| 研究課題/領域番号 |
25462180
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
呼吸器外科学
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| 研究機関 | 長崎大学 |
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研究代表者 |
宮崎 拓郎 長崎大学, 病院(医学系), 助教 (00584749)
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| 研究分担者 |
永安 武 長崎大学, 医歯薬学総合研究科(医学系), 教授 (80284686)
土谷 智史 長崎大学, 医歯薬学総合研究科(医学系), 准教授 (30437884)
松本 桂太郎 長崎大学, 医歯薬学総合研究科(医学系), 講師 (80404268)
久保 亨 長崎大学, 熱帯医学研究所, 客員研究員 (50444873)
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| 研究期間 (年度) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2015年度)
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| 配分額 *注記 |
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2015年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2014年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
2013年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
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| キーワード | 家族性肺癌 / exome解析 |
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| 研究成果の概要 |
家系内の肺癌罹患者3名、非罹患者3名の血液からゲノムDNAを抽出し、Life Technologies社のSOLiD5500を用いてpair-end read sequenceを行なった。Novoalign CSMPIにてmappingを行い、GATK(Genome Analysis ToolKit)を用いて塩基置換、及び塩基欠失挿入リストを作成し、変異候補遺伝子をリストアップした。①罹患者に共通して認め、非罹患者に共通して認めない遺伝子と②現時点では未発症である、変異を有する非罹患者を考慮し、罹患者と非罹患者に共通して認める遺伝子を選定した。
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