日本在来牛および黒毛和種の比較解析による牛白血病感受性・抵抗性遺伝子の同定

• 研究課題/領域番号: 25450405
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 動物生産科学
• 研究機関: 国立研究開発法人理化学研究所
• 研究代表者: 竹嶋 伸之輔 国立研究開発法人理化学研究所, 分子ウイルス学特別研究ユニット, 研究員 (60342812)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円); 2015年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円); 2014年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円); 2013年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
• キーワード: 日本在来牛 / ウシ主要組織適合遺伝子複合体（BoLA) / 疾患感受性 / ゲノムリシークエンス / 牛白血病ウイルス / 口之島牛 / 次世代シークエンサー / 見島牛 / ウシ主要組織適合遺伝子複合体(BoLA) / CNTN3 / 主成分分析 / 牛白血病 / 主要組織適合抗原 / ターゲットリシークエンス / ウシゲノム / リシークエンス / 主要組織適合遺伝子複合体

研究成果の概要

黒毛和種の有する牛白血病感受性・抵抗性遺伝子と日本在来牛である口之島牛および見島牛の遺伝子領域を次世代シークエンサーを用いてリシークエンスし、その比較により疾患感受性遺伝子の起源を探った。12頭の口之島牛、11頭の見島牛および10頭の黒毛和種のBoLA領域のSNPを解析したところ、感受性BoLAハプロタイプは日本在来牛が有するハプロタイプと近縁の遺伝子であったが、抵抗性遺伝子遺伝子は共通性が乏しく、海外から流入してきた可能性が示唆された。

研究成果

• [雑誌論文] Development of a direct blood-based PCR system to detect BLV provirus using CoCoMo primers (2016)
  • 著者名/発表者名: Shin-nosuke Takeshima, Sonoko Watanuki, Hiroshi Ishizaki, Kazuhiro Matoba, Yoko Aida
  • 雑誌名: Archives of Virology 巻: 印刷中 号: 6 ページ: 1539-1546
  • DOI: 10.1007/s00705-016-2806-y
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A new genotype of bovine leukemia virus in South America identified by NGS-based whole genome sequencing and molecular evolutionary genetic analysis. (2016)
  • 著者名/発表者名: M Polat,# S-n Takeshima,# K Hosomichi, J Kim, T Miyasaka, K Yamada, M Arainga, T Murakami, Y Matsumoto, V de la Barra Diaz, CJ Panei, ET Gonzalez, M Kanemaki, M Onuma, G Giovambattista, and Y Aida. #,equal contribution
  • 雑誌名: Retrovirology 巻: 13(4) 号: 1 ページ: 4-4
  • DOI: 10.1186/s12977-016-0239-z
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] The diversity of major histocompatibility complex class II DRB1 gene in sheep breeds from Xinjiang, China (2015)
  • 著者名/発表者名: M. Polat, Y. Aida, S.-N. Takeshima, J. Aniwashi & M. Halik
  • 雑誌名: Tissue Antigens 巻: 85 号: 1 ページ: 50-57
  • DOI: 10.1111/tan.12480
  • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Characterization of bovine MHC class II DRB3 diversity in South American Holstein cattle populations. (2015)
  • 著者名/発表者名: S.-N. Takeshima#, G. Giovambattista#, N. Okimoto, Y. Matsumoto, A. Rogberg-Munoz, T. J. Acosta, M. Onuma and Y. Aida,#,equal contribution
  • 雑誌名: Tissue Antigens 巻: 86(6) 号: 6 ページ: 419-430
  • DOI: 10.1111/tan.12692
  • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Detection and molecular characterization of bovine leukemia virus in Philippine cattle. (2015)
  • 著者名/発表者名: Polat M, Ohno A, Takeshima SN, Kim J, Kikuya M, Matsumoto Y, Mingala CN, Onuma M, Aida Y.
  • 雑誌名: Arch Virol. 巻: 160 号: 1 ページ: 285-296
  • DOI: 10.1007/s00705-014-2280-3
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Risk factors associated with increased bovine leukemia virus proviralload in infected cattle in Japan from 2012 to 2014 (2015)
  • 著者名/発表者名: Ayumu Ohno, Shin-nosuke Takeshima, Yuki Matsumoto, Yoko Aida
  • 雑誌名: Virus Research 巻: 210 ページ: 283-290
  • DOI: 10.1016/j.virusres.2015.08.020
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] BLV-CoCoMo-qPCR-2: improvements to the BLV-CoCoMo-qPCR assay for bovine leukemia virus by reducing primer degeneracy and constructing an optimal standard curve. (2015)
  • 著者名/発表者名: Takeshima SN, Kitamura-Muramatsu Y, Yuan Y, Polat M, Saito S, Aida Y.
  • 雑誌名: Arch Virol. 巻: 160 号: 5 ページ: 1325-1332
  • DOI: 10.1007/s00705-015-2377-3
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Assessment of biodiversity in Chilean cattle using the distribution of major histocompatibility complex class II BoLA-DRB3 allele. (2015)
  • 著者名/発表者名: Takeshima SN, Miyasaka T, Matsumoto Y, Xue G, Diaz Vde L, Rogberg-Muñoz A, Giovambattista G, Ortiz M, Oltra J, Kanemaki M, Onuma M, Aida Y.
  • 雑誌名: Tissue Antigens 巻: 85 号: 1 ページ: 35-44
  • DOI: 10.1111/tan.12481
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] The great diversity of major histocompatibility complex class II genes in Philippine native cattle (2014)
  • 著者名/発表者名: Takeshima, S.N., Miyasaka, T., Polat, M., Kikuya, M., Matsumoto, Y., Mingala, C.N., Villanueva, M.A., Salces, A.J., Onuma, M. and Aida, Y
  • 雑誌名: Meta Gene 巻: 2 ページ: 176-190
  • DOI: 10.1016/j.mgene.2013.12.005
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Haplotype determination of the upstream regulatory region and the second exon of the BoLA-DRB3 gene in Holstein cattle (2014)
  • 著者名/発表者名: Goszczynski, D.E., Ripoli, M.V., Takeshima, S.N., Baltian, L., Aida, Y. and Giovambattista, G
  • 雑誌名: Tissue Antigens 巻: 83 号: 3 ページ: 180-183
  • DOI: 10.1111/tan.12293
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mechanisms of pathogenesis induced by bovine leukemia virus as a model for human T-cell leukemia virus. (2013)
  • 著者名/発表者名: Aida Y, Murakami H, Takahashi M, Takeshima SN.
  • 雑誌名: Front Microbiol 巻: 328 ページ: 1-11
  • DOI: 10.3389/fmicb.2013.00328
  • 査読あり
• [学会発表] 口之島牛のウシ主要組織適合遺伝子複合体領域（MHC)領域のゲノム多様性 (2014)
  • 著者名/発表者名: 竹嶋伸之輔、細道一善、菊谷真里、Meripet Polat, 下桐猛、印牧美佐夫、萬年英之、国枝哲夫、間陽子
  • 学会等名: 動物遺伝育種学会第15回大会
  • 発表場所: 埼玉県和光市
  • 年月日: 2014-10-30 – 2014-11-01
• [図書] 獣医免疫学 (2015)
  • 著者名/発表者名: 竹嶋伸之輔・間陽子
  • 出版者: 緑書房