染色体特異的にクラスターを形成しているトラップジーン（CSCT）の解析

• 研究課題/領域番号: 25640052
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 実験動物学
• 研究機関: 熊本大学
• 研究代表者: 荒木 正健 熊本大学, 生命資源研究・支援センター, 准教授 (80271609)
• 研究分担者: 荒木 喜美 熊本大学, 生命資源研究・支援センター, 教授 (90211705)
• 研究協力者: 吉信 公美子 熊本大学, 生命資源研究・支援センター, 助教 (20274730)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円); 2015年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円); 2014年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2013年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
• キーワード: 遺伝子トラップ / CSCT / EGTC / ゲノム編集 / 染色体相同組換え / 減数分裂 / クラスター遺伝子 / 染色体特異的 / マウス

研究成果の概要

我々は染色体特異的にクラスターを形成しているトラップ領域（CSCT）を発見した。ゲノム編集技術を用いてCSCT13領域全体（1.6 Mbp）を欠損したクローン（ΔCSCT13）を得ることができ、このES細胞からマウスラインを樹立することができた。ホモ接合体同士の交配で得られる産仔は極端に少なく、また、減数分裂時の染色体相同組換えへの影響評価を行ったところ、1Mbpあたりの組換え率は、CSCT13を欠損すると、CSCT13を含む領域では減少し、その周辺の領域では上昇した。
本研究より、CSCT13は初期発生及び減数分裂時の染色体相同組換えに関与している可能性が示唆された。

研究成果

• [雑誌論文] GNAS and Kras cooperate to promote murine pancreatic tumorigenesis recapitulating human intraductal papillary mucinous neoplasm. (2016)
  • 著者名/発表者名: Taki, K., Ohmuraya, M., Tanji, E., Komatsu, H., Hashimoto, D., Semba, K., Araki, K., Kawaguchi, Y., Baba, H. and Furukawa, T.
  • 雑誌名: Oncogene 巻: in press 号: 18 ページ: 1-6
  • DOI: 10.1038/onc.2015.294
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] The importance of basonuclin 2 in adult mice and its relation to basonuclin 1. (2016)
  • 著者名/発表者名: Vanhoutteghem A, Delhomme B, Hervé F, Nondier I, Petit JM, Araki M, Araki K, Djian P.
  • 雑誌名: Mechanisms of Development 巻: Feb 29 ページ: 1-21
  • DOI: 10.1016/j.mod.2016.02.002
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Severe ocular phenotypes in Rbp4-deficient mice in the C57BL/6 genetic background. (2016)
  • 著者名/発表者名: Shen, J., Shi, D., Suzuki, T., Xia, Z., Zhang, H., Araki, K., Wakana, S., Takeda, N., Yamamura, K., Jin, S. and Li. Z.
  • 雑誌名: Lab. Invest. 巻: in press 号: 6 ページ: 1-12
  • DOI: 10.1038/labinvest.2016.39
  • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Rad18 confers hematopoietic progenitor cell DNA damage tolerance independently of the Fanconi Anemia pathway in vivo. (2016)
  • 著者名/発表者名: Yang, Y., Poe, J. C., Yang, L., Fedoriw, A., Desai, S., Magnuson, T., Li, Z., Fedoriw, Y., Araki, K., Gao, Y., Tateishi, S., Sarantopoulos, S. and Vaziri, C.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: February 15 号: 9 ページ: 1-15
  • DOI: 10.1093/nar/gkw072
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Pathophysiological significance of the two-pore domain K(+) channel K2P5.1 in splenic CD4(+)CD25(-) T cell subset from a chemically-induced murine inflammatory bowel disease model. (2015)
  • 著者名/発表者名: Nakakura S, Matsui M, Sato A, Ishii M, Endo K, Muragishi S, Murase M, Kito H, Niguma H, Kurokawa N, Fujii M, Araki M, Araki K, Ohya S.
