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Exome Sequencing to identify novel candidate genes for autism

研究課題

研究課題/領域番号 25461728
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 精神神経科学
研究機関浜松医科大学

研究代表者

イスメール サンシーム  浜松医科大学, 医学部, 特任研究員 (60569846)

研究分担者 大坪 正史  浜松医科大学, メディカルフォトニクス研究センター, 助教 (10327653)
Anitha A (ANITHA A)  浜松医科大学, 子どものこころの発達研究センター, 特任助教 (70377753)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 中途終了 (2014年度)
配分額 *注記
5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2015年度: 260千円 (直接経費: 200千円、間接経費: 60千円)
2014年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2013年度: 3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円)
キーワード児童・思春期精神医学 / 自閉症スペクトラム / コピー数多型解析 / エクソーム配列解析 / エクソ-ム配列解析
研究実績の概要

Recent advances in next-generation sequencing techniques have made the large-scale analysis of human genomes possible. In contrast with the array-based analysis of large CNVs, this approach has a greater potential to reveal single genes associated with ASDs. We sequenced the exome of 20 patients with sporadic autism and their parents (60 individuals in total), reasoning that these families would be enriched for de novo mutations of severe impact. In the sporadic or simplex families with no previous history of ASD or related phenotypes, de novo mutations underlie a substantial fraction of the risk to develop ASD.
As a result, we discovered several novel/ultra-rare de novo variations, many of them are potentially deleterious, in the first ever exome sequencing study in Japanese autism subjects; further highlighting the genetic heterogeneity of the disorder. Estimation of the exact functional consequences of rare mutations, and the translation of this knowledge to support clinical decisions towards personalized pharmacological interventions is a real future challenge.

報告書

(2件)
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (1件)

すべて 2014

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件)

  • [雑誌論文] Zinc finger protein 804A (ZNF804A) and verbal deficits in individuals with autism.2014

    • 著者名/発表者名
      Anitha A, Thanseem I, Nakamura K, Vasu MM, Yamada K, Ueki T, Iwayama Y, Toyota T, Tsuchiya KJ, Iwata Y, Suzuki K, Sugiyama T, Tsujii M, Yoshikawa T, Mori N.
    • 雑誌名

      J Psychiatry Neurosci

      巻: 39 号: 5 ページ: 294-303

    • DOI

      10.1503/jpn.130126

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス

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公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

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