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1細胞広範シーケンス技術に基づく、放射線の突然変異誘発率の計測

研究課題

研究課題/領域番号 25550030
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 放射線・化学物質影響科学
研究機関広島大学

研究代表者

金井 昭教  広島大学, 原爆放射線医科学研究所, 助教 (60549567)

研究分担者 河合 秀彦  広島大学, 原爆放射線医科学研究所, 助教 (30379846)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2014年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
2013年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワード放射線 / 次世代シーケンサー / 1細胞 / 1細胞シーケンス
研究成果の概要

1細胞広範シーケンス技術に基づく放射線の突然変異誘発率の測定を試みるべく、ヒトHT1080細胞を1細胞ずつ分注し、細胞に0.4 Gyと2 Gyのγ線照射を行った。細胞分裂を確認した後に照射・非照射群から1細胞ずつ単離した。単離した各1細胞からゲノムDNAを抽出し、MALBAC法を用いてDNAの増幅を行った。このようにして増幅したDNAをエクソン領域を濃縮しシーケンシングを行った。
0.4 Gy、2 Gy照射の各2細胞ずつを用いて解析を行ったところ、2 Gy照射では約7.5 Mbpに20個の変異と3個の挿入欠失を0.4 Gy照射では約14 Mbpに27個の変異を検出した。

報告書

(3件)
  • 2014 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2015 2014 2013

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (6件)

  • [雑誌論文] Haploinsufficiency of SAMD9L, an endosome fusion facilitator, causes myeloid malignancies in mice mimicking human diseases with monosomy 7.2013

    • 著者名/発表者名
      Nagamachi A
    • 雑誌名

      Cancer Cell

      巻: 24 号: 3 ページ: 305-317

    • DOI

      10.1016/j.ccr.2013.08.011

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Analysis of radiation induced mutations using next generation sequencer2015

    • 著者名/発表者名
      Akinori Kanai
    • 学会等名
      The 5th International Symposium of RIRBM
    • 発表場所
      広島市
    • 年月日
      2015-03-02 – 2015-03-03
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 次世代シーケンサーを用いた放射線誘発変異解析2014

    • 著者名/発表者名
      金井昭教、長町安希子、河合秀彦、松井啓隆、稲葉俊哉
    • 学会等名
      第37回日本分子生物学会
    • 発表場所
      横浜市
    • 年月日
      2014-11-25 – 2014-11-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 次世代シーケンサーを用いた放射線誘発変異解析2014

    • 著者名/発表者名
      金井昭教、長町安希子、河合秀彦、松井啓隆、稲葉俊哉
    • 学会等名
      日本放射線影響学会第57回大会
    • 発表場所
      鹿児島市
    • 年月日
      2014-10-01 – 2014-10-03
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 次世代シーケンサーを用いた放射線誘発変異解析2014

    • 著者名/発表者名
      金井昭教、長町安希子、河合秀彦、松井啓隆、稲葉俊哉
    • 学会等名
      第39回中国地区放射線影響研究会
    • 発表場所
      広島市
    • 年月日
      2014-07-18
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 次世代シーケンサーを用いた放射線誘発変異解析2014

    • 著者名/発表者名
      金井昭教、長町安希子、河合秀彦、松井啓隆、稲葉俊哉
    • 学会等名
      第55回原子爆弾後障害研究会
    • 発表場所
      長崎市
    • 年月日
      2014-06-01
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 次世代シーケンサーを用いた放射線誘発変異解析2013

    • 著者名/発表者名
      金井昭教
    • 学会等名
      放射線影響学会
    • 発表場所
      クラウンパレス青森(青森県)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書

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公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

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