| 研究課題/領域番号 |
25461530
|
|---|
| 研究種目 |
基盤研究(C)
|
| 配分区分 | 基金 |
|---|
| 応募区分 | 一般 |
|---|
| 研究分野 |
感染症内科学
|
|---|
| 研究機関 | 富山県衛生研究所 |
|---|
研究代表者 |
滝澤 剛則 富山県衛生研究所, その他部局等, 部長 (40192158)
|
|---|
| 連携研究者 |
名古屋 真弓 富山県衛生研究所, ウイルス部, 主任研究員 (80393081)
稲崎 倫子 富山県衛生研究所, ウイルス部, 研究員 (40633665)
|
|---|
| 研究期間 (年度) |
2013-04-01 – 2016-03-31
|
| 研究課題ステータス |
完了 (2015年度)
|
| 配分額 *注記 |
5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2015年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2014年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2013年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
|
|---|
| キーワード | ノロウイルス / 環境水 / 発生動向調査 / サーベイランス / メタゲノム / サポウイルス / 感染性胃腸炎 / 食中毒 / 次世代シークエンサー / メタゲノム解析 |
|---|
| 研究成果の概要 |
次世代シークエンサー（NGS）を用いて、胃腸炎事例のメタゲノム解析を行った。定法ではノロウイルス（NoV）陰性だった検体からもNoVが検出され、因果関係の推定可能事例が存在した。PCR産物のディープシークエンス解析では、単一遺伝子型暴露と考えられた事例でも、複数の遺伝子型の感染が推定された。カキ喫食事例では、複数のNoV遺伝子型やNoV以外のウイルスが検出され、カキに含まれる複数種のウイルス暴露が推定された。
メタゲノム解析により、遺伝子型と病因との関連を推定できることが判明したが、十分なNoVのリード数を得ることが困難であったため、塩基配列の多様性と病因との関連は議論できなかった。
|
