概日リズムをモデル系に新規ポリA鎖長決定法を用いた翻訳制御プラットフォームの構築

• 研究課題/領域番号: 25640100
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: ゲノム生物学
• 研究機関: 金沢大学
• 研究代表者: 程 肇 金沢大学, 理工研究域自然システム学系, 教授 (00242115)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円); 2013年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
• キーワード: 概日リズム / 時計遺伝子 / 視交叉上核 / 翻訳制御 / Period1 / poly(A) / Peirod1 / Poly(A) / Lark

研究成果の概要

一般にmRNA のポリA 鎖長は不均一な分布をもち、その長さを簡便にかつ厳密に決定できる方法は現在ない。そこで従来のAnchored RT-PCR 法を改良して、PACHINCO (Poly(A) Capture by Hairpin Chimeric Oligonucleotide)-RT-PCR 法を構築した。この方法は遺伝子特異的5’PCR プライマーをゲノム全遺伝子のmRNA 3’UTR に対応させるだけで、全mRNA ポリA 鎖長をハイスループットに決定できる。実際、全自動型DNA 分析用マイクロチップ電気泳動装置を用いて、Per1 mRNA のポリA 鎖伸長を確認することができた。

研究成果

• [雑誌論文] Molecular assembly of the period-cryptochrome circadian transcriptional repressor complex。 (2014)
  • 著者名/発表者名: Nangle, SN., Rosensweig, C., Koike, N., Tei, H., Takahashi, JS., Green, CB., Zheng, N.
  • 雑誌名: Elife 巻: 3
  • DOI: 10.7554/elife.03674
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] 哺乳類時計遺伝子Rev-erbαの転写制御機構の解明 (2014)
  • 著者名/発表者名: 松浦知諒、高畑佳史、山田洋一、程 肇
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2014-11-27
• [学会発表] 哺乳類時計遺伝子Bmal1の新規転写制御機構の解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 大場祐希、松本健、高畑佳史、藤井義明、程 肇
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2014-11-26
• [学会発表] 時計遺伝子、転写・翻訳フィードバックループと概日リズム (2013)
  • 著者名/発表者名: 程 肇
  • 学会等名: 日本時間生物学会
  • 発表場所: 近畿大学
  • 招待講演