深海底に残るピロリ菌誕生過程の足跡：祖先型微生物と大型生物の網羅的相互作用解明

• 研究課題/領域番号: 25660146
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 水圏生産科学
• 研究機関: 京都大学 (2014-2015); 北海道大学 (2013)
• 研究代表者: 中川 聡 京都大学, (連合)農学研究科(研究院), 准教授 (70435832)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円); 2015年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2014年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円); 2013年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
• キーワード: 深海底熱水活動域 / 細胞外共生 / 環境応答 / マルチオミックス

研究成果の概要

本研究の目的は、深海底熱水活動域に見られる特異な『細胞外共生微生物とそのホスト生物』の相互作用を、網羅的に分子レベルで解明することにある。水深1000mを超える深海底から複数の細胞外共生生物（主に甲殻類、それらは主に硫黄酸化能を持つイプシロンプロテオバクテリア（ピロリ菌の祖先的性質を有する）およびガンマプロテオバクテリアに属する外部共生微生物を腹部剛毛に有する）を採取し、様々な環境条件下における代謝活性を遺伝子および代謝物質レベルで解析することに成功した。さらに、それらを内部共生および病原性近縁種-ホスト生物間の相互作用と比較検証している。

研究成果

• [雑誌論文] Effects of Hemagglutination Activity in the Serum of a Deep-Sea Vent Endemic Crab, <i>Shinkaia Crosnieri</i>, on Non-Symbiotic and Symbiotic Bacteria (2015)
  • 著者名/発表者名: So Fujiyoshi, Hiroaki Tateno, Tomoo Watsuji, Hideyuki Yamaguchi, Daisuke Fukushima, Sayaka Mino, Makoto Sugimura, Tomoo Sawabe, Ken Takai, Shigeki Sawayama, Satoshi Nakagawa
  • 雑誌名: Ｍｉｃｒｏｂｅｓ ａｎｄ ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔｓ 巻: 30 号: 3 ページ: 228-234
  • DOI: 10.1264/jsme2.ME15066
  • NAID: 130005099200
  • ISSN: 1342-6311, 1347-4405
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Deep-sea Rhodococcus sp. BS-15 lacking the phytopathogenic fas genes, produces a novel glucotriose lipid biosurfactant. (2014)
  • 著者名/発表者名: Konishi M., Nishi S., Fukuoka T., Kitamoto D., Watsuji T., Nagano Y., Yabuki A., Nakagawa S., Hatada Y. Horiuchi J.
  • 雑誌名: Mar Biotech 巻: 未定 号: 4 ページ: 484-493
  • DOI: 10.1007/s10126-014-9568-x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Epsilonproteobacteria：特殊環境のスペシャリスト (2014)
  • 著者名/発表者名: 中川 聡
  • 雑誌名: Journal of Japanese Society for Extremophiles 巻: 13 ページ: 63-70
  • NAID: 40020753953
  • 査読あり
• [雑誌論文] Biogeography of Persephonella in deep-sea hydrothermal vents of the Western Pacific. (2013)
  • 著者名/発表者名: Mino, S., Makita, H., Toki, T., Miyazaki, J., Kato, S., Watanabe, H., Imachi, H., Watsuji, T., Nunoura, T., Kojima, S., Sawabe, T., Takai, K., and Nakagawa, S.
  • 雑誌名: Frontier in Extreme Microbiology 巻: 4 ページ: 107-107
  • DOI: 10.3389/fmicb.2013.00107
  • NAID: 120006389534
  • 査読あり
• [学会発表] 深海底熱水活動域に棲息する化学合成独立栄養微生物の多様性とその進化 (2016)
  • 著者名/発表者名: 中川聡
  • 学会等名: 第89回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 大阪国際交流センター（大阪府）
  • 年月日: 2016-03-23
  • 招待講演
• [学会発表] Genomic and population genetic analysis of gastropod symbionts in deep-sea hydrothermal fields. (2015)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Nakagawa
  • 学会等名: 8th International Symbiosis Society conference
  • 発表場所: リスボン（ポルトガル）
  • 年月日: 2015-07-13
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Hemagglutination activity in the serum of deep-sea vent endemic crab. (2015)
  • 著者名/発表者名: 藤吉 奏
  • 学会等名: 第88回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 長良川国際会議場（岐阜県岐阜市）
  • 年月日: 2015-03-26
• [学会発表] 深海底熱水活動域に生息する甲殻類の血清中血球凝集タンパク質因子の探索と性状解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 藤吉 奏
  • 学会等名: 極限環境生物学会2014年度（第15回）年会
  • 発表場所: 今帰仁村コミュニティーセンター（沖縄県今帰仁村）
  • 年月日: 2014-11-02
• [学会発表] 深海底熱水活動域に生息する無脊椎動物の血リンパ中レクチンの探索と性状解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 藤吉 奏
  • 学会等名: 環境微生物系学会合同大会2014
  • 発表場所: 浜松アクトシティコングレスセンター（静岡県浜松市）
  • 年月日: 2014-10-24
• [学会発表] 深海底熱水活動域に生息する甲殻類の血リンパ中異物認識因子の探索―ゴエモンコシオリエビの胸毛ファーム― (2014)
  • 著者名/発表者名: 藤吉 奏
  • 学会等名: 第8回細菌学若手コロッセウム
  • 発表場所: ホテルニセコいこいの村（北海道虻田郡）
  • 年月日: 2014-08-06
• [学会発表] 深海底熱水活動域に生息する化学合成微生物の分布様式と集団構造の解明 (2014)
  • 著者名/発表者名: 美野さやか
  • 学会等名: ブルーアース2014
  • 発表場所: 東京海洋大学（東京都港区）
• [学会発表] 深海底熱水活動域に見られる化学合成共生系を理解する：全ゲノム解析と群集遺伝学からのアプローチ (2013)
  • 著者名/発表者名: 中川聡
  • 学会等名: 日本進化学会第15回つくば大会
  • 発表場所: 筑波大学（茨城県つくば市）
  • 招待講演
• [学会発表] 深海底熱水活動域に優占する化学合成細菌の集団遺伝構造の解明 (2013)
  • 著者名/発表者名: 美野さやか
  • 学会等名: 極限環境生物学会2013年度（第14回）年会
  • 発表場所: 明治大学生田キャンパス（神奈川県川崎市）