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進化的アルゴリズムによるPopPKモデリングの完全自動化

研究課題

研究課題/領域番号 25670073
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 医療系薬学
研究機関京都大学

研究代表者

山下 富義  京都大学, 薬学研究科(研究院), 准教授 (30243041)

連携研究者 矢野 育子  京都大学, 薬学研究科, 准教授 (50273446)
天野 晃  立命館大学, 生命科学部, 教授 (60252491)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
2014年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2013年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
キーワード母集団薬物動態解析 / 共変量モデル / 遺伝的アルゴリズム / 遺伝的数式プログラミング / 個体間変動 / 拡張最小二乗法 / 薬物動態 / 母集団解析 / パラメータ推定 / 機械学習
研究成果の概要

ポピュレーション・ファーマコキネティック・モデルは、患者情報に基づく平均的な薬物動態パラメーター、個体間変動および個体内変動からなるモデルである。患者個人個人の血中薬物動態を予測するためには、より精度の高い患者情報と薬物動態パラメーターとの間の関係すなわち共変量モデルを見つけることが重要である。しかしながら、共変量候補の数が多いために、モデル開発は困難を極める。そこで本研究では、コンピューター上で数式を進化させることにより、臨床データから完全自動で共変量モデルを開発するシステムを完成させた。

報告書

(3件)
  • 2014 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2015 2014 2013

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (3件) (うち招待講演 1件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Multiple linear regression analysis indicates association of P-glycoprotein substrate or inhibitor character with bitterness intensity, measured with a sensor2015

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Yano, Suzune Mita, Kaori Morimoto, Tamami Haraguchi, Hiroshi Arakawa, Miyako Yoshida, Fumiyoshi Yamashita, Takahiro Uchida, Takuo Ogihara
    • 雑誌名

      Journal of Pharmaceutical Sciences

      巻: 104 号: 9 ページ: 2789-2794

    • DOI

      10.1002/jps.24232

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Bilinear Model for the Size-Dependency of the CYP3A4 Inhibitory Activity of Structurally Diverse Compounds2014

    • 著者名/発表者名
      Peter Buchwald, Fumiyoshi Yamashita
    • 雑誌名

      Molecular Informatics

      巻: 33 号: 1 ページ: 8-14

    • DOI

      10.1002/minf.201300132

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Computer-aided full-automatic construction of covariate models in population pharmacokinetic analysis2014

    • 著者名/発表者名
      Fumiyoshi Yamashita, Shuya Yoshida, Mitsuru Hashida
    • 学会等名
      Joint Scientific Meeting: 29th JSSX Meeting and 19th North American ISSX Meeting
    • 発表場所
      Hilton San Francisco Union Square (San Francisco)
    • 年月日
      2014-10-22
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 遺伝的数式プログラミング法を用いたCYP3A4阻害活性に対する構造活性相関解析2013

    • 著者名/発表者名
      吉田秀哉、藤田淳人、山下富義、橋田 充
    • 学会等名
      日本薬物動態学会第28回年会
    • 発表場所
      タワーホール船堀(東京)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Utilization of machine learning techniques to pursue automatic PPK modeling2013

    • 著者名/発表者名
      Fumiyoshi Yamashita
    • 学会等名
      2013 PAGJA-PAGK Joint Annual Meeting
    • 発表場所
      Grand Hilton Seoul (Seoul)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [図書] Dr. 北野のゼロから始めるシステムバイオロジー 第10講 PhysioDesignerによる生理機能の多階層モデル構築とシミュレーション2015

    • 著者名/発表者名
      浅井義之、山下富義
    • 出版者
      羊土社
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書

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公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

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