OMICS情報を臨床診療に反映するためのインターフェースとバーチャルカルテの開発

• 研究課題/領域番号: 25670703
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 産婦人科学
• 研究機関: 近畿大学
• 研究代表者: 万代 昌紀 近畿大学, 医学部, 教授 (80283597)
• 研究分担者: 清水 章 京都大学, 医学部, 教授 (00162694) ; 山田 亮 京都大学, 医学部, 教授 (50301106)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円); 2014年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円); 2013年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
• キーワード: 卵巣癌 / マイクロアレイ / 細胞内シグナル / バイオインフォマティクス / インターフェース / マイクロアレイ解析 / バーチャルカルテ

研究成果の概要

メインコンピューター上に仮想カルテを作成し、ファイルメーカーを用いて、患者ごとの参照画面を作成した。参照画面には年齢、病期、組織型といった臨床情報とともに、後述する、数値化されたマイクロアレイ情報が表示されるようにした。また、各患者のマイクロアレイ情報に基づく癌の生物学的なプロフィールも図示できるようにした。学内施設において卵巣癌症例の手術標本のマイクロアレイ解析をおこない、粗データをメインコンピューターに蓄積した。
各細胞内シグナルの活性度を表すと考えられる遺伝子群をsignatureとして抽出し、ssGSEAを用いて、おのおののsignatureの強さを0-1の間に数値化した。

研究成果

• [雑誌論文] The BMP signaling pathway leads to enhanced proliferation in serous ovarian cancer-a potential therapeutic target. (2015)
  • 著者名/発表者名: Peng J, Yoshioka Y, Mandai M, et al
  • 雑誌名: Mol Carcinog 巻: Epub ahead of print 号: 4 ページ: 1-11
  • DOI: 10.1002/mc.22283
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Invasion of uterine cervical squamous cell carcinoma cells is facilitated by locoregional interaction with cancer-associated fibroblasts via activating transforming growth factor-beta. (2015)
  • 著者名/発表者名: Nagura M, Matsumura N, Baba T, Murakami R, Kharma B, Hamanishi J, Yamaguchi K, Abiko K, Koshiyama M, Mandai M, et al.
  • 雑誌名: Gynecol Oncol 巻: 136 号: 1 ページ: 104-111
  • DOI: 10.1016/j.ygyno.2014.11.075
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Epigenetic determinants of ovarian clear cell carcinoma biology. (2013)
  • 著者名/発表者名: Yamaguchi K, Huang Z, Matsumura N, Mandai M, Okamoto T, Baba T, Konishi I, Berchuck A, Murphy SK.
  • 雑誌名: Int J Cancer. 巻: - 号: 3 ページ: 585-97
  • DOI: 10.1002/ijc.28701
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Hepatocyte nuclear factor-1β promotes glucose uptake and glycolytic activity in ovarian clear carcinoma (2013)
  • 著者名/発表者名: T Okamoto, M Mandai, N Matsumura, K Yamaguchi, H Kondoh, Y Amano, T Baba, J Hamanishi, K Abiko, K Kosaka, S K, Murphy, S Mori, I Konishi
  • 雑誌名: Molecular carcinogenesis 巻: Sep 17 号: 1 ページ: 1-15
  • DOI: 10.1002/mc.22072
  • 査読あり
• [雑誌論文] Utilization of genomic signatures to identify high efficacy candidate drugs for chemo-refractory endometrial cancers. (2013)
  • 著者名/発表者名: Kharma B, Baba T, Mandai M, Matsumura N, Murphy SK, Kang HS, Yamanoi K, Hamanishi J, Yamaguchi K, Yoshioka Y, Konishi I.
  • 雑誌名: Int J Cancer. 巻: 133 号: 9 ページ: 2234-44
  • DOI: 10.1002/ijc.28220
  • 査読あり
• [雑誌論文] PD-L1 on Tumor Cells Is Induced in Ascites and Promotes Peritoneal Dissemination of Ovarian Cancer through CTL Dysfunction. (2013)
  • 著者名/発表者名: Abiko K, Mandai M, Hamanishi J, Yoshioka Y, Matsumura N, Baba T, Yamaguchi K, Murakami R, Yamamoto A, Kharma B, Kosaka K, Konishi I.
  • 雑誌名: Clin Cancer Res. 巻: 19 号: 6 ページ: 1363-1374
  • DOI: 10.1158/1078-0432.ccr-12-2199
  • 査読あり
• [学会発表] 卵巣高悪性漿液性腺癌のmolecular subtypeを反映する新しい病理組織学的分類
  • 著者名/発表者名: 村上隆介、ほか
  • 学会等名: 第66回日本産科婦人科学会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] がん薬物療法の未来
  • 著者名/発表者名: 万代昌紀
  • 学会等名: がん分子標的治療フォーラム
  • 発表場所: 岡山
  • 招待講演