  • 雑誌名: Frontiers in Physiology 巻: 6 ページ: 299-299
  • DOI: 10.3389/fphys.2015.00299
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] SPINK1 Status in Colorectal Cancer, Impact on Proliferation, and Role in Colitis-associated Cancer. (2015)
  • 著者名/発表者名: Ida S, Ozaki N, Araki K, Hirashima K, Zaitsu Y, Taki K, Sakamoto Y, Miyamoto Y, Oki E, Morita M, Watanabe M, Maehara Y, Yamamura KI, Baba H Professor, Ohmuraya M.
  • 雑誌名: Molecular Cancer Research 巻: - 号: 7 ページ: 1130-8
  • DOI: 10.1158/1541-7786.mcr-14-0581
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Conformational change in transfer RNA is an early indicator of acute cellular damage (2014)
  • 著者名/発表者名: Mishima E, Inoue C, Saigusa D 他33名中13番目
  • 雑誌名: J Am Soc Nephrol. 巻: 25 号: 10 ページ: 2316
  • DOI: 10.1681/asn.2013091001
  • URL: https://localhost/en/publications/410de6f4-555d-4a99-afa3-8b9d882657e3
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] NRBF2 Regulates Autophagy and Prevents Liver Injury by Modulating Atg14L-Linked Class III Phosphatidylinositol-3 Kinase Activity. (2014)
  • 著者名/発表者名: Lu, J., He, L., Behrends, C., Araki, M., Araki, K., Jun Wang, Q., Catanzaro, J. M., Friedman, S. L., Zong, W. X., Fiel, M. I., Li, M. and Yue, Z.
  • 雑誌名: Nat. Commun. 巻: 5 号: 1 ページ: 3920-3920
  • DOI: 10.1038/ncomms4920
  • 査読あり
• [雑誌論文] Disruption of Mbd5 in mice causes neuronal functional deficits and neurobehavioral abnormalities consistent with 2q23.1 microdeletion syndrome. (2014)
  • 著者名/発表者名: Camarena, V., Cao, L., Abad, C., Abrams, A., Toledo, Y., Araki, K., Araki, M., Walz, K. and Young, J. I.
  • 雑誌名: EMBO Mol. Med. 巻: 6 号: 8 ページ: 1003-1015
  • DOI: 10.15252/emmm.201404044
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Autophagy regulation in the pancreatic acinar cells is independent of epidermal growth factor receptor signaling. (2014)
  • 著者名/発表者名: Ozaki, N., Fukuchi, Y., Tomiyoshi, S., Uehara1, H., Ida, S., Wang, J., Kimi Araki, K., Sibilia, M., Baba, H., and Yamamura, K. and Ohmuraya, M.
  • 雑誌名: Biochem. Biophysic. Res. Comm. 巻: 446 号: 1 ページ: 224-230
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2014.02.111
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] The intramembrane proteases Signal-peptide-peptidase-like 2a and b (SPPL2a/b) have distinct functions in vivo. (2014)
  • 著者名/発表者名: Schneppenheim, J., Hutti, S., Mentrup, T., Lullmann-Rauch, R., Rothaug, M., Engelke, M., Dittmann, K., Dressel, R., Araki, M., Araki, K., Wienands, J., Fluhrer, R., Saftig, P. and Schroder, B.
  • 雑誌名: Mol. Cell. Biol. 巻: 34 (8) ページ: 1398-1411
  • 査読あり
• [雑誌論文] Database for exchangeable gene trap clones: Pathway and gene ontology analysis of exchangeable gene trap clone mouse lines. (2014)
  • 著者名/発表者名: Araki, M., Nakahara, M., Muta, M., Itou, M., Yanai, C., Yamazoe, F., Miyake, M., Morita, A., Araki, M., Okamoto, Y., Nakagata, N., Yoshinobu, K., Yamamura, K. and Araki, K.
