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RNAならびにRNA-タンパク質複合体を対象とするRNA診断法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 25620132
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 生体関連化学
研究機関京都工芸繊維大学

研究代表者

村上 章  京都工芸繊維大学, 工芸科学研究科, 教授 (60210001)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
2014年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2013年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワードRNA診断 / 非コードRNA / miRNA / RISC / ピレンプローブ / 均一系蛍光検出 / 均一溶液系蛍光検出 / RNAプローブ / 蛍光分析 / 選択的スプライシング / FRET
研究成果の概要

ヒトゲノムプロジェクトは遺伝子発現機構が、従来の認識を遙かに超え複雑であることを明らかにした。特に、種々の難治性疾患の原因としてRNAに着目する必然性が浮上した。本研究では、RNAの機能と疾患との関係を明らかにする上で必須である、RNAの選択的高感度検出法(RNA診断法)の開発を行った。その結果、(1)特定の配列を持つRNAを無細胞系、生細胞系で高感度に検出する蛍光分析法を確立し、例として筋ジストロフィ症発症に関わるRNA異常の新規診断法を提案した。(2)RNAとタンパク質との複合体の遺伝子制御機能に着目し、生細胞中での検出法を開発した。これらの結果は、難病治療法開発に大きく寄与すると考える。

報告書

(3件)
  • 2014 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (37件)

すべて 2015 2014 2013

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 3件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (30件) (うち招待講演 1件) 図書 (2件) 産業財産権 (1件) (うち外国 1件)

  • [雑誌論文] Functional regulation of RNA-induced silencing complex by photoreactive oligonucleotides2014

    • 著者名/発表者名
      Matsuyama, Y., Yamayoshi, A.*, Kobori, A., Murakami A.
    • 雑誌名

      Bioorg Med Chem

      巻: 22 号: 3 ページ: 1003-1007

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2013.12.044

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書 2013 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Novel photodynamic effect of psoralen-conjugated oligonucleotides for discrimination of methylation of cytosine in DNA2014

    • 著者名/発表者名
      Yamayoshi, A.*, Matsuyama, Y., Kushida, M., Kobori, A., Murakami A.
    • 雑誌名

      Photochemistry and Photobiology

      巻: 90 号: 3 ページ: 716-722

    • DOI

      10.1111/php.12232

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Rate-adjusted cross-linking reaction by photoresponsive -bromoaldehyde(PBA)-conjugated ODN2013

    • 著者名/発表者名
      Kobori A., Nagae Y., Sugihara X., Yamayoshi A., Murakami A
    • 雑誌名

      Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters

      巻: 3 号: 21 ページ: 5875-5828

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2013.08.100

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書 2013 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Dual-fluorescent RNA probes with extremely large Stokes shifts.2013

    • 著者名/発表者名
      Kobori A., Ueda T., Sanada Y., Yamayoshi A., Murakami A
    • 雑誌名

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry,

      巻: 77 ページ: 1117-1119

    • NAID

      10031177609

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] RISC機能の制御を目指した遺伝子発現制御素子の開発(II) RISCからのmicroRNA解離効果にアンチセンス核酸の化学構造が及ぼす影響2015

    • 著者名/発表者名
      有吉純平、栄森奈緒、中村裕未、小堀哲生、村上 章、山吉麻子
    • 学会等名
      日本化学会第95春季年会
    • 発表場所
      日本大学 理工学部船橋キャンパス
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] RISCの機能制御を目指した人工機能性核酸の開発2014

    • 著者名/発表者名
      有吉純平、山吉麻子、栄森奈緒、小堀哲生、村上章
    • 学会等名
      第37回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2014-11-25 – 2014-11-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] RISC機能の制御を目指した人工機能性核酸の開発2014

    • 著者名/発表者名
      山吉麻子、栄森奈緒、有吉純平、小堀哲生、村上章
    • 学会等名
      第37回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2014-11-25 – 2014-11-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] RISCと化学修飾核酸の結合親和性の評価2014

    • 著者名/発表者名
      中村裕未、松山洋平、小西 諒、小堀哲生、村上章、山吉麻子
    • 学会等名
      第37回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2014-11-25 – 2014-11-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Development of novel RISC inhibitors for promoting release of microRNA from RISC2014

    • 著者名/発表者名
      有吉純平、山吉麻子、栄森奈緒、小堀哲生、村上章
    • 学会等名
      ISNAC2014
    • 発表場所
      北九州国際会議場
    • 年月日
      2014-11-05 – 2014-11-07
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] RNA-diagnosis of alternative splicing by homogeneous fluorescence assay2014

