、遺伝子領域に構造違いが見られたのはMADS-boxドメインを有するSVP-like遺伝子のみであった。Yh染色体上の同遺伝子はトランスポゾン挿入が見られ、Y染色体上の遺伝子と比較するとその産物はMADS-boxドメインが欠損していた。発現解析や一過的発現解析から、本遺伝子がパパイヤにおける性決定に関わる可能性が示唆された。またX染色体上の遺伝子発現解析を雌/両性間で比較した結果、遺伝子量補正が働いていることが示された。

報告書

(4件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2016 2015 2014 2013

すべて 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 1件、 査読あり 3件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (4件)

  • [雑誌論文] SuperSAGE as an analytical tool for host and viral gene expression.2015

    • 著者名/発表者名
      Matsumura H, Krueger DH, Kahl G, Terauchi R.
    • 雑誌名

      Methods Mol Biol.

      巻: 1236 ページ: 181-195

    • DOI

      10.1007/978-1-4939-1743-3_14

    • ISBN
      9781493917426, 9781493917433
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Genome sequence comparison reveals a candidate gene involved in male/hermaphrodite differentiation in papaya (Carica papaya) trees2015

    • 著者名/発表者名
      Hiroki Ueno, Naoya Urasaki, Satoshi Natsume, Kentaro Yoshida, Kazuhiko Tarora, Ayano Shudo, Ryohei Terauchi, Hideo Matsumura
    • 雑誌名

      Molecular Genetics and Genomics

      巻: 290 号: 2 ページ: 661-670

    • DOI

      10.1007/s00438-014-0955-9

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] 次世代シーケンサーを利用したタグによる発現解析2013

    • 著者名/発表者名
      松村英生、寺内良平
    • 雑誌名

      生物科学

      巻: 64 ページ: 151-158

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 属間雑種(パパイア×マウンテンパパイア)の戻し交配個体における性型と倍数性2016

    • 著者名/発表者名
      太郎良和彦、安田慶次, 河野伸二, 上野広樹, 松村英生, 浦崎直也
    • 学会等名
      日本育種学会第129回講演会
    • 発表場所
      横浜市立大学(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2016-03-21
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] パパイヤ X 染色体上の遺伝子における遺伝子量効果についての評価2015

    • 著者名/発表者名
      上野 広樹,浦崎 直也,太郎良 和彦 ,松村 英生
    • 学会等名
      日本育種学会第127回講演会
    • 発表場所
      玉川大学(東京都町田市)
    • 年月日
      2015-03-21 – 2015-03-22
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] パパイア性決定領域上の遺伝子におけるトランスポゾン挿入2014

    • 著者名/発表者名
      上野広樹、浦崎直也、吉田健太郎、夏目俊、太郎良和彦、首藤亜耶乃、寺内良平、松村英生
    • 学会等名
      日本育種学会第126回講演会
    • 発表場所
      南九州大学都城キャンパス(宮崎県都城市)
    • 年月日
      2014-09-26 – 2014-09-27
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] パパイアYh、Y染色体上の遺伝子の比較解析2014

    • 著者名/発表者名
      上野広樹、浦崎直也、吉田健太朗、夏目俊、太郎良和彦、首藤亜耶乃、寺内良平、松村英生
    • 学会等名
      日本育種学会第125回講演会
    • 発表場所
      東北大学
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書

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公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

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