新規ジペプチジルペプチダーゼ酵素群の発現と細胞内分布の解析

• 研究課題/領域番号: 25462894
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 機能系基礎歯科学
• 研究機関: 長崎大学
• 研究代表者: 根本 優子 長崎大学, 医歯薬学総合研究科(歯学系), 准教授 (10164667)
• 研究分担者: 根本 孝幸 長崎大学, 医歯薬学総合研究科(歯学系), 教授 (90164665) ; 木村 重信 岩手医科大学, 歯学部, 教授 (10177917)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円); 2015年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2014年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2013年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
• キーワード: Porphyromonas gingivalis / ジペプチジルペプチダーゼ / アミノ酸代謝 / ペリプラズム / 歯周病 / ペプチダーゼ / 歯周病原性細菌 / 嫌気性菌 / 糖非発酵性細菌 / 口腔細菌 / 酵素

研究成果の概要

本研究では，歯周病原性細菌であるPorphyromonas gingivalisの病原性に関与するジペプチド分解系酵素群について検討した。その結果，これまで真菌でのみ報告されていたDPP5が本菌で発現していることを見出し，また，新規の酵素であるアシルペプチジルオリゴペプチダーゼ (AOP)を発見した。これら酵素のオルソログは多くの細菌，古細菌，及び真核生物に分布していること，DPP/AOPはペリプラズム画分に局在すること，また，アミノ酸をエネルギー源とする本菌においてジペプチド産生酵素群が増殖能に深く関与することを明らかにした。

