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X染色体多型マーカーの血縁鑑定における有用性の評価に関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 25460874
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 法医学
研究機関名古屋市立大学

研究代表者

青木 康博  名古屋市立大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (90202481)

研究協力者 福田 真未子  名古屋市立大学, 大学院医学研究科, 大学院生
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
2015年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2014年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2013年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
キーワードDNA多型 / X染色体 / マイクロサテライト / 集団調査 / 連鎖不平衡 / 血縁鑑定 / 個人識別 / コンピュータ・シミュレーション / 連鎖解析 / 組み換え価 / short tandem repeat / アレル頻度 / X 染色体
研究成果の概要

日本在住者747名につき,X染色体上の短鎖縦列反復配列(X-STR)27座位のデータを収集し,多型指標および連鎖不平衡の状態につき検討した。このデータを用いて行ったシミュレーションにより,XーSTRが父娘,および父由来アリルを共有する女性同胞(全同胞・父系半同胞)の鑑別に有用であることが示された。同胞尤度比算出のため,1)遺伝的距離に基づく組み換え価を採用し,座位ごとに順次計算する,2)連鎖不平衡が検出された座位はハプロタイプとして扱う,3)遺伝型に矛盾が生じた場合のみ突然変異を考慮する,としたモデルを考案した。本法は少ない計算量で妥当な同胞尤度比が得られ,法医遺伝学的に有用と考えられた。

報告書

(4件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2016 2015 2014

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (5件) (うち招待講演 1件)

  • [雑誌論文] X染色体STRによる血縁鑑定:シミュレーションによる検討2016

    • 著者名/発表者名
      福田真未子,加藤秀章,青木康博
    • 雑誌名

      DNA多型

      巻: 24

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] ポピュレーションデータを用いたX染色体STRの連鎖不平衡の評価2015

    • 著者名/発表者名
      福田真未子,加藤秀章,青木康博
    • 雑誌名

      DNA多型

      巻: 23 ページ: 118-120

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書 2014 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] A novel model for likelihood calculation to evaluate kinship using X-chromosomal marker data2016

    • 著者名/発表者名
      Fukuta M, Gaballah M, Monnma-Otaki J, Seko-Nakamura Y, Tsuge Y, Kato H, Aoki Y.
    • 学会等名
      日本法医学会第100回学術全国集会
    • 発表場所
      品川区総合区民会館(東京都品川区)
    • 年月日
      2016-06-15
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 法医学的個人識別における定量的評価法に関する二・三のツール -DNA 鑑定の確率的評価および骨盤骨の3 次元計測による年齢・性別推定2016

    • 著者名/発表者名
      青木康博
    • 学会等名
      日本法医学会第100回学術全国集会
    • 発表場所
      品川区総合区民会館(東京都品川区)
    • 年月日
      2016-06-15
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] X染色体STRによる血縁鑑定:シミュレーションによる検討2015

    • 著者名/発表者名
      福田真未子,加藤秀章,青木康博
    • 学会等名
      日本DNA多型学会第24回学術集会
    • 発表場所
      岡山大学(岡山県岡山市)
    • 年月日
      2015-11-19
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ポピュレーションデータを用いたX染色体STRの連鎖不平衡の評価2014

    • 著者名/発表者名
      福田真未子,加藤秀章,青木康博
    • 学会等名
      日本DNA多型学会第23回学術集会
    • 発表場所
      愛知県産業労働センター(愛知県・名古屋市)
    • 年月日
      2014-11-27 – 2014-11-28
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] X染色体STRにおける連鎖不平衡の取扱いに関する一考察2014

    • 著者名/発表者名
      福田真未子,伊藤利泰,加藤明裕,青木康博
    • 学会等名
      第36回日本法医学会学術中部地方会
    • 発表場所
      藤田保健衛生大学(愛知県・豊明市)
    • 年月日
      2014-10-18
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書

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公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

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