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花粉を飛散しないスギ品種を高精度で判定する技術の開発

研究課題

研究課題/領域番号 25450223
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 森林科学
研究機関国立研究開発法人 森林総合研究所

研究代表者

上野 真義  国立研究開発法人 森林総合研究所, 森林遺伝研究領域, チーム長 (40414479)

研究分担者 二村 典宏  国立研究開発法人森林総合研究所, 生物工学研究領域, 室長 (80343804)
連携研究者 森口 喜成  新潟大学, 自然科学系, 助教 (60644804)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
2015年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2014年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2013年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
キーワード遺伝マーカー / 針葉樹 / 表現型 / ゲノム / バイオインフォマティクス / 花粉症 / 形質 / スギ / 雄性不稔 / RNA-Seq / RAD-Seq / 遺伝的変異 / 連鎖解析
研究成果の概要

花粉の形成に異常があるために、正常な花粉を生産できないスギ(雄性不稔スギもしくは無花粉スギ)を利用して交配家系を作成し、家系の各個体について正常なスギ(可稔)なのか無花粉スギ(不稔)なのかを調べ、さらに可稔と不稔の個体間で特定のDNA配列を比較することで、個体の不可稔性を高精度で識別できるDNAマーカーの作成を行った。その結果、一つのマーカーは交配家系の99%について不可稔性を正しく判定できることが明らかになった。

報告書

(4件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2016 2015 2014 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 謝辞記載あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] A high-density linkage map with 2,560 markers and its application for the localization of the male-sterile genes ms3 and ms4 in Cryptomeria japonica D. Don2016

    • 著者名/発表者名
      Yoshinari Moriguchi, Kentaro Uchiyama, Saneyoshi Ueno, Tokuko Ujino-Ihara, Asako Matsumoto, Junji Iwai, Daisuke Miyajima, Maki Saito, Masaya Sato, Yoshihiko Tsumura
    • 雑誌名

      Tree Genetics and Genomes

      巻: 12

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] A simple allele-specific PCR marker for identifying male-sterile trees: Towards DNA marker-assisted selection in the Cryptomeria japonica breeding program2014

    • 著者名/発表者名
      Moriguchi Y, Ueno S, Saito M, Higuchi Y, Miyajima D, Itoo S, Tsumura Y
    • 雑誌名

      Molecular Breeding

      巻: 10 号: 4 ページ: 1069-1077

    • DOI

      10.1007/s11295-014-0743-z

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] DNAマーカーを用いた無花粉スギのピラミッディング育種2016

    • 著者名/発表者名
      森口喜成、内山憲太郎、上野真義、松本麻子、伊原徳子、岩井淳治、戸塚聡子、津村義彦
    • 学会等名
      第127回日本森林学会
    • 発表場所
      日本大学
    • 年月日
      2016-03-29
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 樹木種のゲノムワイド解析に向けたマーカー整備2016

    • 著者名/発表者名
      内山憲太郎、加藤珠理、上野真義、鈴木節子、須貝杏子、松本麻子
    • 学会等名
      第127回日本森林学会
    • 発表場所
      日本大学
    • 年月日
      2016-03-28
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Sugi genome resources2015

    • 著者名/発表者名
      Saneyoshi Ueno, Yoshinari Moriguchi, Kentaro Uchiyama, Tokuko Ujino-Ihara, Norihiro Futamura, Asako Matsumoto, Yoshihiko Tsumura
    • 学会等名
      ProCoGen final open conference
    • 発表場所
      Orleans, France
    • 年月日
      2015-11-29
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 森林樹木種における効率的なゲノムワイドマーカーの開発2015

    • 著者名/発表者名
      内山憲太郎、加藤珠理、上野真義、松本麻子
    • 学会等名
      森林遺伝育種学会第4回大会
    • 発表場所
      東京大学
    • 年月日
      2015-11-06
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] スギ雄性不稔遺伝子(ms-1~ ms-4)の連鎖地図上の位置の特定2015

    • 著者名/発表者名
      森口喜成,内山憲太郎,上野真義,伊原徳子,松本麻子,斎藤真己,岩井淳治,宮嶋大介,樋口有未,伊藤信治,佐藤雅哉,津村義彦
    • 学会等名
      日本育種学会第128回講演会
    • 発表場所
      新潟大学
    • 年月日
      2015-09-12
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [備考] Sugi Genome Database

    • URL

      https://www.ffpri.affrc.go.jp/labs/cjgenome/index.html

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書

URL: 

公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

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