腫瘍ゲノム解析として転座・逆位を含む包括的構造解析を可能とする新規システムの開発

• 研究課題/領域番号: 25640078
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 腫瘍診断学
• 研究機関: 九州大学
• 研究代表者: 水野 晋一 九州大学, 先端医療イノベーションセンター, 准教授 (40569430)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円); 2014年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円); 2013年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
• キーワード: ゲノム解析 / ゲノム構造異常

研究成果の概要

腫瘍のゲノム解析は、原因遺伝子探索をはじめ腫瘍診断に重要な検査である。本研究では、包括的なゲノム構造解析を高精度に可能とする新規システムを開発し腫瘍解析へ応用した。本システムは環状化DNAの結合両末端（メイトペア）解析を基本とし、ゲノム・ライブラリーの各DNA断片へ固有塩基配列を導入し、シンプルな２段階DNA環状化を行うことで、「単分子DNA環状化」由来の正確なメイトペア配列のみをコンピューター（in silico）解析で選別可能とした新規法である。本システムは、腫瘍ゲノムの転座・逆位の解析も可能であり、経済性にも優れた方法であることから、腫瘍の診断・研究に役立つと期待される。

研究成果

• [雑誌論文] p600 Plays Essential Roles in Fetal Development (2014)
  • 著者名/発表者名: (*: equally contributed) *Nakaya T., *Ishiguro K., Belzil C., Rietsch A.M., Yu Q., Mizuno S., Bronson R.T., Geng Y., Nguyen M.D., Akashi K., Sicinski P., Nakatani Y.
  • 雑誌名: Plos One 巻: 8 号: 6 ページ: e66269-e66269
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0066269
  • 査読あり
• [雑誌論文] A case of 8p11 myeloproliferative syndrome with BCR-FGFR1 gene fusion presenting with trilineage acute leukemia/lymphoma, successfully treated by cord blood transplantation (2013)
  • 著者名/発表者名: Morishige S, Oku E, Mizuno S, Okamura T
  • 雑誌名: Acta Haematol 巻: 129 号: 2 ページ: 83-89
  • DOI: 10.1159/000341289
  • 査読あり
• [産業財産権] METHOD FOR PRODUCING CIRCULAR DNA FORMED FROM SINGLE-MOLECULE DNA (2013)
  • 発明者名: Mizuno, Nagafuji, Okamura
  • 権利者名: Mizuno, Nagafuji, Okamura
  • 産業財産権種類: 特許
  • 出願年月日: 2013-06-27
  • 取得年月日: 2015-02-24
  • 外国