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次世代シーケンサーを用いた赤血球膜異常症の網羅的解析

研究課題

研究課題/領域番号 25460686
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 病態検査学
研究機関山口大学

研究代表者

山城 安啓  山口大学, 医学(系)研究科(研究院), 准教授 (50243671)

研究分担者 田中 経彦  山口大学, 大学院医学系研究科, 准教授 (20144925)
研究協力者 服部 幸夫  
新田 孟徳  
清水 進弘  
メラ フェラーニア  
クリス アディヤント  
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円)
2015年度: 390千円 (直接経費: 300千円、間接経費: 90千円)
2014年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
2013年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
キーワード赤血球膜タンパク異常症 / 次世代シーケンサー / 球状赤血球症 / アンキリン / スペクトリン / Ion PGM / 遺伝子解析 / 赤血球膜タンパク / 遺伝子異常 / 網羅的解析
研究成果の概要

次世代シーケンサーを用い赤血球膜蛋白異常症の遺伝子解析を行った。Solid5500による全エクソーム解析は多数の多型、変異が検出されたが、疾患に関連する変異を限定する事が困難であった。広範囲遺伝子欠失は検出できなかった。Ion PGMは6症例の赤血球膜蛋白関連遺伝子20種類の解析を行い、新規のアンキリン遺伝子変異4例を発見した。うち1例はαスペクトリンにも変異が存在し、臨床症状の悪化に関連していると考えた。残りの2症例は遺伝子欠失を検索中である。赤血球膜蛋白異常症のように複合ヘテロ接合体や遺伝子欠失も想定される遺伝子疾患の解析には、関連遺伝子に的を絞ったIon PGMの利用が有効である。

報告書

(4件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2015 2014

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (2件)

  • [雑誌論文] A new Kruppel-like factor 1 mutation (c.947G > A or p.C316Y) in humans causes β-thalassemia minor.2015

    • 著者名/発表者名
      Nitta T, Kawano F, Yamashiro Y, Takagi F, Murata T, Tanaka T, Ferania M, Adhiyanto C, Hattori Y
    • 雑誌名

      Hemoglobin

      巻: 39(2) 号: 2 ページ: 121-126

    • DOI

      10.3109/03630269.2015.1008702

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] A New Kruppel-Like Factor 1 Mutation (c.947G>A or p.C316Y) in Humans Causes β-Thalassemia Minor.2015

    • 著者名/発表者名
      Nitta T, Kawano F, Yamashiro Y, Takagi F, Murata T, Tanaka T, Ferania M, Adhiyanto C, Hattori Y
    • 雑誌名

      Hemoglobin

      巻: 39(2) ページ: 121-6

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Comprehensive analysis of red cell membrane proteins by the next-generation sequencer2015

    • 著者名/発表者名
      Mori Kentaro, Yamashiro Yasuhiro, Hattori Yukio, Nitta Takenori, Kajiwara Ryosuke, Nakamori Yoshiki, Mella Ferania, Takagi Fumiya
    • 学会等名
      日本血液学会
    • 発表場所
      石川県金沢市(ホテル金沢)
    • 年月日
      2015-10-16
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] KLF1 gene mutation cause minor β-thalassemia.2014

    • 著者名/発表者名
      Nitta Takenori, Yamashiro Yasuhiro, Hattori Yukio, Mella Ferania, Shimizu Nobuhiro, Tanaka Tatehiko, Kawano Fumio.
    • 学会等名
      日本血液学会
    • 発表場所
      大阪国際会議場(大阪市)
    • 年月日
      2014-10-31
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書

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公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

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