  • 雑誌名: Dev. Growth Diffr. 巻: 56 (2) ページ: 161-174
  • NAID: 40019987325
  • 査読あり
• [雑誌論文] VMAT2 identified as a regulator of late-stage beta-cell differentiation. (2014)
  • 著者名/発表者名: Sakano, D., Shiraki, N., Kikawa, K., Yamazoe, T., Kataoka, M., Umeda, K., Araki, K., Mao, D., Matsumoto, S., Nakagata, N., Anderson, O., Stainier, D., Endo, F., Kume, K., Uesugi, M. and Kume, S.
  • 雑誌名: Nat. Chem. Biol. 巻: 10 (2) ページ: 141-148
  • 査読あり
• [雑誌論文] Generation and analysis of serine protease inhibitor kazal type 3-cre driver mice. (2014)
  • 著者名/発表者名: Sakata, K., Ohmuraya, M., Araki, K., Suzuki, C., Ida, S., Hashimoto, D., Wang, J., Uchiyama, Y., Baba, H. and Yamamura, K.
  • 雑誌名: Exp. Anim. 巻: 63 (1) ページ: 45-53
  • NAID: 130003391605
  • 査読あり
• [雑誌論文] Interaction of CD99 with its paralog CD99L2 positively regulates CD99L2 trafficking to cell surfaces. (2013)
  • 著者名/発表者名: Nam, G., Lee, YK., Lee, HY., Ma, MJ., Araki, M., Araki, K., Lee, S., Lee, IS. and Choi, EY.
  • 雑誌名: J. Immunol. 巻: 191 (11) ページ: 5730-5742
  • 査読あり
• [雑誌論文] TASK-2: a K2P K(+) channel with complex regulation and diverse physiological functions. (2013)
  • 著者名/発表者名: Cid, LP., Roa-Rojs, HA., Niemeyer, MI., Gonzalez, W., Araki, M., Araki, K. and Sepulveda, FV.
  • 雑誌名: Front Physiol. 巻: 29 July ページ: 198-198
  • 査読あり
• [雑誌論文] HOT1 is a mammalian direct telomere repeat-binding protein contributing to telomerase recruitment. (2013)
  • 著者名/発表者名: Kappel, D., Butter, F., Benda, C., Schelbe, M., Draskovic, I., Stevense, M., Novo, CL., Basquin, C., Araki, M., Araki, K., Krastev, DB., Kittler, R., Jessberger, R., Londofio-Vallejo, JA., Mann, M. and Buchholz, F.
  • 雑誌名: EMBO J. 巻: 32 (12) ページ: 1681-1701
  • 査読あり
• [雑誌論文] Gene-trap mutagenesis using Mol/MSM-1 embryonic stem cells from MSM/Ms mice. (2013)
  • 著者名/発表者名: Nakahara, M., Tateyama, H., Araki, M., Nakagata, N., Yamamura, K. and Araki, K.