    • 著者名/発表者名
      村上章、中嶋康介、西村茜、小堀哲生、山吉麻子、松尾雅文
    • 学会等名
      ISNAC2014
    • 発表場所
      北九州国際会議場
    • 年月日
      2014-11-05 – 2014-11-07
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] RISCのmicroRNA保持機構に着目した遺伝子制御素子の開発2014

    • 著者名/発表者名
      山吉麻子、有吉純平、松山洋平、小堀哲生、村上 章
    • 学会等名
      第8回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      岡山大学 津島キャンパス
    • 年月日
      2014-09-11 – 2014-09-13
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] RISC機能の制御を目指した機能性分子の開発(Ⅰ)2014

    • 著者名/発表者名
      有吉純平、山吉 麻子、栄森奈緒、小堀哲生、村上章
    • 学会等名
      第8回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      岡山大学 津島キャンパス
    • 年月日
      2014-09-11 – 2014-09-13
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] RISC活性の制御を目指した機能性核酸の開発(Ⅰ)2014

    • 著者名/発表者名
      有吉純平、山吉麻子、栄森奈緒、小堀哲生、村上 章
    • 学会等名
      アンチセンス・遺伝子デリバリーシンポジウム2014
    • 発表場所
      東京医科歯科大学 M&Dタワー
    • 年月日
      2014-09-07 – 2014-11-08
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Mature-microRNAを標的とした機能性分子の設計指針2014

    • 著者名/発表者名
      山吉麻子、有吉純平、松山洋平、栄森奈緒、小堀哲生、村上章
    • 学会等名
      アンチセンス・遺伝子デリバリーシンポジウム2014
    • 発表場所
      東京医科歯科大学 M&Dタワー
    • 年月日
      2014-09-07 – 2014-09-08
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Ts'0先生との出会いとアンチセンス2014

    • 著者名/発表者名
      村上 章
    • 学会等名
      アンチセンスDNA/RNA研究会特別シンポジウム
    • 発表場所
      東京ガーデンパレス
    • 年月日
      2014-09-06
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 人工核酸によるnon-coding RNAの機能を阻害する分子の設計指針2014

    • 著者名/発表者名
      山吉麻子、有吉純平、松山洋平、小堀哲生、村上 章
    • 学会等名
      第24回 バイオ・高分子シンポジウム
    • 発表場所
      東京工業大学大岡山キャンパス
    • 年月日
      2014-07-24 – 2014-07-25
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 人工核酸によるnon-coding RNAの機能制御(Ⅳ)2014

    • 著者名/発表者名
      有吉純平、山吉麻子、栄森奈緒、小堀哲生、村上章
    • 学会等名
      第24回 バイオ・高分子シンポジウム
    • 発表場所
      東京工業大学大岡山キャンパス
    • 年月日
      2014-07-24 – 2014-07-25
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] RISCから機能性コア分子であるmicroRNAを解離させる新規核酸素子の設計指針2014

    • 著者名/発表者名
      有吉純平、山吉麻子、栄森奈緒、小堀哲生、村上章
    • 学会等名
      第63回高分子学会年次大会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場
    • 年月日
      2014-05-27 – 2014-05-29
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Homogeneous Fluorescence Assayによる選択的スプライシングの解析2014

    • 著者名/発表者名
      村上章、中嶋康介、川合雅幸、古山 紘太、山吉 麻子、小堀 哲生
    • 学会等名
      第61回 日本生化学会近畿支部例会
    • 発表場所
      京都産業大学 神山ホール
    • 年月日
      2014-05-17
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] RNAの一塩基変異を識別するFRETシステムの開発2014

    • 著者名/発表者名
      川合雅幸・中嶋康介・上田貴子・山吉麻子・小堀哲生・村上 章
    • 学会等名
      日本化学会第94春季年会
    • 発表場所
      名古屋大学東山キャンパス
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] RISC機能の制御を目指した遺伝子制御素子の開発(I) RISCのmicroRNA保持機構の阻害を狙ったペプチドコンジュゲート核酸の開発2014

    • 著者名/発表者名
      有吉純平・山吉麻子・栄森奈緒・小堀哲生・村上 章
    • 学会等名
      日本化学会第94春季年会
    • 発表場所
      名古屋大学東山キャンパス
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] RISC機能の制御を目指した遺伝子制御素子の開発(II) 遺伝子制御素子の化学構造がRISC機能阻害効果に及ぼす影響2014

    • 著者名/発表者名
      山吉麻子・中村裕未・松山洋平・小堀哲生・村上 章
    • 学会等名
      日本化学会第94春季年会
    • 発表場所
      名古屋大学東山キャンパス
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Homogeneous Fluorescence Assayによる選択的スプライシングの解析2014

