次世代シーケンサーを用いた胃がんミュータノーム解析と個別化がんワクチンの開発

• 研究課題/領域番号: 25462014
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 消化器外科学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 和田 郁雄 東京大学, 医学部附属病院, 届出診療医 (80401082)
• 研究分担者: 瀬戸 泰之 東京大学, 医学部附属病院, 教授 (00260498) ; 垣見 和宏 東京大学, 医学部附属病院, 特任教授 (80273358) ; 松下 博和 東京大学, 医学部附属病院, 特任講師 (80597782)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円); 2015年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円); 2014年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円); 2013年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
• キーワード: 胃がん / 次世代シーケンス / 遺伝子変異 / MHCクラスI結合予測法 / 固有抗原 / TIL / 個別化がん免疫治療 / 胃癌 / ネオアンチゲン / エクソームシーケンス / ミスセンス変異 / 変異ペプチド / アフィニティ / MHC binding prediction法

研究成果の概要

我々は、次世代シーケンスとMHCクラスＩ結合予測法を用いて、遺伝子変異由来の候補固有抗原を同定するシステムをマウスの胃がんモデルで構築した。これまで29例の胃がん手術組織検体とそのペアーとなる末梢血単核球(PBMC)を採取し保存した。10例で腫瘍浸潤リンパ球（TIL）における免疫チェックポイント分子の発現及び腫瘍内の制御性T細胞の浸潤を解析し、胃がんの腫瘍局所の免疫抑制環境を検討した。また、3例で自己腫瘍に特異的に反応するTILを培養することが可能であった。将来の個別化がん免疫治療の準備段階として、固有抗原同定システムを構築し、胃がんの固有抗原同定に向けた胃がん組織検体を採取できた。

