環境癌における3p21領域ゲノム構造異常の詳細解析

• 研究課題/領域番号: 25460710
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 病態検査学
• 研究機関: 兵庫医科大学
• 研究代表者: 江見 充 兵庫医科大学, 医学部, 非常勤講師 (90221118)
• 研究分担者: 玉置 知子 (橋本 知子 / 玉置 知子(橋本知子) / 橋本知子) 兵庫医科大学, 医学部, 名誉教授 (10172868) ; 吉川 良恵 兵庫医科大学, 医学部, 助教 (10566673)
• 連携研究者: 吉川 良恵 兵庫医科大学, 医学部, 助教 (10566673)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円); 2015年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円); 2014年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円); 2013年度: 3,120千円 (直接経費: 2,400千円、間接経費: 720千円)
• キーワード: 悪性中皮腫 / 腎細胞がん / 3p21 / BAP1 / biallelic deletion / ゲノム再構成 / SETD2 / ゲノム不安定性 / ゲノムコピー数 / 環境癌 / アレイCGH / MLPA

研究成果の概要

環境がん（腎がん、悪性中皮腫）における染色体3p21領域でのゲノム構造異常の同定およびその有用な診断法の開発を行なう目的で、高密度CGHアレイ、ターゲット次世代シーケンサー、MLPAなど先端的なゲノム解析手法を総合的に実施した。腎がんではシンプルな全体のLOHの存在が特徴的であったが、悪性中皮腫では３３例中２０例で微細なゲノムのホモ接合性欠失の多発を特徴的に認めた。ホモ欠失は（平均4.7遺伝子/腫瘍）、SETD2など47-48Mb領域とBAP1など52-53Mb領域に集中していた。これら同定した特徴的なゲノム構造異常の効率的・迅速な診断法としてdigital MLPA法の開発に着手している。

研究成果

• [国際共同研究] University of Hawaii/Cancer Center/Thoracic Oncology Program(米国)
• [国際共同研究] New York University/Langone Medical Center/Department of Cardiothoracic Surgery(米国)
• [雑誌論文] Frequent genomic rearrangements of BRCA1 associated protein-1 (BAP1) gene in Japanese malignant mesothelioma-characterization of deletions at exon level. (2015)
  • 著者名/発表者名: Emi M et al
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 60 号: 10 ページ: 647-649
  • DOI: 10.1038/jhg.2015.91
  • 査読あり
• [雑誌論文] High Incidence of Somatic BAP1 Alterations in Sporadic Malignant Mesothelioma. (2015)
  • 著者名/発表者名: Nasu M, Emi M, Pastorino S, Tanji M, Powers A, Luk H, Baumann F, Zhang YA, Gazdar A, Kanodia S, Tiirikainen M, Flores E, Gaudino G, Becich MJ, Pass HI, Yang H, Carbone M.
  • 雑誌名: Journal of thoracic oncology 巻: 10 号: 4 ページ: 565-576
  • DOI: 10.1097/jto.0000000000000471
  • 査読あり
• [学会発表] Differences with BAP1- and PBRM1-mutations among malignant mesotheliomas and renal cell carcinomas (2015)
  • 著者名/発表者名: 吉川良恵、江見充、佐藤鮎子、大搗泰一郎、辻村亨、中野孝司、玉置（橋本）知子
  • 学会等名: 日本癌学会総会
  • 発表場所: 名古屋国際会議場(愛知県、名古屋市）
  • 年月日: 2015-10-08