腸管感染症のイムノターゲット・メタゲノミック診断

• 研究課題/領域番号: 25670272
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 病態検査学
• 研究機関: 岡山大学 (2014); 大阪大学 (2013)
• 研究代表者: 後藤 和義 岡山大学, 医歯(薬)学総合研究科, 助教 (20626593)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円); 2014年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2013年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
• キーワード: IgA / 腸内細菌叢 / 感染症診断 / メタゲノム解析 / 腸管粘膜免疫 / 腸内フローラ / 分泌型IgA / セルソーティング / 次世代シークエンサー

研究成果の概要

本研究では、腸管感染症においてIgAが結合している細菌を分離することで、次世代シークエンサーによる診断を容易にすることを目的とし、その分離・解析技術の確立を目指した。
健常人のヒト糞便を材料とし、IgA結合細菌をセルソーターを用いて分離を試みたが、細菌核酸は得られなかった。代替法として磁気ビーズ法により分離したところ16S rDNA PCRに成功したが、次世代シークエンサーにより菌叢解析を行った結果IgA結合と非結合に差が見られなかった。蛍光顕微鏡下ではIgA結合細菌が観察されているのでレーザーマイクロダイセクション等の直接観察下で分離する手法が有効と考えられる。

研究成果

• [雑誌論文] Generation of colonic IgA-secreting cells in the cecal patch (2014)
  • 著者名/発表者名: Masahata, K., Umemoto, E., Kayama, H., Kotani, M., Nakamura, S., Kurakawa, T., Kikuta, J., Gotoh, K., Motooka, D., Sato, S., Higuchi, T., Baba, Y., Kurosaki, T., Kinoshita, M., Shimada, Y., Kimura, T., Okumura, R., Takeda, A., Tajima, M., Yoshie, O., Fukuzawa, M., Kiyono, H., Fagarasan, S., Iida, T., Ishii, M., Takeda, K
  • 雑誌名: Nature Comm 巻: 5 号: 1 ページ: 3704-3704
  • DOI: 10.1038/ncomms4704
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Comprehensive metagenomic approach for detecting causative microorganisms in culture-negative infective endocarditis. (2014)
  • 著者名/発表者名: Imai A, Gotoh K, Asano Y* (corresponding author), Yamada N, Motooka D, Fukushima M, Kanzaki M, Ohtani T, Sakata Y, Nishi H, Toda K, Sawa Y, Komuro I, Horii T, Iida T, Nakamura S, Takashima S.
  • 雑誌名: Int J Cardiol. 巻: 172 号: 2 ページ: 288-9
  • DOI: 10.1016/j.ijcard.2013.12.197
  • 査読あり
• [雑誌論文] Fatal sepsis caused by an unusual Klebsiella species that was misidentified by an automated identification system. (2013)
  • 著者名/発表者名: Seki M., et. al.
  • 雑誌名: Journal of Medical Microbiology 巻: (印刷中) 号: 5 ページ: 801-803
  • DOI: 10.1099/jmm.0.051334-0
  • 査読あり
• [雑誌論文] Physiologic and metagenomic attributes of the rhodoliths forming the largest CaCO3 bed in the South Atlantic Ocean. (2013)
  • 著者名/発表者名: Cavalcanti GS, Gregoracci GB, dos Santos EO, Silveira CB, Meirelles PM, Longo L, Gotoh K, Nakamura S, Iida T, Sawabe T, Rezende CE, Francini-Filho RB, Moura RL, Amado-Filho GM, Thompson FL.
  • 雑誌名: ISME J 巻: 8 号: 1 ページ: 52-62
  • DOI: 10.1038/ismej.2013.133
  • 査読あり
• [学会発表] 虫垂が腸内細菌叢の形成に果たす役割 (2014)
  • 著者名/発表者名: 後藤和義、倉川尚、飯田哲也
  • 学会等名: 第67回日本細菌学会中国・四国支部総会
  • 発表場所: 徳島文理大学
  • 年月日: 2014-10-05
• [学会発表] Dynamics of Fecal Microbiota in Bangladeshi Children (2014)
  • 著者名/発表者名: K., Gotoh, D., Motooka, S., Nakamura, S., Monira, M., Alam, T., Iida
  • 学会等名: 48th US-Japan Cooperative Medical Sciences Program Conference on Cholera and Other Bacterial Infections
  • 発表場所: Dhaka, Bangladesh
• [学会発表] Dysbiosis of gut microbiota during cholera and recovery (2013)
  • 著者名/発表者名: Gotoh, K., Monira, S., Nakamura, S., Alam, N.H., Horii, T., Alam, M., Iida, T.
  • 学会等名: The Annual Medical Sciences Conference 21st
  • 発表場所: Nonthaburi, Thai
• [学会発表] 次世代シークエンサーを用いた病原体の網羅的診断法 (2013)
  • 著者名/発表者名: 後藤 和義。元岡 大祐、中村 昇太、飯田 哲也、堀井 俊宏
  • 学会等名: 第25回臨床微生物迅速診断研究会総会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] バングラデシュにおける小児糞便細菌叢のダイナミクス (2013)
  • 著者名/発表者名: 後藤 和義、元岡 大祐、中村 昇太、飯田 哲也、堀井 俊宏
  • 学会等名: 第47回腸炎ビブリオシンポジウム
  • 発表場所: 広島