  • 雑誌名: Mamm. Genome 巻: 24 ページ: 228-239
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ectopic Expression of Ptf1a Induces Spinal Defects, Urogenital Defects, and Anorectal Malformations in Danforth's Short Tail Mice. (2013)
  • 著者名/発表者名: Semba, K., Araki, K., Matsumoto, K., Suda, H., Ando, T. Sei, A., Mizuta, H., Takagi, K., Nakahara, M., Muta, M., Yamada, G., Nakagata, N., Iida, A., Ikegawa, S., Nakamura, Y., Araki, M., Abe, K. and Yamamura, K
  • 雑誌名: Plos Genetics 巻: 9
  • 査読あり
• [学会発表] GIRK2コンデイショナルKOマウスの作成とそのうつ様行動の解析：うつ様行動としての無動におけるGIRK2チャネルの役割 (2016)
  • 著者名/発表者名: 本多 幾多郎、荒木 喜美、本田 宗吉、高橋 大貴、副田 二三夫、三隅 将1、山村 研一、高濱 和夫
  • 学会等名: 第89回日本薬理学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2016-03-09
• [学会発表] 細胞死亢進マウスを用いた新たな代償性増殖に関与する因子の同定 (2015)
  • 著者名/発表者名: 鈴木俊哉、大村谷昌樹、駒沢幸子、三宅早苗、小池正人、内山安夫、荒木喜美、中野裕康
  • 学会等名: 第38回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-12-01
• [学会発表] lincRNAの生体内機能解析～遺伝子トラップマウスからのアプローチ～ (2015)
  • 著者名/発表者名: 吉信公美子、中原舞、山村研一、荒木喜美、荒木正健
  • 学会等名: 第38回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-12-01
• [学会発表] CHF5074 (CSP-1103)はTtrおよびRbp遺伝子座のダブルヒトマウスの血中ヒトTTR 4量体を安定化する (2015)
  • 著者名/発表者名: 李正花、荒木喜美、山村研一
  • 学会等名: 第38回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-12-01
• [学会発表] Gene-trap mutagenesis is useful for analysis of long intergenic non-coding RNA genes. (2015)
  • 著者名/発表者名: Nakahara, M., Yoshinobu, K., Ito, H., Furuhata, R., Yamamura, K., Araki, M. and Araki, K.
  • 学会等名: the 29th Annual Conference of the International Mammalian Genome Society
  • 発表場所: 横浜市開港記念会館（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2015-11-08
  • 国際学会
• [学会発表] Correlation of LincRNA-p21 and p53 expression in the LincRNA-p21 gene trap mouse (2015)
  • 著者名/発表者名: Furuhata, R., Nakahara, M., Ito, H., Yamamura, K., Araki, M. and Araki, K.
  • 学会等名: the 29th Annual Conference of the International Mammalian Genome Society
  • 発表場所: 横浜市開港記念会館（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2015-11-08
  • 国際学会
• [学会発表] Danforth's short tail (Sd) 変異はトランスポゾン挿入によって引き起こされたPtf1a 遺伝子の異所性発現が原因である (2015)
  • 著者名/発表者名: 荒木喜美、仙波 圭、中原舞、阿部訓也、荒木正健、山村研一
  • 学会等名: 日本遺伝学会第87回大会
  • 発表場所: 東北大学川内北キャンパス（宮城県仙台市）
  • 年月日: 2015-09-24
  • 招待講演
• [学会発表] 染色体特異的にクラスターを形成しているトラップ領域(CSCT13)の解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 武田伊世、大賀俊範、荒木美幸、岡本頼幸、吉信公美子、荒木喜美、荒木正健
  • 学会等名: 第２９回モロシヌス研究会
  • 発表場所: かんぽの宿 有馬（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-07-03
• [学会発表] Cre-driverマウスラインの樹立と解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 荒木美幸、國場訓、森田彩香、岡本頼幸、山村研一、來海葉子、吉信公美子、荒木正健、荒木喜美
  • 学会等名: 第２９回モロシヌス研究会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2015-07-03
