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ゲノム解析による円形脱毛症疾患感受性遺伝子同定の試み(第2段)

研究課題

研究課題/領域番号 25461712
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 皮膚科学
研究機関順天堂大学

研究代表者

池田 志斈  順天堂大学, 医学部, 教授 (40193198)

研究分担者 岡 晃  東海大学, 医科学研究所, 講師 (80384866)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2015年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2014年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2013年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワード円形脱毛症 / マイクロサテライト / GWAS / ゲノム解析 / ゲノム編集 / 疾患遺伝子 / 遺伝子 / ノックアウトマウス / ノックインマウス / alopecia areata / gene
研究成果の概要

H25-27年度の研究で、マイクロサテライトを用いた円形脱毛症のGWASを行い、さらにSNPと次世代シークエンサーを用いた解析を行い下記の成果が得られた。1)HLA領域、特にHLA-C遺伝子の近傍に強い相関が得られた(OR: 3.41)。2)28のハプロタイプが検出されたが、その内の1つのハプロタイプ上に疾患遺伝子が乗っていることが判明した。3)5つのリスクハと3つのノンリスクハプロタイプの3.95メガベース領域について、次世代シークエンサーを用いて解析したところ、リスクハプロタイプのみに共通してみられるexon領域の遺伝子変異が1つだけ検出された。

報告書

(4件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2015 2013

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (3件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] Association analysis of the HLA-C gene in Japanese alopecia areata.2013

    • 著者名/発表者名
      Haida Y, Ikeda S, Takagi A, Komiyama E, Mabuchi T, Ozawa A, Kulski JK, Inoko H, Oka A.
    • 雑誌名

      Immunogenetics

      巻: 65 ページ: 553-7

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] MHC risk haplotype sequencing indentifies a gene as susceptibility gene for Alopecia Areata2015

    • 著者名/発表者名
      池田志斈、込山悦子、岡 晃
    • 学会等名
      World Congress of Dermatology
    • 発表場所
      Vancouver, Canada
    • 年月日
      2015-06-08 – 2015-06-12
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] MHC risk haplotype sequencing identifies a susceptibility gene for alopecia areata2015

    • 著者名/発表者名
      Shigaku IKEDA, Etsuko KOMIYAMA, Atsushi TAKAGI, Akira OKA
    • 学会等名
      23rd World Congress of Dermatology
    • 発表場所
      Vancouver, Canada
    • 年月日
      2015-06-08
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] An association study of alopecia areata using microsatellite markers within major histocompatibility complex2013

    • 著者名/発表者名
      Ikeda S, Takagi A, Komiyama E, et al
    • 学会等名
      World Congress for Hair Research
    • 発表場所
      Edinbough, UK
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書

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公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

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