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土壌プロテオミクスによる自然環境下の細菌個生態学的研究

研究課題

研究課題/領域番号 25650139
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 生態・環境
研究機関北海道大学

研究代表者

笠原 康裕  北海道大学, 低温科学研究所, 准教授 (20273849)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2014年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2013年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
キーワードメタプロテオーム / 土壌細菌 / 個生態学
研究成果の概要

土壌細菌Pseudomonas putida F1株の土壌培養系と液体培養系の比較プロテオーム解析を行い、土壌環境特異的に発現する遺伝子の検出を行った。(1)F1株の接種土壌から直接法および間接法による環境タンパク質抽出を行い、タンパク質の同定数や種類の比較解析を行った。両手法に長所短所があり、研究目的により使い分ける必要がある。(2)土壌特異的発現遺伝子として5遺伝子で構成される1オペロンと2遺伝子を特定した。発現因子解析から、遺伝子の一つはNOによって発現した。オペロンの発現は、ある種の土壌成分の欠乏が誘導を促すことを見いだした。本研究より細菌が取り巻く微小環境を知ることが可能となった。

報告書

(3件)
  • 2014 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2014 2013

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (2件)

  • [雑誌論文] An essential enzyme for phospholipid synthesis has a crucial role in Bacillus subtilis cell division2014

    • 著者名/発表者名
      Hiraku Takada, Sanae Fukushima-Tanaka, Masato Morita, Yasuhiro Kasahara, Satoru Watanabe, Taku Chibazakura, and Hirofumi Yoshikawa
    • 雑誌名

      Mol Microbiol

      巻: 91(2) 号: 2 ページ: 242-255

    • DOI

      10.1111/mmi.12457

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Metaproteomic Identification of Diazotrophic Methanotrophs, and their Tissue Localization in Field-grown Rice Roots2014

    • 著者名/発表者名
      Bao, Z., T. Okubo, K. Kubota, Y. Kasahara, H. Tsurumaru, M. Anda, S. Ikeda, K. Minamisawa
    • 雑誌名

      Applied and Environmental Microbiology

      巻: 80 号: 16 ページ: 5043-5052

    • DOI

      10.1128/aem.00969-14

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Gene expression profiling of Pseudomonas putida F1 after exposure to aromatic hydrocarbon in soil by using proteome analysis2013

    • 著者名/発表者名
      H. Morimoto, M. Kuwano and Y. Kasahara
    • 雑誌名

      Archives of Microbiology

      巻: 195 号: 12 ページ: 805-813

    • DOI

      10.1007/s00203-013-0932-4

    • NAID

      120005522323

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 水稲根における窒素固定メタン酸化細菌のメタプロテオーム同定と組織局在性2014

    • 著者名/発表者名
      包智華、大久保卓、久保田健吾、笠原康裕、鶴丸博人、按田瑞恵、池田成志、南澤 究
    • 学会等名
      日本土壌肥料学会2014年度大会
    • 発表場所
      東京農工大学(東京都府中市)
    • 年月日
      2014-09-09 – 2014-09-11
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 根粒菌シグマ因子RpoH1の制御を受ける機能未知遺伝子の鉄硫黄タンパク質生合成へ の関与2014

    • 著者名/発表者名
      佐々木祥平、門屋亨介、笠原康裕、南澤究、三井久幸
    • 学会等名
      第8回日本ゲノム微生物学会
    • 発表場所
      東京農業大学(東京都世田谷区)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書

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公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

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