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IgA腎症凍結腎生検標本糸球体のIgAを主体とした沈着物の解析と抗原の同定

研究課題

研究課題/領域番号 25461212
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 腎臓内科学
研究機関新潟大学

研究代表者

吉田 豊  新潟大学, 研究推進機構, 特任専門職員 (40182795)

研究分担者 矢尾板 永信  新潟大学, 大学院医歯学総合研究科, 准教授 (00157950)
山本 格  新潟大学, 産学地域連携推進機構, 特任教授 (30092737)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
2015年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2014年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
2013年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
キーワードIgA腎症 / IgA免疫複合体 / 凍結腎生検標本 / 単離糸球体 / スリット膜 / EMARS法 / プロテオミクス / 腎臓学 / 糸球体
研究成果の概要

標的膜タンパク質周囲の微小環境にあるタンパク質を蛍光色素で標識するEMARS法は,細胞・組織を破壊することなくタンパク質複合体を同定できる。この方法を用いてIgA腎症の腎生検試料でIgA沈着物を同定することを試みたが,標識の特異性と標識タンパク質の回収率に問題があり,高純度に精製したラット腎糸球体を材料としてネフリンを標的にしてEMARS法の検討を行った。fluorescein-tyramideを標識試薬として用いることにより特異性が高くなること,スリット膜を構成する多くの分子を同時に同定できることがわかった。しかし,標的タンパク質の回収の段階で,特異性と低い回収率に問題が認められた。

報告書

(4件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (32件)

すべて 2016 2015 2014 2013 2012 その他

すべて 雑誌論文 (12件) (うち国際共著 3件、 査読あり 12件、 謝辞記載あり 7件、 オープンアクセス 6件) 学会発表 (16件) (うち招待講演 2件) 備考 (4件)

  • [雑誌論文] Avian podocytes, which lack nephrin, use adherens junction proteins at intercellular junctions.2016

    • 著者名/発表者名
      Yaoita E, Nishimura H, Nameta M, Yoshida Y, Takimoto H, Fujinaka H, Kawachi H, Magdeldin S, Zhang Y, Xu B, Oyama T, Nakamura F, Yamamoto T
    • 雑誌名

      J Histchem Cytochem

      巻: 64 号: 1 ページ: 67-76

    • DOI

      10.1369/0022155415611708

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Unrestricted modification search reveals lysine methylation as major modification induced b tissue formalin fixation and paraffin embedding.2015

    • 著者名/発表者名
      Zhang Y, Muller M, Xu B, Yoshida Y, Horlacher O, Nikitin F, Garessus S, Magdeldin S, Kinoshita N, Fujinaka H, Yaoita E, Hasegawa M, Lisacek F, Yamamoto T
    • 雑誌名

      Proteomics

      巻: 15 号: 15 ページ: 2568-2579

    • DOI

      10.1002/pmic.201400454

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Label-free quantitative proteomic analysis reveals strong involvement of complement alternative and terminal pathways in human glomerular sclerotic lesions.2015

    • 著者名/発表者名
      Zhang Y, Xu B, Kinoshita N, Yoshida Y, Tasaki M, Fujinaka H, Magdeldin S, Yaoita E, Yamamoto T.
    • 雑誌名

      J Proteomics.

      巻: 123 ページ: 89-100

    • DOI

      10.1016/j.jprot.2015.03.024

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Complementary protein and peptide OFFGEL fractionation for high-throughput proteomic analysis.2015

    • 著者名/発表者名
      Magdeldin S, Elguoshy A, Yoshida Y, Hirao Y, Xu B, Zhang Y, Yamamoto K, Takimoto H, Fujinaka H, Kinoshita N, Yamamoto T
    • 雑誌名

      Anal Chem

      巻: 87 ページ: 8481-8488

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Datasets from label-free quantitative proteomic analysis of human glomeruli with sclerotic lesions.2015

    • 著者名/発表者名
      Zhang Y, Xu B, Kinoshita N, Yoshida Y, Tasaki M, Fujinaka H, Magdeldin S, Yaoita E, Yamamoto T
    • 雑誌名

      Data Brief

      巻: 4 ページ: 180-185

    • DOI

      10.1016/j.dib.2015.05.013

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Exploring extra-cellular proteins in methicillin susceptible and methicillin resistant Staphylococcus aureus by liquid chromatography-tandem mass spectrometry.2014

    • 著者名/発表者名
      Enany S, Yoshida Y, Yamamoto T
    • 雑誌名

      World J Microbiol Biotechnol

      巻: 30 ページ: 1269-1283

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Heparin increasing podocyte-specific gene expressions.2014

    • 著者名/発表者名
      Yaoita E, Yoshida Y, Nameta M, Zhang Y, Fujinaka H, Magdeldin S, Xu B, Yamamoto T.
    • 雑誌名

      Nephrology (Carlton)

      巻: 19 号: 4 ページ: 195-201

    • DOI

      10.1111/nep.12207

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書 2013 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Deep proteome mapping of mouse kidney based on OFFGel prefractionation reveals remarkable protein post- translational modifications.2014

    • 著者名/発表者名
      Magdeldin S, Yamamoto K, Yoshida Y, Xu B, Zhang Y, Fujinaka H, Yaoita E, Yates JR 3rd, Yamamoto T
    • 雑誌名

      J Proteome Res.