    • 著者名/発表者名
      村上 章・中嶋康介・川合雅幸・古山紘太・山吉麻子・小堀哲生
    • 学会等名
      日本化学会第94春季年会
    • 発表場所
      名古屋大学東山キャンパス
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] microRNA保持機構の阻害を狙った新規RISC機能制御分子の開発2013

    • 著者名/発表者名
      山吉麻子・有吉純平・小堀哲生・村上 章
    • 学会等名
      第23回バイオ・高分子シンポジウム
    • 発表場所
      東京工業大学大学・大岡山キャンパス
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] In vitro RNAi系を用いたRISCとアンチセンス核酸との結合親和性の評価2013

    • 著者名/発表者名
      松山洋平・山吉麻子・小堀哲生・村上 章
    • 学会等名
      第23回バイオ・高分子シンポジウム
    • 発表場所
      東京工業大学大学・大岡山キャンパス
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] 蛍光タンパク質の蛍光団を塩基部に導入した光応答性核酸の合成と機能評価2013

    • 著者名/発表者名
      小堀哲生・坂田優也・笠井拓歩・山吉麻子・村上 章
    • 学会等名
      第23回バイオ・高分子シンポジウム
    • 発表場所
      東京工業大学大学・大岡山キャンパス
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] microRNAを標的とする機能性核酸の新しい分子設計指針2013

    • 著者名/発表者名
      山吉麻子・松山洋平・小堀哲生・村上 章
    • 学会等名
      第62回高分子討論会
    • 発表場所
      金沢大学角間キャンパス
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] New design principal of inhibitors targeting microRNA from binding behaviors of antisense oligonucleotides with RISC(I) Evaluation of binding affinities between RISC and artificial oligonucleotides by native agarose gel system2013

    • 著者名/発表者名
      山吉麻子・松山洋平・小堀哲生・村上 章
    • 学会等名
      ISNAC 2013
    • 発表場所
      神奈川大学
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] New design principal of inhibitors targeting microRNA from binding behaviors of antisense oligonucleotides with RISC(II) New insights for regulation of RISC function by antisense oligonucleotides2013

    • 著者名/発表者名
      松山洋平・山吉麻子・小堀哲生・村上 章
    • 学会等名
      ISNAC 2013
    • 発表場所
      神奈川大学
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Structural insights for design of inhibitors targeting microRNA2013

    • 著者名/発表者名
      有吉純平・山吉麻子・小堀哲生・村上 章
    • 学会等名
      ISNAC 2013
    • 発表場所
      神奈川大学
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] RISC機能の制御を目指した遺伝子制御素子の開発2013

    • 著者名/発表者名
      山吉麻子・中村裕未・松山洋平・小堀哲生・村上 章
    • 学会等名
      第23回 アンチセンスシンポジウム
    • 発表場所
      徳島大学大塚講堂
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] RISCのガイド鎖保持機構の阻害を狙ったペプチドコンジュゲート核酸の開発2013

    • 著者名/発表者名
      有吉純平・山吉麻子・小堀哲生・村上 章
    • 学会等名
      第23回 アンチセンスシンポジウム
    • 発表場所
      徳島大学大塚講堂
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Homogeneous Fluorescence Assayによる選択的スプライシングの解析2013

    • 著者名/発表者名
      村上 章・中嶋康介・川合雅幸・古山紘太・山吉麻子・小堀哲生
    • 学会等名
      第23回 アンチセンスシンポジウム
    • 発表場所
      徳島大学大塚講堂
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] In vitro RNAisystemを用いたRISC-アンチセンス核酸の相互作用解析2013

    • 著者名/発表者名
      松山洋平・山吉麻子・小堀哲生・村上 章
    • 学会等名
      第23回 アンチセンスシンポジウム
    • 発表場所
      徳島大学大塚講堂
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [図書] Photoregulation of DNA/RNA functions2015

    • 著者名/発表者名
      Yamayoshi A, Kobori A, Murakami A
    • 出版者
      Pan Stanford Publishing Pte. Ltd.
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [図書] Curr Protoc Nucleic Acid Chem2014

    • 著者名/発表者名
      Kobori A, Yamayoshi A, Murakami A
    • 出版者
      Wiley Interscience
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [産業財産権] RNA分析チップおよびRNA分析方法2015

    • 発明者名
      村上章、小堀哲生、山吉麻子、野田雄一郎、近藤正幸
    • 権利者名
      村上章、小堀哲生、山吉麻子、野田雄一郎、近藤正幸
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2015-010639
    • 出願年月日
      2015-01-22
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 外国

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公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

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