研究成果

• [雑誌論文] Identification of Individual Cancer-Specific Somatic Mutations for Neoantigen-Based Immunotherapy of Lung Cancer. (2016)
  • 著者名/発表者名: Karasaki T, Nagayama K, Kawashima M, Hiyama N, Murayama T, Kuwano H, Nitadori J, Anraku M, Sato M, Miyai M, Hosoi A, Matsushita H, Kikugawa S, Matoba R, Ohara O, Kakimi K, Nakajima J
  • 雑誌名: Journal of Thoracic Oncology 巻: 11(3) 号: 3 ページ: 324-33
  • DOI: 10.1016/j.jtho.2015.11.006
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Neoantigen Load, Antigen Presentation Machinery, and Immune Signatures Determine Prognosis in Clear Cell Renal Cell Carcinoma. (2016)
  • 著者名/発表者名: Matsushita H, Sato Y, Karasaki T, Nakagawa T, Kume H, Ogawa S, Homma Y, Kakimi K.
  • 雑誌名: Cancer Immunol Res. 巻: Epub
  • 査読あり
• [雑誌論文] A pilot study of autologous tumor lysate-loaded dendritic cell vaccination combined with sunitinib for metastatic renal cell carcinoma. (2014)
  • 著者名/発表者名: Matsushita H, Enomoto Y, Kume H, Nakagawa T, Fukuhara H, Suzuki M, Fujimura T, Homma Y, Kakimi K.
  • 雑誌名: J Immunother Cancer. 巻: 2 号: 1 ページ: 30-30
  • DOI: 10.1186/s40425-014-0030-4
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Intraperitoneal injection of in vitro expanded Vγ9Vδ2 T cells together with zoledronate for the treatment of malignant ascites due to gastric cancer. (2014)
  • 著者名/発表者名: Wada I, Matsushita H, Noji S, Mori K, Yamashita H, Nomura S, Shimizu N, Seto Y, Kakimi K
  • 雑誌名: Cancer Med 巻: 3 号: 2 ページ: 362-375
  • DOI: 10.1002/cam4.196
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Vaccination With NY-ESO-1 Overlapping Peptides Mixed With Picibanil OK-432 and Montanide ISA-51 in Patients With Cancers Expressing the NY-ESO-1 Antigen (2014)
  • 著者名/発表者名: Wada H, Isobe M, Kakimi K, Mizote Y, Eikawa S, Sato E, Takigawa N, Kiura K, Tsuji K, Iwatsuki K, Yamasaki M, Miyata H, Matsushita H, Udono H, Seto Y, Yamada K, Nishikawa H, Pan L, Venhaus R, Oka M, Doki Y, Nakayama E.
  • 雑誌名: J Immunother 巻: 37(2) 号: 2 ページ: 84-92
  • DOI: 10.1097/cji.0000000000000017
  • 査読あり
• [雑誌論文] Adoptive cytotoxic T lymphocyte therapy triggers a counter-regulatory immunosuppressive mechanism via recruitment of myeloid-derived suppressor cells. (2014)
  • 著者名/発表者名: Hosoi A, Matsushita H, Shimizu K, Fujii SI, Ueha S, Abe J, Kurachi M, Maekawa R, Matsushima K, Kakimi K.
  • 雑誌名: Int J Cancer. 巻: 134 号: 8 ページ: 1810-22
  • DOI: 10.1002/ijc.28506
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ex vivo characterization of γδ T-cell repertoire in patients after adoptive transfer of Vγ9Vδ2 T cells expressing the interleukin-2 receptor β-chain andthe common γ-chain. (2013)
  • 著者名/発表者名: Izumi T, Kondo M, Takahashi T, Fujieda N, Kondo A, Tamura N, Murakawa T, Nakajima J, Matsushita H, Kakimi K.
  • 雑誌名: Cytotherapy 巻: 15(4) 号: 4 ページ: 481-491
  • DOI: 10.1016/j.jcyt.2012.12.004
  • 査読あり
• [雑誌論文] 癌免疫細胞治療(総説) (2013)
  • 著者名/発表者名: 和田 郁雄, 瀬戸 泰之
  • 雑誌名: 消化器外科学レビュー2013-'14 巻: 2013-'14 ページ: 233-237
• [学会発表] 新生抗原をターゲットにしたがん免疫治療法の開発 (2016)
  • 著者名/発表者名: 松下博和、垣見和宏
  • 学会等名: 第13回 日本免疫治療学研究会学術集会
  • 発表場所: 東京ガーデンパレス（東京都文京区）
  • 年月日: 2016-02-27
  • 招待講演
• [学会発表] 既存のデータベースから抽出した遺伝子変異をターゲットとした肺癌ペプチドワクチン開発の限界について (2015)
  • 著者名/発表者名: 唐崎隆弘、長山和弘、川島光明、檜山紀子、村山智紀、桑野秀規、似鳥純一、安樂真樹、佐藤雅昭、垣見和宏、中島 淳
  • 学会等名: 第56回 日本肺癌学会学術集会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2015-11-28
• [学会発表] 胃癌患者における腫瘍浸潤リンパ球の免疫チェックポイント分子の発現 (2015)
  • 著者名/発表者名: 大平公亮、松下博和、瀬戸泰之、垣見和宏
  • 学会等名: 第74回 日本癌学会学術集会
  • 発表場所: 名古屋国際会議場（愛知県名古屋市）
  • 年月日: 2015-10-08
• [学会発表] 腫瘍特異的遺伝子変異抗原(Neo-antigen)を標的としたがん免疫治療とモニタリング (2015)
  • 著者名/発表者名: 垣見和宏
  • 学会等名: 第13回日本臨床腫瘍学会学術集会
  • 発表場所: ロイトン札幌（北海道札幌市）
  • 年月日: 2015-07-16
  • 招待講演
• [学会発表] In silico prediction of neoantigen for lung cancer tarageting shared somatic mutations (2015)