• [学会発表] 遺伝子トラップマウスを用いたlincRNAの生体内機能解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 荒木正健、中原舞、柳井千佳、山添史雅、宮家幹子、森田彩香、岡本頼幸、荒木美幸、伊東春香、山村研一、吉信公美子、荒木喜美
  • 学会等名: 第62回日本実験動物学会総会
  • 発表場所: 京都テルサ（京都府京都市）
  • 年月日: 2015-05-28
• [学会発表] 遺伝子改変慢性膵炎モデルマウスではオートファジー不全とネクロプトーシスが誘導される (2015)
  • 著者名/発表者名: 大村谷昌樹、荒木喜美、山村研一
  • 学会等名: 第62回日本実験動物学会総会
  • 発表場所: 京都テルサ（京都府京都市）
  • 年月日: 2015-05-28
• [学会発表] CRISPR/Cas9による２本鎖切断・１本鎖節切断を利用した場合のマウスES細胞における相同組換え効率の比較 (2014)
  • 著者名/発表者名: 荒木喜美、牟田真由美、仙波圭、竹田直樹、仁木大輔、松本健、武田伊世、山村研一、大村谷昌樹、荒木正健
  • 学会等名: 第３７回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（横浜）
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] 可変型遺伝子トラップマウスラインのパスウェイ解析及びジーンオントロジー解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 荒木正健、中原舞、中潟直己、山村研一、吉信公美子、荒木喜美
  • 学会等名: 日本遺伝学会第８６回大会
  • 発表場所: 長浜バイオ大学（滋賀県長浜市）
  • 年月日: 2014-09-17 – 2014-09-19
• [学会発表] 遺伝子トラップマウスを用いたlincRNAの生体内機能解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 宮家幹子、森田彩香、柳井千佳、山添史雅、中原舞、荒木美幸、岡本頼幸、伊東春香、大西雄一朗、国場訓、山村研一、吉信公美子、荒木正健、荒木喜美
  • 学会等名: 第２８回モロシヌス研究会
  • 発表場所: 修善寺総合会館（静岡県伊豆市）
  • 年月日: 2014-06-27 – 2014-06-28
• [学会発表] Establishment and analysis of Cre-driver mouse line (2014)
  • 著者名/発表者名: 森田彩香、宮家幹子、荒木美幸、岡本頼幸、国場訓、大西雄一朗、山村研一、來海葉子、吉信公美子、荒木正健、荒木喜美
  • 学会等名: 第２８回モロシヌス研究会
  • 発表場所: 修善寺総合会館（静岡県伊豆市）
  • 年月日: 2014-06-27 – 2014-06-28
• [学会発表] 可変型遺伝子トラップクローンデータベース[EGTC]の開発と解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 荒木正健、中原舞、柳井千佳、山添史雅、宮家幹子、森田彩香、荒木美幸、岡本頼幸、中潟直己、吉信公美子、山村研一、荒木喜美
  • 学会等名: 第６１回日本実験動物学会総会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター（札幌）
  • 年月日: 2014-05-15 – 2014-05-17
• [学会発表] 可変型遺伝子トラップクローンを利用したCre-driverマウスの作製 (2013)
  • 著者名/発表者名: 荒木喜美、森田彩香、宮家幹子、吉信公美子、來海葉子、慶田貴子、古閑成美、中潟直己、村上亜弓、門田雅世、目加田和之、吉木淳、荒木正健
  • 学会等名: 第60回日本実験動物学会総会
  • 発表場所: つくば国際会議場
• [学会発表] Analysis of gene-trap mouse lines trapping long non-coding RNA genes. (Part 1) (2013)
  • 著者名/発表者名: 柳井千佳、山添史雅、中原舞、宮家幹子、森田彩香、荒木美幸、岡本頼幸、伊東春香、山村研一、吉信公美子、荒木正健、荒木喜美
  • 学会等名: 第27回モロシヌス研究会
  • 発表場所: 筑波山 江戸家
• [学会発表] Analysis of gene-trap mouse lines trapping long non-coding RNA genes. (Part 2) (2013)
  • 著者名/発表者名: 山添史雅、柳井千佳、中原舞、宮家幹子、森田彩香、荒木美幸、岡本頼幸、伊東春香、山村研一、吉信公美子、荒木正健、荒木喜美
  • 学会等名: 第27回モロシヌス研究会
  • 発表場所: 筑波山 江戸家
• [学会発表] 遺伝子トラップマウスを用いたlincRNAの機能解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 中原舞、山添史雅、柳井千佳、吉信公美子、山村研一、荒木正健、荒木喜美
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
• [学会発表] 可変型遺伝子トラップクローンの進展 (2013)
  • 著者名/発表者名: 吉信公美子、來海葉子、慶田貴子、古閑成美、中原舞、山村研一、荒木喜美、荒木正健
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
• [備考] EGTC
  • URL: http://egtc.jp
• [備考] EGTC
  • URL: http://egtc.jp