研究成果

• [雑誌論文] Porphyromonas gingivalis exopeptidases as crucial factors for its amino acid metabolism (2016)
  • 著者名/発表者名: Nemoto, T.K., Ohara-Nemoto, Y.
  • 雑誌名: Jap. Dent. Sci. Rev. 巻: 52 号: 1 ページ: 22-29
  • DOI: 10.1016/j.jdsr.2015.08.002
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Identification and characterization of prokaryotic dipeptidyl-peptidase 5 from Porphyromonas gingivalis. (2014)
  • 著者名/発表者名: Ohara-Nemoto Y, Rouf SMA, Naito M, Yanase A, Tetsuo F, Ono T, Kobayakawa T, Shimoyama Y, Kimura S, Nakayama K, Saiki K, Konishi K, Nemoto TK.
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 巻: 289 号: 9 ページ: 5438-5448
  • DOI: 10.1074/jbc.m113.527333
  • NAID: 120006986777
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Identification of dipeptidyl-peptidase (DPP)5 and DPP7 in Porphyromonas endodontalis, distinct from those in Porphyromonas gingivalis. (2014)
  • 著者名/発表者名: Nishimata H, Ohara-Nemoto Y, Baba TT, Hoshino T, Fujiwara T, Shimoyama Y, Kimura S, Nemoto TK.
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 9 号: 12 ページ: 1-15
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0114221
  • NAID: 120006986295
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] In vitro processing of glutamyl endopeptidase proenzymes from Enterococcus faecalis and importance of N-terminal residue in enzyme catalysis. (2013)
  • 著者名/発表者名: Rouf, S. M., Ohara-Nemoto, Y., Ono, T., Shimoyama, Y., Kimura, S. and Nemoto, T. K.
  • 雑誌名: Adv. Biochem. 巻: 1 号: 5 ページ: 73-80
  • DOI: 10.11648/j.ab.20130105.11
  • 査読あり
• [雑誌論文] Phenylalanine 664 of dipeptidyl peptidase (DPP) 7 and Phenylalanine 671 of DPP11 mediate preference for P2-position hydrophobic residues of a substrate. (2013)
  • 著者名/発表者名: Rouf, S. M., Ohara-Nemoto, Y., Ono, T., Shimoyama, Y., Kimura, S. and Nemoto, T. K.
  • 雑誌名: FEBS Open Bio. 巻: 3 号: 1 ページ: 177-183
  • DOI: 10.1016/j.fob.2013.03.004
  • NAID: 120006985739
  • 査読あり
• [雑誌論文] Measurement of protease activity of exfoliative toxin A using synthetic peptidyl substrates and correlation between in vivo and in vitro activities. (2013)
  • 著者名/発表者名: Tachi, M. T., Ohara-Nemoto, Y., Baba, T.T., Kobayakawa, T., Fujita, S., Ikeda, T., Ayuse, T., Oi, K., Nemoto, T.K.
  • 雑誌名: Acta Med. Nagasaki. 巻: 58 ページ: 41-48
  • NAID: 110009614178
  • 査読あり
• [雑誌論文] Involvement of geranylgeranylation of Rho and Rac GTPases in adipogenic and RANKL expression, which was inhibited by simvastatin (2013)
  • 著者名/発表者名: Baba TT, Ohara-Nemoto Y, Miyazaki T, and Nemoto TK
  • 雑誌名: Cell Biochem Funct. 巻: 28 号: 8 ページ: 652-659
  • DOI: 10.1002/cbf.2951
  • 査読あり
• [学会発表] Oral bacteria and systemic diseases: Periodontopathic bacteria and type 2 diabetes mellitus (2015)
  • 著者名/発表者名: Ohara-Nemoto, Y., and Nemoto, T.K.
  • 学会等名: 1st Partnership Symposium of Nagasaki and Islamic Universities
  • 発表場所: Kushtia (Bangladesh)
  • 年月日: 2015-09-16
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Identification of exopeptidases expressed in periodontopathic bacteria, Porphyromonas gingivalis and Porphyromonas endodontalis (2015)
  • 著者名/発表者名: Nemoto, T.K., and Ohara-Nemoto, Y.
  • 学会等名: 1st Partnership Symposium of Nagasaki and Islamic Universities
  • 発表場所: Kushtia (Bangladesh)
  • 年月日: 2015-09-16
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] アシルオリゴペプチジルペプチダーゼ活性を有する歯周病原性細菌の新規ペプチダーゼ (2015)
  • 著者名/発表者名: 根本孝幸，根本優子
  • 学会等名: 第57回歯科基礎医学会学術大会・総会
  • 発表場所: 朱鷺メッセ（ 新潟市）
  • 年月日: 2015-09-11
