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激減したマイワシ資源の3次元的な遺伝的多様性変化の解明

研究課題

研究課題/領域番号 25450292
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 水圏生産科学
研究機関国立研究開発法人水産総合研究センター

研究代表者

柳本 卓  国立研究開発法人水産総合研究センター, 中央水産研究所, 主任研究員 (30443386)

研究分担者 丹羽 洋智  国立研究開発法人・水産研究総合研究センター, 中央水産研究所, 主幹研究員 (60372083)
梨田 一也  国立研究開発法人・水産研究総合研究センター, 中央水産研究所, 主任研究員 (10371882)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
2015年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2014年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2013年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワードマイワシ / 遺伝的多様性 / 有効集団サイズ / コアレセント解析 / 集団構造 / コアレセントシミュレーション / メタ集団 / mtDNA / 年集団 / 多型 / コアレセントシュミレーション
研究成果の概要

mtDNAの塩基配列分析によりマイワシの日本海から太平洋にかけて広く水平的な遺伝的多様性について調べた。集団間には差がなく、日本周辺のマイワシは一つのメタ集団を形成していると考えられた。マイワシの主な産卵場所である土佐湾で1990年から2012年に採集された集団について、mtDNAの塩基配列分析を行った。経年的な遺伝的な差はみられなかった。資源が激減しているが、遺伝的な多様性に差はなかった。1990年代は数百万トンの漁獲量があり、2012年にはわずか数万トンであるが、遺伝的な多様性に減少を及ぼすほどではなかった。

報告書

(4件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (15件)

すべて 2016 2015 2014 2013

すべて 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 1件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 1件、 謝辞記載あり 6件) 学会発表 (9件)

  • [雑誌論文] Reproductive skew in Japanese sardine inferred from DNA sequences2016

    • 著者名/発表者名
      Niwa H, Nashida K, Yanagimoto, T.
    • 雑誌名

      ICES

      巻: 印刷中

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] マイワシmtDNA D-Loop領域の塩基配列の地理的変異について2016

    • 著者名/発表者名
      柳本 卓・丹羽洋智・梨田和也
    • 雑誌名

      DNA多型

      巻: 24

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] 資源の増減に伴うマイワシmtDNAの遺伝的多様性の変化について2015

    • 著者名/発表者名
      柳本 卓・丹羽洋智・梨田和也
    • 雑誌名

      DNA多型

      巻: 23 ページ: 89-91

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] パレート系統樹を有する海産魚介類集団のダイナミクス2015

    • 著者名/発表者名
      丹羽洋智
    • 雑誌名

      数理解析研究所講究録

      巻: 1937 ページ: 101-108

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] 資源の増減に伴うマイワシmtDNAの遺伝的多様性の変化について2015

    • 著者名/発表者名
      柳本  卓・丹羽洋智・梨田一也
    • 雑誌名

      DNA多型

      巻: 23

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Uncertainty in a measurement of density dependence on population fluctuations2014

    • 著者名/発表者名
      Hiro-Sato Niwa
    • 雑誌名

      Applied Mathematics

      巻: 5 ページ: 1108-1119

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] マイワシmtDNA D-Loop領域の塩基配列の地理的変異について2015

    • 著者名/発表者名
      柳本 卓・丹羽洋智・梨田一也
    • 学会等名
      日本DNA多型学会
    • 発表場所
      岡山
    • 年月日
      2015-11-19
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 卓越年級群の加入に伴う遺伝的多様性の低下2015

    • 著者名/発表者名
      丹羽洋智
    • 学会等名
      水産海洋学会
    • 発表場所
      釧路市
    • 年月日
      2015-10-11
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 資源の増減に伴うマイワシmtDNAの遺伝的多様性の変化について2014

    • 著者名/発表者名
      柳本  卓・丹羽洋智・梨田一也
    • 学会等名
      日本DNA多型学会第23回学術集会
    • 発表場所
      名古屋 ウインクあいち
    • 年月日
      2014-11-30
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] Poisson vs Pareto 型繁殖: DNA 多型情報に基づく加入過程の推測2014

    • 著者名/発表者名
      丹羽洋智・柳本 卓・梨田一也
    • 学会等名
      2014年度水産海洋学会研究発表大会
    • 発表場所
      横浜 中央水産研究所
    • 年月日
      2014-11-16
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] 土佐湾におけるニギス幼魚の初期成長に関する予備的考察2014

    • 著者名/発表者名
      梨田 一也
    • 学会等名
      2014年度水産海洋学会研究発表大会
    • 発表場所
      水産総合研究センター中央水産研究所
    • 年月日
      2014-11-15 – 2014-11-16
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] パレート系統樹を有する海産魚介類集団のダイナミクス2014

    • 著者名/発表者名
      丹羽洋智
    • 学会等名
      第11回 生物数学の理論とその応用
    • 発表場所
      京都大学数理解析研究所研
    • 年月日
      2014-09-16 – 2014-09-19
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] mtDNA D-Loop領域の塩基配列分析によるマイワシの集団構造について2014

    • 著者名/発表者名
      柳本 卓
    • 学会等名
      日本水産学会
    • 発表場所
      北海道大学
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] 個体群動態におけるbottleneckとsweepstakesがDNA配列に残す痕跡2014

    • 著者名/発表者名
      丹羽洋智
    • 学会等名
      日本生態学会
    • 発表場所
      広島国際会議場
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] コアレセント・シミュレーションによるマイワシ加入過程の検討2013

    • 著者名/発表者名
      丹羽洋智
    • 学会等名
      水産海洋学会
    • 発表場所
      京都大学
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書

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公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

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