      巻: 13 号: 3 ページ: 1636-46

    • DOI

      10.1021/pr401122m

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書 2013 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] .Basics and recent advances of two dimensional- polyacrylamide gel electrophoresis2014

    • 著者名/発表者名
      Magdeldin S, Enany S, Yoshida Y, Xu B, Zhang Y, Zureena Z, Lokamani I, Yaoita E, Yamamoto T
    • 雑誌名

      Clin Proteomics

      巻: 11 号: 1 ページ: 16-16

    • DOI

      10.1186/1559-0275-11-16

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Tor and the Sin3-Rpd3 complex regulate expression of the mitophagy receptor protein Atg32 in yeast.2014

    • 著者名/発表者名
      Aihara M, Jin X, Kurihara Y, Yoshida Y, Matsushima Y, Oku M, Hirota Y, Saigusa T, Aoki Y, Uchiumi T, Yamamoto T, Sakai Y, Kang D, Kanki T.
    • 雑誌名

      Journal of Cell Science

      巻: 127 ページ: 3184-96

    • DOI

      10.1242/jcs.153254

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Profiling and annotation of human kidney glomerulus proteome2013

    • 著者名/発表者名
      Cui Z, Yoshida Y, Xu B, Zhang Y, Nameta M, Magdeldin S, Makiguchi T, Ikoma T, Fujinaka H, Yaoita E, Yamamoto T
    • 雑誌名

      Proteome Sci

      巻: 11 号: 1 ページ: 13-13

    • DOI

      10.1186/1477-5956-11-13

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Profiling of kidney vascular endothelial cell plasma membrane proteins by liquid chromatography-tandem mass spectrometry2012

    • 著者名/発表者名
      Liu Z, Xu B, Nameta M, Zhang Y, Magdeldin S, Yoshida Y, Yamamoto K, Fujinaka H, Yaoita E, Tasaki M, Nakagawa Y, Saito K, Takahashi K, Yamamoto T
    • 雑誌名

      Clin Exp Nephrol

      巻: 掲載予定 号: 3 ページ: 327-337

    • DOI

      10.1007/s10157-012-0708-1

    • NAID

      10031184238

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] EMARS法によるタンパク質複合体解析:腎糸球体上皮細胞足突起間接着装置を構成するタンパク質群の同定2016

    • 著者名/発表者名
      吉田 豊,瀧本裕基,小谷典弘,矢尾板永信
    • 学会等名
      日本プロテオーム学会2016年年会
    • 発表場所
      東京都港区 北里大学
    • 年月日
      2016-07-28
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 培養ポドサイトおける一次突起の誘導2016

    • 著者名/発表者名
      矢尾板永信,吉田 豊,瀧本裕基
    • 学会等名
      第59回日本腎臓学会学術総会
    • 発表場所
      横浜市 パシフィコ横浜
    • 年月日
      2016-06-17
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] EMARS法を用いたポドサイトの細胞間接着装置の網羅的解析2016

    • 著者名/発表者名
      瀧本裕基,河内 裕,吉田 豊,矢尾板永信
    • 学会等名
      第59回日本腎臓学会学術総会
    • 発表場所
      横浜市 パシフィコ横浜
    • 年月日
      2016-06-17
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Comparable pathway analysis of IgA nephoritis glomeruli with normal one base on SWATH approach.2014

    • 著者名/発表者名
      Xu B, Zhang Y, Liu Y, Yoshida Y, Magdeldin S, Fujinaka H, Yaoita E, Abersold R, Yamamoto T
    • 学会等名
      HUPO 13th Annual World Congress
    • 発表場所
      Madrid, Spain
    • 年月日
      2014-10-05 – 2014-10-08
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Deep proteome mapping of mouse kidney based on OFFGEL prefractionation reveals remarkable protein post-translational modifications2014

    • 著者名/発表者名
      Magdeldin S, Yamamoto K, Yoshida Y, Xu B, Zhang Y, Fujinaka H, Yaoita E, Yates J,Yamamoto T
    • 学会等名
      HUPO 13th Annual World Congress
    • 発表場所
      Madrid, Spain
    • 年月日
      2014-10-05 – 2014-10-08
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] Liquid chromatography and mass spectrometry for comparing clinical isolates of MRSA and MSSA2014

