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遺伝子発現プロファイル手法による血液RNA診断に向けた基礎的研究

研究課題

研究課題/領域番号 25670282
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 病態検査学
研究機関国立研究開発法人産業技術総合研究所

研究代表者

高橋 淳子  国立研究開発法人産業技術総合研究所, バイオメディカル研究部門, 主任研究員 (80415702)

研究分担者 岩橋 均  岐阜大学, 応用生物科学部・分子生命科学コース, 教授 (60356540)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2015年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2014年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2013年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
キーワード血液診断 / RNA診断
研究成果の概要

血液中には臓器や組織と同様にmRNAやnon-coding RNAの膨大な発現情報があり、血液中のRNA診断の有用性が見いだされた。次世代の臨床検査は、第4世代シーケンサー等の遺伝子解析手法の飛躍的な進歩により、蛋白等による診断では行えない、疾病の初期の兆候を捉える高感度な血液RNA診断が可能となる。しかし血液RNA研究はバイオマーカー探索でもみられる様に局所・離散的であり、RNA採取や抽出法の正確性や品質には課題がある。
そこで、RNAの品質評価、 抽出効率の評価、ポリメラーゼ等酵素反応阻害の評価を通したRNAの妥当性評価法の検討を行った。また、臓器由来RNA評価モデルの構築を検討した。

報告書

(4件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (3件)

すべて 2016 2015 2013

すべて 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 1件、 査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] Gene expression profiling can predict the fate of HeLa cells exposed to X-ray irradiation with or without protoporphyrin accumulation2015

    • 著者名/発表者名
      J. Takahashi, M. Misawa, H. Iwahashi
    • 雑誌名

      Genomics Data

      巻: 5 ページ: 192-194

    • DOI

      10.1016/j.gdata.2015.05.044

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Evaluation for Integrity of Extracted RNA by Reference Material of RNA2013

    • 著者名/発表者名
      Junko Takahashi1, Akiko Takatsu, Hitoshi Iwahashi
    • 雑誌名

      Journal of Medical Diagnostic Methods

      巻: 2:128 号: 03 ページ: 1-5

    • DOI

      10.4172/2168-9784.1000128

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 標準RNAを用いた抽出RNAのクオリティコントロール2016

    • 著者名/発表者名
      長谷川 丈真、高橋 淳子、 岩橋 均
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道・札幌)
    • 年月日
      2016-03-27
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書

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公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

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