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SERS_DNAシーケンサの創生

研究課題

研究課題/領域番号 25600049
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 ナノバイオサイエンス
研究機関大阪大学 (2013, 2015)
早稲田大学 (2014)

研究代表者

山口 佳則  大阪大学, 工学(系)研究科(研究院), 教授 (20386634)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2015年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2014年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2013年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワードDNAシーケンサ / 表面増強ラマン散乱 / マイクロチップ / 普及型DNAシーケンサ / ナノ剣山増強ラマンデバイス / ナノ剣山 / DNAシーケンサー / 普及型DNAシーケンサー
研究成果の概要

本課題では、表面増強ラマン散乱分光法を用いてDNA配列を決定できるDNAシーケンサを創生するための基礎実験を行った。ホットスポットと呼ばれるナノ構造を持つプラズモン基板を新規に設計、作製し、そのホットスポット表面でのDNA塩基のひとつであるアデニンの表面増強ラマン散乱の測定に成功した。アデニンの一分子がプラズモン基板のホットスポットによって活性化されることによって検出されるブリンキングと呼ばれる表面増強ラマン散乱について濃度依存があることを発見した。本研究によって、新規に作成したプラズモン基板を用いてDNA塩基の一分子測定が可能であることが明らかとなった。

報告書

(4件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2016 2015 2014 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (12件) (うち国際共著 5件、 査読あり 12件、 謝辞記載あり 7件、 オープンアクセス 2件)

  • [国際共同研究] 華東理工大学/理学研究科(中国)

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [国際共同研究] 上海理工大学/光電信息研究院(中国)

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [雑誌論文] Capillary electrophoresis of RNA in hydroxyethylcellulose polymer with various molecular weights.2016

    • 著者名/発表者名
      Zhenqing Li, Chenchen Liu, Dawei Zhang, Yoshinori Yamaguchi
    • 雑誌名

      Journal of Chromatography B

      巻: 1011 ページ: 114-120

    • DOI

      10.1016/j.jchromb.2015.12.057

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Electrophoresis of Periodontal Pathogens in Poly (ethyleneoxide) Solutions with Uncoated Capillary2015

    • 著者名/発表者名
      Zhenqing Li, Ronglin Yang, Q Wang, Dawei Zhang, Songlin Zhuang, Yoshinori Yamaguchi
    • 雑誌名

      Analytical Biochemistry

      巻: 471 ページ: 70-72

    • DOI

      10.1016/j.ab.2014.11.002

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Polyethylene Oxide (PEO) and Polyethylene Glycol (PEG) Polymer Sieving Matrix for RNA Capillary Electrophoresis2015

    • 著者名/発表者名
      Yoshinori Yamaguchi, Zhenqing Li, Xifang Zhu, Chenchen Liu, Dawei Zhang, Xiaoming Dou
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 10(6) 号: 5 ページ: e0123406-e0123406

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0123406

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Analysis of small interfering RNA by capillary electrophoresis in hydroxyethylcellulose solutions2015

    • 著者名/発表者名
      Chenchen Liu, Yoshinori Yamaguchi, Xifang Zhu, Zhenqing Li, Yi Ni, Xaoming Dou
    • 雑誌名

      Electrophoresis

      巻: 36 号: 14 ページ: 1651-1657

    • DOI

      10.1002/elps.201500018

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Time-lapse Raman imaging of osteoblast differentiation2015

    • 著者名/発表者名
      Aya Hashimoto, Yoshinori Yamaguchi, Liang-da Chiu, Chiaki Morimoto, Katsumasa Fujita, Masahide Takedachi, Satoshi Kawata, Shinya Murakami, Eiichi Tamiya
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 5 号: 1 ページ: 12529-12529

    • DOI

      10.1038/srep12529

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Activation energy of the Belousov– Zhabotinsky reaction in a gel with Fe(bpy)3 catalyst2014

    • 著者名/発表者名
      Yusuke Hara, Yoshinori Yamaguchi, Hiroyuki Mayama, Kenji Fujimoto
    • 雑誌名

      Chemistry Letters

      巻: 43 ページ: 673-675

    • NAID

      130004868109

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Quantification of Periodontal Pathogens Cell Counts by Capillary Electrophoresis2014

    • 著者名/発表者名
      Zhenqing Li, Shaoxiong Chen, Chenchen Liu, Dawei Zhang, Xiaoming Dou, Yoshinori Yamaguchi
    • 雑誌名

      Journal of Chromatography A

      巻: 1361 ページ: 286-290

    • DOI

      10.1016/j.chroma.2014.07.100

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Determination and quantification of Escherichia coli by capillary electrophoresis2014

    • 著者名/発表者名
      Zhenqing Li, De Li, Dawei Zhang, Yoshinori Yamaguchi
    • 雑誌名

      Analyst

      巻: 139 号: 23 ページ: 6113-6117

    • DOI

      10.1039/c4an01649a

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Electromigration behavior of nucleic acids in capillary electrophoresis under pulsed-field conditions2014

    • 著者名/発表者名
      Zhenqing Li, Chenchen Liu, Xiaoming Dou, Yi Ni, Jiaxuan Wang, Yoshinori Yamaguchi
    • 雑誌名

      Journal of Chromatography A

      巻: 1331 ページ: 100-107

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Capillary electrophoresis of wide range DNA fragments in mixed solution of hydroxyethyl cellulose2014

    • 著者名/発表者名
      Zhenqing Li, Chenchen Liu, Yoshinori Yamaguchi, Yi Ni, Qingxiang You, Xiaoming Dou
    • 雑誌名

      Analytical Methods

      巻: 6 号: 8 ページ: 2473-2477

    • DOI

      10.1039/c3ay41965g

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] In situ Raman imaging of osteoblastic mineralization2014

    • 著者名/発表者名
      Aya Hashimoto, Liang-da Chiu, Keigo Sawada, Katsumasa Fujita, Masahide Takedachi, Yoshinori Yamaguchi, Satoshi Kawata, Shinya Murakami, Eiichi Tamiya
    • 雑誌名

      Journal of Raman Spectroscopy

      巻: 45 号: 2 ページ: 157-161

    • DOI

      10.1002/jrs.4438

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Switching the Belousov-Zhabotinsky reaction with a Strong-Acid-Free Gel2014

    • 著者名/発表者名
      Y. Hara, Y. Yamaguchi, H. Mayama
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B

      巻: 118 号: 2 ページ: 634-638

    • DOI

      10.1021/jp410915p

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり

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公開日: 2014-07-25   更新日: 2022-01-31  

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