サンゴの「個性」がストレス耐性の鍵？-ゲノム科学による解明-

• 研究課題/領域番号: 25660172
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 水圏生命科学
• 研究機関: 沖縄科学技術大学院大学
• 研究代表者: 新里 宙也 沖縄科学技術大学院大学, その他の研究科, 研究員 (70524726)
• 連携研究者: 酒井 一彦 琉球大学, 熱帯生物圏研究センター, 教授 (50153838)
• 研究協力者: 井口 亮 沖縄工業高等専門学校, 生物資源工学科, 助教 (50547502)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円); 2014年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円); 2013年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
• キーワード: ゲノム / サンゴ礁 / SNP / ストレス / サンゴ

研究成果の概要

地球規模の環境変動により、サンゴ礁が危機的な状況にある。サンゴのストレス耐性には共生する藻類が重要だと考えられているが、ストレス耐性は個体により著しく異なるのではないか、という仮説のもと、ストレスに耐性がある個体と敏感な個体を複数選別し、そのゲノム上の一塩基多型(SNP: Single Nucleotide Polymorphism)を比較することで、ストレス耐性に関わる遺伝子やゲノム領域の特定を目指した研究である。

研究成果

• [雑誌論文] Genome-wide SNP analysis explains coral diversity and recovery in the Ryukyu Archipelago (2015)
  • 著者名/発表者名: Chuya Shinzato, Sutada Mungpakdee, Nana Arakaki, Noriyuki Satoh
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 5 号: 1 ページ: 18211-18211
  • DOI: 10.1038/srep18211
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Development of novel, cross-species microsatellite markers for Acropora corals using next-generation sequencing technology. (2014)
  • 著者名/発表者名: Shinzato, C., Yasuoka, Y., Mungpakdee, D., Arakaki, N., Fujie, M., Nakajima, Y., Satoh, N.
  • 雑誌名: Front. Mar. Sci., 巻: 2014 ページ: 1-14
  • DOI: 10.3389/fmars.2014.00011
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A genomic approach to coral-dinoflagellate symbiosis: Studies of Acropora digitifera and Symbiodinium (2014)
  • 著者名/発表者名: Shinzato, C., Mungpakdee, S., Satoh, N., Shoguchi, E.
  • 雑誌名: Frontier in Microbiology 巻: 2014 ページ: 1-18
  • DOI: 10.3389/fmicb.2014.00336
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Cross-species, amplifiable microsatellite markers for neoverrucid barnacles from deep-sea hydrothermal vents developed using next-generation sequencing. (2014)
  • 著者名/発表者名: Nakajima Y, Shinzato C, Khalturina M, Watanabe H, Inagaki F, Satoh N, Mitarai S.
  • 雑誌名: Int. J. Mol. Sci. 巻: 15 号: 8 ページ: 14364-71
  • DOI: 10.3390/ijms150814364
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] How do environmental factors influence life cycles and development? An experimental framework for early-diverging metazoans. (2014)
  • 著者名/発表者名: Bosch T, Adamska M, Augustin R, Domazet-Loso T, Foret S, Fraune S, Funayama N, Grasis J, Hamada M, Hatta M, Hobmayer B, Kawai K, Klimovich A, Manuel M, Shinzato C, Technau U, Yum S, Miller DJ.
  • 雑誌名: BioEssays 巻: 36 号: 12 ページ: 1185-94
  • DOI: 10.1002/bies.201400065
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] A snapshot of a coral "holobiont": a transcriptome assembly of the scleractinian coral, porites, captures a wide variety of genes from both the host and symbiotic zooxanthellae. (2014)
  • 著者名/発表者名: Shinzato C, Inoue M, Kusakabe M
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: e85182 号: 1 ページ: e85182-e85182
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0085182
  • 査読あり
• [学会発表] ゲノムデータを用いた沖縄のコユビミドリイシサンゴの集団解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 新里宙也・Mungpakdee Sutada・新垣奈々・佐藤矩行
  • 学会等名: 日本水産学会春季大会
  • 発表場所: 東京海洋大学
  • 年月日: 2016-03-28
• [学会発表] サンゴ礁生態系の保全・再生へのゲノミクス技術の活用 (2015)
  • 著者名/発表者名: 新里宙也
  • 学会等名: 日本生物工学会大会
  • 発表場所: 城山観光ホテル
  • 年月日: 2015-10-27
  • 招待講演
• [学会発表] 全ゲノムSNPデータを用いた沖縄のサンゴの集団ゲノム学解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 新里宙也・Mungpakdee Sutada・新垣奈々・佐藤矩行
  • 学会等名: 日本進化学会
  • 発表場所: 中央大学後楽園キャンパス
  • 年月日: 2015-08-20
• [学会発表] 次世代シークエンサーを用いたミドリイシ属サンゴに広く使用できるマイクロサテライトマーカーの開発 (2014)
  • 著者名/発表者名: 新里 宙也，安岡 由貴，Sutada Mungpakdee，座安 佑奈，新垣 奈々，藤江 学，中島 祐一，佐藤 矩行
  • 学会等名: 日本サンゴ礁学会
  • 発表場所: 高知城ホール
  • 年月日: 2014-11-29
• [学会発表] 次世代シークエンサーを用いたミドリイシ属サンゴに広く使用できるマイクロサテライトマーカーの開発 (2014)
  • 著者名/発表者名: 新里 宙也，安岡 由貴，Sutada Mungpakdee，座安 佑奈，新垣 奈々，藤江 学，中島 祐一，佐藤 矩行
  • 学会等名: 日本動物学会
  • 発表場所: 東北大学
  • 年月日: 2014-09-11
• [学会発表] 造礁サンゴ（ハマサンゴ、Porites australiensis）“holobiont”のトランスクリプトーム解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 新里宙也、井上麻夕里、日下部誠
  • 学会等名: マリンバイオテクノロジー学会
  • 発表場所: 三重大学
  • 年月日: 2014-05-31
• [学会発表] 「サンゴらしさ」をゲノムから見る：GFPと石灰化
  • 著者名/発表者名: 新里宙也 佐藤矩行
  • 学会等名: 動物学会 関連集会
  • 発表場所: 岡山大学
  • 招待講演
• [学会発表] Sequencing the genomes of complex communities: transcriptome assembly of a coral “holobiont”
  • 著者名/発表者名: Chuya Shinzato
  • 学会等名: Aidling workshop
  • 発表場所: Aidling, Germany
• [学会発表] Decoding whole genomes of a coral Acropora digitifera and a dinoflagellates Symbiodinium minutum
  • 著者名/発表者名: Nori Satoh, Chuya Shinzato, Eiichi Shoguchi
  • 学会等名: 日本サンゴ礁学会 公開ミニシンポジウム
  • 発表場所: 沖縄科学技術大学院大学
  • 招待講演
• [産業財産権] Cross-species microsatellite markers for Acropora corals (2014)
  • 発明者名: 新里宙也、スタダ ムンパッティ、中島祐一
  • 権利者名: 新里宙也、スタダ ムンパッティ、中島祐一
  • 産業財産権種類: 特許
  • 産業財産権番号: 2014-093062
  • 出願年月日: 2014-04-28