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マルチオーミクス解析で解き明かすアカパンカビにおけるDNAメチル化の機能的意義

研究課題

研究課題/領域番号 25503001
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 エピジェネティクス
研究機関九州大学

研究代表者

三浦 史仁  九州大学, 医学研究院, 講師 (50447348)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2015年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2014年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2013年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワードNeurospora crassa / DNA methylation / Histone modification / オーミクス / DNAメチル化 / ヒストン修飾 / アカパンカビ / ヒストン翻訳後修飾 / WGBS / ChIP-Seq / RNA-Seq / エピゲノム / プロテオーム / ヒストン翻訳後化学修飾
研究成果の概要

アカパンカビにおけるDNAメチル化の存在意義を調べるため、野生株およびDNAメチル化状態に変化が生じていることが知られている3種類の変異株の間で比較解析を行った。全ゲノムバイサルファイトシークエンシング(WGBS)とクロマチン免疫沈降シークエンシング(ChIP-Seq)によりDNAメチル化とヒストンの翻訳後修飾状態を比較した。その結果、DNAのメチル化とヒストンの翻訳後修飾の一部の新しい相関関係が確認された。このことはヒストン修飾に対するDNAメチル化の新しい機能を示唆していた。

報告書

(5件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実施状況報告書
  • 2014 実施状況報告書
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2014 2013 その他

すべて 学会発表 (5件) 備考 (1件)

  • [学会発表] ヒストン脱アセチル化複合体HCHC構成因子の欠損がもたらすアカパンカビのエピゲノム変化2014

    • 著者名/発表者名
      池田 秀也, 小松 慶太, 三浦 史仁, 伊藤 隆司
    • 学会等名
      第37回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神奈川県横浜市
    • 年月日
      2014-11-25
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] アカパンカビのヒストン脱アセチル化複合体構成因子欠損がもたらすエピジェネティクスの変化2013

    • 著者名/発表者名
      池田秀也、小松慶太、三浦史仁、伊藤隆司
    • 学会等名
      第7回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      奈良県 奈良市公会堂
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] アカパンカビで見いだされたヌクレオソーム配置とDNAメチル化の新たな関係2013

    • 著者名/発表者名
      小松慶太、三浦史仁、伊藤隆司
    • 学会等名
      第7回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      奈良県 奈良市公会堂
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] アカパンカビのヒストン脱アセチル化複合体構成因子欠損がもたらすエピジェネティクスの変化2013

    • 著者名/発表者名
      池田秀也、小松慶太、三浦史仁、伊藤隆司
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      兵庫県 神戸コンベンションセンター
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] アカパンカビンにおけるDNAメチル化とヌクレオソーム構造の相関解析2013

    • 著者名/発表者名
      小松慶太、三浦史仁、伊藤隆司
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      兵庫県 神戸コンベンションセンター
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [備考] Simple Genome Browser

    • URL

      http://itolab.med.kyushu-u.ac.jp/cgi-bin/DesktopTracks/ikeda/Browser

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

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