• [学会発表] 非RI蛍光試薬によるPorphyromonas gingivalisのアミノ酸とジペプチドの取り込みの評価 (2015)
  • 著者名/発表者名: 小早川健，根本優子，馬場友巳，根本孝幸
  • 学会等名: 第57回歯科基礎医学会学術大会・総会
  • 発表場所: 朱鷺メッセ（ 新潟市）
  • 年月日: 2015-09-11
• [学会発表] Tannerella forsythia のジペプチジルペプチダーセ4の性状解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 中里茉那美，下山佑，根本優子，根本孝幸，高橋晋平，石河太知，佐々木実，八重柏隆，木村重信
  • 学会等名: 第57回歯科基礎医学会学術大会・総会
  • 発表場所: 朱鷺メッセ（ 新潟市）
  • 年月日: 2015-09-11
• [学会発表] 歯周病原性‘red complex species’のビルレンス因子としてのプロテアーゼ (2015)
  • 著者名/発表者名: 下山佑，中里茉那美，根本優子，根本孝幸，石河太知，八重柏隆，佐々木実，木村重信
  • 学会等名: 第69回 日本細菌学会東北支部総会
  • 発表場所: 郡山ビッグア（ 郡山市）
  • 年月日: 2015-08-21
• [学会発表] Towards the structural basis of peptide binding to dipeptidyl peptidases of Porphyromonas sp. (2015)
  • 著者名/発表者名: Bezerra, G. A., Ohara-Nemoto, Y., Nemoto, T.K., Djinovic-Carugo, K.
  • 学会等名: 2015 Annual Meeting - American Crystallographic Association
  • 発表場所: Philadelphia (USA)
  • 年月日: 2015-07-25
  • 国際学会
• [学会発表] Mechanism on oligomer-monomer transition of a novel oligopeptidase from periodontopathic bacterium. (2014)
  • 著者名/発表者名: 根本孝幸，小野俊雄，下山佑，木村重信，根本優子
  • 学会等名: 第87回日本生化学会大会
  • 発表場所: 国立京都国際会館・グランドプリンスホテル京都
  • 年月日: 2014-10-15 – 2014-10-17
• [学会発表] 歯周病原性細菌の新規オリゴペプチダーゼ：基質特異性と分子集合性 (2014)
  • 著者名/発表者名: 根本孝幸，根本優子，小野俊雄，下山佑，木村重信
  • 学会等名: 第56回歯科基礎医学会学術大会・総会
  • 発表場所: 福岡国際会議場
  • 年月日: 2014-09-25 – 2014-09-27
• [学会発表] SLPIによるPorphyromonas gingivalisに対する感染抑制作用 (2014)
  • 著者名/発表者名: 下山佑，石河太知，根本優子，根本孝幸，佐々木実，木村重信
  • 学会等名: 第56回歯科基礎医学会学術大会・総会
  • 発表場所: 福岡国際会議場
  • 年月日: 2014-09-25 – 2014-09-27
• [学会発表] Identification and Characterization of Dipeptidyl-Peptidase V as a Member for Dipeptide Production in Porphyromonas gingivalis. (2013)
  • 著者名/発表者名: 根本孝幸，ラオフ シャーク ムハマド アブデュー，根本優子，下山佑，木村重信
  • 学会等名: 第86回日本生化学会大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
• [学会発表] Porphyromonas endodontalisの発現するユニークなジペプチジルペプチダーゼ(DPP)VおよびDPP7. (2013)
  • 著者名/発表者名: 柳瀬絵美，根本優子，下山佑，木村重信，馬場友巳，根本孝幸
  • 学会等名: 第55回歯科基礎医学会学術大会・総会
  • 発表場所: 岡山コンベンションセンター（岡山県岡山市）
• [学会発表] Towards the structural basis of peptide binding to dipeptidyl peptidase 11 of Porphyromonas gingivalis. (2013)
  • 著者名/発表者名: Bezerra, G. A., Ohara-Nemoto, Y., Nemoto, T.K., Djinovic-Carugo, K.
  • 学会等名: Recent Advances in Macromolecular Crystallization
  • 発表場所: Le Bischenberg Conference Centre (Strasbourg, France）
• [学会発表] Dipeptide production in Porphyromonas gingivalis mediated by dipeptidyl peptidases and gingipains. (2013)
  • 著者名/発表者名: Ohara-Nemoto, Y., Abdur-Rouf, S. M., Shimoyama, Y., Kimura, S., and Nemoto, T. K.
  • 学会等名: 113rd General meeting of ASM
  • 発表場所: The Colorado Convention Center (Denver, USA)
• [学会発表] Distribution of Porphyromonas gingivalis fimA genotypes in the children’s plaques. (2013)
  • 著者名/発表者名: Shioyama, Y., Ohara-Nemoto, Y., Kimura, M., Sasaki, M., Tanaka, M., and Kimura, S.
  • 学会等名: 113rd General meeting of ASM
  • 発表場所: The Colorado Convention Center (Denver, USA)
• [備考] 原核生物で初めてジペプチジルペプチダーゼ５(DPP5)を発見
  • URL: http://www.nagasaki-u.ac.jp/ja/about/info/science/science71.html
• [備考] 長崎大 歯周病細菌で原核生物では初のDPP5を発見
  • URL: http://www.nagasaki-u.ac.jp/ja/about/info/science/science71.html
• [備考] 原核生物で初めてジペプチジルペプチダーゼ５(DPP5)を発見
  • URL: http://www.nagasaki-u.ac.jp/ja/about/info/science/science71.html
• [備考] 長崎大 歯周病細菌で原核生物では初のDPP5を発見
  • URL: http://www.qlifepro.com/news/20140319/gum-disease-bacteria-found-in-prokaryotic-dpp5s-first.html
• [備考] 長崎大 歯周病細菌で原核生物では初のDPP5を発見 - QLifePro医療ニュース
  • URL: http://buzz.news.yahoo.co.jp/article/7d8b598590aeb94d1a3e66b61b87fa6186aa632c/