    • 著者名/発表者名
      Enany S, Yoshida Y, Magdeldin S, Yamamoto T
    • 学会等名
      HUPO 13th Annual World Congress
    • 発表場所
      Madrid, Spain
    • 年月日
      2014-10-05 – 2014-10-08
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] HPPに向けてのHKUPPの取り組み2014

    • 著者名/発表者名
      吉田 豊、山本 格
    • 学会等名
      日本プロテオーム学会2014年会(JHUPO第12回大会)
    • 発表場所
      つくば国際会議場(茨城県つくば市)
    • 年月日
      2014-07-16 – 2014-07-18
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 3つの異なるプラットフォームでのSWATHデータ解析結果の比較2014

    • 著者名/発表者名
      許 波、張 エイ、吉田 豊、藤中 秀彦、矢尾板 永信、Yansheng Liu, Ruedi Aebersold, 山本 格
    • 学会等名
      日本プロテオーム学会2014年会(JHUPO第12回大会)
    • 発表場所
      つくば国際会議場(茨城県つくば市)
    • 年月日
      2014-07-16 – 2014-07-18
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] Profiling and annotation of human kidney glomerulus proteome.2014

    • 著者名/発表者名
      吉田 豊、崔 珍玉、許 波、藤中 秀彦、矢尾板 永信、山本 格
    • 学会等名
      第57回日本腎臓学会学術集会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜市西区)
    • 年月日
      2014-07-04 – 2014-07-06
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] 質量分析計と抗体の両者で同定された高信頼ヒト糸球体プロテオーム2014

    • 著者名/発表者名
      行田 正晃、吉田 豊、矢尾板 永信、許 波、張 エイ、山本 格
    • 学会等名
      第57回日本腎臓学会学術集会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜市西区)
    • 年月日
      2014-07-04 – 2014-07-06
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] 質量分析計と免疫組織化学によるヒト糸球体プロテオームデータベースの比較2013

    • 著者名/発表者名
      行田正明、吉田 豊、矢尾板永信、許 波、張 エイ、山本 格
    • 学会等名
      第56回日本腎臓学会学術総会
    • 発表場所
      東京国際フォーラム(東京都千代田区)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] ラット足細胞初代培養系におけるヘパリンの効果(2)2013

    • 著者名/発表者名
      矢尾板永信、吉田 豊、山本 格
    • 学会等名
      第56回日本腎臓学会学術総会
    • 発表場所
      東京国際フォーラム(東京都千代田区)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Proteomic analysis of nephron segments of formalin-fixed paraffin-embedded human kidney tissues.2013

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto T, Yamamoto K, Yoshida Y, Xu B, Zhang Y, Magdeldin S
    • 学会等名
      HUPO 12th Annual World Congress
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜市西区)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] High confident human glomerulus proteome identified both by mass spectrometry- and antibody-based proteomics.2013

    • 著者名/発表者名
      Nameta M, Yoshida Y, Zhang Y, Xu B, Magdeldin S
    • 学会等名
      HUPO 12th Annual World Congress
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜市西区)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Profiling and annotation of human kidney glomerulus proteome.2013

    • 著者名/発表者名
      Cui Z, Yoshida Y, Xu B, Zhang Y, Nameta M, Magdeldin S, Makiguchi T, Ikoma T, Fujinaka H, Yaoita E, Yamamoto T
    • 学会等名
      HUPO 12th Annual World Congress
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜市西区)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Accurate quantification of peptides for mass spectrometric analysis: a modified microscale bininchoninic acid assay.2013

    • 著者名/発表者名
      Yoshida Y, Hasegawa M, Lim LC, Shiromizu T, Hara Y, kanagawa A, Koyama Y, Yaoita E, Wakai T, Tomonaga T, Yamamoto T
    • 学会等名
      HUPO 12th Annual World Congress
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜市西区)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [備考] 新潟大学医歯学総合研究科腎研究施設構造病理学分野ホームページ

    • URL

      http://www.kidney-niigata.org/strpath/ind_j.html

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書 2014 実施状況報告書
  • [備考] Human Kidney and Urine Proteome Projectホームページ

    • URL

      http://www.hkupp.org/

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書 2014 実施状況報告書
  • [備考] 新潟大学医歯学総合研究科腎研究施設構造病理学分野ホームページ

    • URL

      http://www.kidney-niigata.org/strpath/ind_j.html

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [備考] Human Kidney and Urine Proteome Organizationホームページ

    • URL

      http://www.hkupp.org/

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書

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公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

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