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プライバシー保護バイオインフォマティクス基盤技術の開発と応用

研究課題

研究課題/領域番号 25540131
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 生命・健康・医療情報学
研究機関早稲田大学 (2014-2015)
東京大学 (2013)

研究代表者

浜田 道昭  早稲田大学, 理工学術院, 准教授 (00596538)

研究分担者 清水 佳奈  早稲田大学, 理工学術院, 准教授 (60367050)
連携研究者 花岡 悟一郎  独立行政法人産業技術総合研究所, 研究グループ長 (30415731)
津田 宏治  東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (90357517)
フリス マーティン  産業技術総合研究所, 人工知能研究センター, 主任研究員 (40462832)
浅井 潔  東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (30356357)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
2015年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2014年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2013年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
キーワードプライバシー保護 / 化合物検索 / アラインメント / 隠れマルコフモデル / PPDM / 配列アラインメント / 準同型暗号 / プライバシー / ゲノム / 化合物 / 暗号 / データベース検索 / 配列検索
研究成果の概要

個人のゲノム情報や薬のたねとなる化合物情報などは,機密情報として取り扱うことが必要となる.一方,オープンサイエンスの立場からは,これらの情報を積極的に利用して他の情報と合わせてデータマイニングを行うことが重要である.本研究では,これらの生物分野の重要情報を秘匿したまま様々なデータマイニングを行う方法論の開発を行った.具体的には,化合物データベースの秘匿検索,隠れマルコフモデルを用いたゲノム情報の秘匿検索,秘匿配列アラインメントの技術を開発した.

報告書

(4件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2016 2015 2013

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (3件) (うち招待講演 1件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Privacy-preserving search for chemical compound databases2015

    • 著者名/発表者名
      Kana Shimizu, Koji Nuida, Hiromi Arai, Shigeo Mitsunari, Nuttapong Attrapadung, Michiaki Hamada, Koji Tsuda, Takatsugu Hirokawa, Jun Sakuma, Goichiro Hanaoka, Kiyoshi Asai
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics

      巻: 16(Suppl 18):S6 号: S18 ページ: 1-14

    • DOI

      10.1186/1471-2105-16-s18-s6

    • NAID

      120007128511

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 疾患リスクの評価へ向けた加法準同型性暗号によるプライバシー保護HMMの実装と評価2016

    • 著者名/発表者名
      三品 気吹, 浜田道昭
    • 学会等名
      情報処理学会 第108回MPS・第46回BIO合同研究発表会
    • 発表場所
      沖縄
    • 年月日
      2016-07-04
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Privacy-preserving search for a chemical compound database2013

    • 著者名/発表者名
      Kana Shimizu, Hiromi Arai, Koji Nuida, Michiaki Hamada, Koji Tsuda, Jun Sakuma, Takatsugu Hirokawa, Goichiro Hanaoka, Kiyoshi Asai,
    • 学会等名
      ISMB/ECCB 2013
    • 発表場所
      ベルリン、ドイツ
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] 次世代バイオインフォマティクス技術の研究開発2013

    • 著者名/発表者名
      浜田道昭
    • 学会等名
      医薬会セミナー
    • 発表場所
      国立国際医療研究センター、東京都
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [図書] 生命情報処理における機械学習2016

    • 著者名/発表者名
      瀬々潤、浜田道昭
    • 出版者
      講談社
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書

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公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

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