  • 著者名/発表者名: Takahiro Karasaki, Kazuhiro Nagayama, Manami Miyai, Hirokazu Matsushita, Shingo Kikugawa, Ryo Matoba, Paul Horton, Osamu Ohara, Kazuhiro Kakimi, Jun Nakajima
  • 学会等名: 第１９回日本がん免疫学会総会（ICCIM2015）
  • 発表場所: 伊藤国際学術センター（東京都文京区）
  • 年月日: 2015-07-09
• [学会発表] Expression of immune-checkpoint molecules on tumor infiltrating lymphocytes in patients with gastric cancer (2015)
  • 著者名/発表者名: Kosuke Odaira , Hirokazu Matsushita, Ikuo Wada, Yasuyuki Seto, Nao Fujieda, Yukari Kobayashi, Kazuhiro Kakimi
  • 学会等名: 第１９回日本がん免疫学会総会（ICCIM2015）
  • 発表場所: 伊藤国際学術センター（東京都文京区）
  • 年月日: 2015-07-09
• [学会発表] Expression of candidate neoantigens in ccRCC patients and its implication on prognosis (2015)
  • 著者名/発表者名: Hirokazu Matsushita, Manami Miyai, Yusuke Sato, Tohru Nakagawa, Haruki Kume, Seishi Ogawa, Yukio Homma, Kazuhiro Kakimi
  • 学会等名: 第１９回日本がん免疫学会総会（ICCIM2015）
  • 発表場所: 伊藤国際学術センター（東京都文京区）
  • 年月日: 2015-07-09
• [学会発表] CTL治療における腫瘍内免疫応答の解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 垣見和宏
  • 学会等名: 第12回日本免疫治療学研究会学術集会
  • 発表場所: 東京ガーデンパレス（東京都文京区）
  • 年月日: 2015-02-18
• [学会発表] Autologous tumor lysate-loaded dendritic cell vaccination combined with Sunitinib for metastatic renal cell carcinoma (2014)
  • 著者名/発表者名: Kazuhiro Kakimi, Hirokazu Matsushita, Yutaka Enomoto, Tohru Nakagawa, Haruki Kume and Yukio Honma
  • 学会等名: SITC (Society for immunotherapy of Cancer) 2014
  • 発表場所: Gaylord National Hotel & Convention Center, National Harbor, MD, USA
  • 年月日: 2014-11-07 – 2014-11-09
• [学会発表] 食道がんに対するDCF療法と活性化自己γδT細胞治療の併用による治療効果の検討 (2014)
  • 著者名/発表者名: 森和彦、松下博和、平野康介、山田和彦、山下裕玄、野村幸代、瀬戸泰之、垣見和宏
  • 学会等名: 第52回日本癌治療学会学術集会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-08-29
• [学会発表] γδT細胞を用いたがん免疫細胞治療におけるTIM-3とGalectin-9の相互作用 (2014)
  • 著者名/発表者名: 神原佳織、藤枝奈緒、大平公亮、近藤篤、近藤真、泉謙道、高橋卓也、松下博和、和田郁雄、瀬戸泰之、垣見和宏
  • 学会等名: 第18回日本がん免疫学会総会
  • 発表場所: ひめぎんホール（愛媛県松山市）
  • 年月日: 2014-07-31
• [学会発表] TCRディープシーケンスによるNY-ESO-1特異的T細胞のモニタリング (2014)
  • 著者名/発表者名: 垣見和宏、榮川伸吾、磯辺みどり、松下博和、宮井まなみ、細井亮宏、藤枝奈緒、鵜殿平一郎、上中明子、中山睿一
  • 学会等名: 第18回日本がん免疫学会総会
  • 発表場所: ひめぎんホール（愛媛県松山市）
  • 年月日: 2014-07-31
• [学会発表] 腫瘍内の免疫抑制性環境の制御による腫瘍特異的CTL移入治療の増強 (2014)
  • 著者名/発表者名: 細井亮宏、平野康介、松下博和、瀬戸泰之、前川隆司、垣見和宏
  • 学会等名: 第18回日本がん免疫学会総会
  • 発表場所: ひめぎんホール（愛媛県松山市）
  • 年月日: 2014-07-31
• [学会発表] Development of γδ T cell-based cancer immunotherapy (2014)
  • 著者名/発表者名: 垣見和宏
  • 学会等名: 第18回日本がん免疫学会総会
  • 発表場所: ひめぎんホール（愛媛県松山市）
  • 年月日: 2014-07-31
  • 招待講演
• [学会発表] がん免疫治療新時代に向けて (2014)
  • 著者名/発表者名: 垣見和宏
  • 学会等名: 平成26年度沖縄県委託事業「先端医療産業開発拠点形成事業」
  • 発表場所: 琉球大学（沖縄県中頭郡西原町）
  • 年月日: 2014-05-26
  • 招待講演
• [学会発表] Killing and IFN-γ-dependent G1 cell cycle arrest is the mechanism of regulation of tumor growth by Cytotoxic T Lymphocytes. (2013)
  • 著者名/発表者名: Kazuhiro Kakimi, Hirokazu Matsushita, Akihiro Hosoi, Ryuji Maekawa, and Osamu Ohara
  • 学会等名: AACR Annual Meeting 2013
  • 発表場所: Washington DC, USA
• [学会発表] 腹水貯留を伴う治療抵抗性胃癌に対するγδT細胞腹腔内投与治療の第1相臨床試験 (2013)
  • 著者名/発表者名: 和田 郁雄, 松下 博和, 垣見 和宏, 小野山 温那, 李 基成, 奥村 康弘, 谷島 翔, 神保 敬一, 土田 泰昭, 愛甲 丞, 山形 幸徳, 山下 裕玄, 森 和彦, 清水 伸幸, 野村 幸世, 瀬戸 泰之
  • 学会等名: 第113回日本外科学会定期学術集会
  • 発表場所: 福岡県福岡市
• [学会発表] 癌免疫治療新時代に向けて (2013)
  • 著者名/発表者名: 垣見和宏
  • 学会等名: 第34回癌免疫外科研究会
  • 発表場所: 岡山県、岡山市
  • 招待講演
• [学会発表] クリニカルゲノミクスへの期待：がん免疫治療の見地から
  • 著者名/発表者名: 垣見和宏
  • 学会等名: かずさDNA 研究所/産総研 生命情報工学研究センター共催ワークショップ
  • 発表場所: 東京都
  • 招待講演
• [学会発表] ヒトがん免疫病態の解明と免疫バイオマーカーの同定
  • 著者名/発表者名: 河上裕、徐明利、谷口智憲、野地しのぶ、南雲春菜、岡本正人、桜井敏晴、藤田知信、鳥越俊彦、佐藤昇志、中面哲也、垣見和宏、池田裕明、珠玖洋、奥野清隆、杉浦史哲、中山睿一、硲彰一、岡正朗、伊東恭吾
  • 学会等名: 第17回日本がん免疫学会総会
  • 発表場所: 山口県宇部市
  • 招待講演
• [備考] 免疫細胞治療学研究室のHP
  • URL: http://immunoth.umin.jp/result/index_03.html
• [備考] 免疫細胞治療学（メディネット）講座
  • URL: http://immunoth.umin.jp/result/index_03.html