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植物オルガネラのRNA編集の分子機構解明に向けた編集酵素の探索と同定

研究課題

研究課題/領域番号 25660292
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 応用分子細胞生物学
研究機関名古屋大学

研究代表者

杉田 護  名古屋大学, 遺伝子実験施設, 教授 (70154474)

連携研究者 青木 摂之  名古屋大学, 大学院情報学研究科, 准教授 (30283469)
研究協力者 一瀬 瑞穂  
杉田 千恵子  
内田 雅人  
中村 崇裕  
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2014年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2013年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワードRNA編集 / ミトコンドリア / 葉緑体 / ヒメツリガネゴケ / シチジンデアミナーゼ / RNAi / PPRタンパク質 / DYWドメイン / リボソームタンパク質
研究成果の概要

植物のミトコンドリアと葉緑体でmRNAの特定のシチジン(C)がウリジン(U)に変換される「RNA編集」が頻繁に起こるが、その分子メカニズムは不明である。本研究ではモデル植物であるヒメツリガネゴケを用いて新規のRNA編集因子を3種同定した。さらに同定したRNA編集因子の機能ドメイン領域を解析した結果、RNA編集因子のC末端に存在するシチジンデアミナーゼ活性部位類似アミノ酸残基を含む39アミノ酸領域がRNA編集部位の認識に関与することを初めて明らかにした。

報告書

(3件)
  • 2014 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (16件)

すべて 2015 2014 2013 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (9件) (うち招待講演 2件) 備考 (4件)

  • [雑誌論文] Identification of a pentatricopeptide repeat RNA editing factor in Physcomitrella patens chloroplasts2014

    • 著者名/発表者名
      Mizuho Ichinose, Masato Uchida, Mamoru Sugita
    • 雑誌名

      FEBS Letters

      巻: 588 号: 21 ページ: 4060-4064

    • DOI

      10.1016/j.febslet.2014.09.031

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Architecture of the PPR gene family in the moss Physcomitrella patens2013

    • 著者名/発表者名
      Mamoru Sugita, Mizuho Ichinose, Mizuki Ide, Chieko Sugita
    • 雑誌名

      RNA Biology

      巻: 10 号: 9 ページ: 1439-1445

    • DOI

      10.4161/rna.24772

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Two DYW subclass PPR proteins are involved in RNA editing of ccmFc and atp9 transcripts in the moss Physcomitrella patens : first complete set of PPR editing factors in plant mitochondria2013

    • 著者名/発表者名
      Mizuho Ichinose, Chieko Sugita, Yusuke Yagi, Takahiro Nakamura, Mamoru Sugita
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiology

      巻: 54 号: 11 ページ: 1907-1916

    • DOI

      10.1093/pcp/pct132

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 植物オルガネラRNA編集におけるDYWドメインの機能解析2015

    • 著者名/発表者名
      一瀬瑞穂、杉田 護
    • 学会等名
      第56回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      東京農業大学世田谷キャンパス
    • 年月日
      2015-03-16
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 植物オルガネラのPPRタンパク質とRNA編集2015

    • 著者名/発表者名
      一瀬瑞穂、杉田 護
    • 学会等名
      第17回オルガネラワークショプ「オルガネラ機能の最適化メカニズム」
    • 発表場所
      東京大学駒場キャンパス
    • 年月日
      2015-03-15
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] RNA編集におけるPPRタンパク質のDYWドメインの役割2015

    • 著者名/発表者名
      一瀬瑞穂、杉田 護
    • 学会等名
      第4回植物RNA研究者ネットワークシンポジウム
    • 発表場所
      京都大学理学部セミナーハウス
    • 年月日
      2015-01-19
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] オルガネラRNA編集におけるDYWドメインの役割2014

    • 著者名/発表者名
      一瀬瑞穂、杉田 護
    • 学会等名
      日本植物学会第78回大会
    • 発表場所
      明治大学生田キャンパス
    • 年月日
      2014-09-13
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ヒメツリガネゴケの遺伝子ターゲティングによるPPR遺伝子ファミリーの機能解析2014

    • 著者名/発表者名
      一瀬瑞穂、杉田護
    • 学会等名
      日本蘚苔類学会第43回大会(青森大会)
    • 発表場所
      青森県十和田市星野リゾート奥入瀬渓流ホテル
    • 年月日
      2014-08-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ヒメツリガネゴケの葉緑体RNA 編集因子の同定2014

    • 著者名/発表者名
      一瀬瑞穂,内田雅人,杉田 護
    • 学会等名
      第55回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      富山大学五福キャンパス
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Functional analysis of the pentatricopeptide repeat protein family in Physcomitrella patens.2013

    • 著者名/発表者名
      Mamoru Sugita, Mizuho Ichinose, Chieko Sugita, Korechika Tanaka, Yasuhiro Kawaguchi, and Seiya Goto
    • 学会等名
      16th International Conference MOSS 2013
    • 発表場所
      Masaryk Center, Prague, Czech Republic
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] ヒメツリガネゴケのミトコンドリアccmFc mRNAの近接した2カ所のRNA編集部位に働くDYWサブクラスPPRタンパク質2013

    • 著者名/発表者名
      一瀬瑞穂、杉田千恵子、八木祐介、中村崇裕、杉田 護
    • 学会等名
      日本植物学会第77回大会
    • 発表場所
      北海道大学
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Pentatricopeptide repeat (PPR) proteins in Physcomitrella patens2013

    • 著者名/発表者名
      Mizuho Ichinose, Chieko Sugita, Korechika Tanaka, Yasuhiro Kawaguchi, Seiya Goto, Akimi Takahashi and Mamoru Sugita
    • 学会等名
      CREST symposium, Regulation of photosynthesis and chloroplast function
    • 発表場所
      Kyoto University
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [備考] 杉田研究室ホームページ、論文リスト

    • URL

      http://www.gene.nagoya-u.ac.jp/~sugita-g/ronbun.html

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [備考] 名古屋大学大学院理学研究科生命理学専攻ホームページ、論文紹介

    • URL

      http://www.bio.nagoya-u.ac.jp/paper/index.html

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [備考] 杉田研究室ホームページ、論文リスト

    • URL

      http://www.gene.nagoya-u.ac.jp/~sugita-g/ronbun.html

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [備考] 名古屋大学理学研究科生命理学専攻ホームページ、論文紹介

    • URL

      http://www.bio.nagoya-u.ac.jp/paper/index.html

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書

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公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

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