アクセス可能な治療標的探索の為のがん-間質細胞間相互作用のシーケンシング解析

• 研究課題/領域番号: 25710020
• 研究種目: 若手研究(A)
• 配分区分: 一部基金
• 研究分野: ゲノム医科学
• 研究機関: 東京医科歯科大学
• 研究代表者: 石川 俊平 東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 教授 (50418638)
• 連携研究者: 中村 雅登 東海大学, 医学科基盤診療学系, 教授 (00164335)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 25,480千円 (直接経費: 19,600千円、間接経費: 5,880千円); 2015年度: 8,190千円 (直接経費: 6,300千円、間接経費: 1,890千円); 2014年度: 8,190千円 (直接経費: 6,300千円、間接経費: 1,890千円); 2013年度: 9,100千円 (直接経費: 7,000千円、間接経費: 2,100千円)
• キーワード: ゲノム / がん / 治療標的 / 癌 / 病理学

研究成果の概要

ヒト癌細胞のマウス移植系におけるトランスクリプトームシーケンスのデータから、マウスとヒトとの配列を分離して癌細胞と間質細胞との細胞間相互作用全体（インターラクトーム）を解析する方法を高精度化した。この方法を用いて、様々な癌種の細胞や臨床検体から樹立したXenograftの解析を行い、癌の組織像を反映したインターラクトームプロファイルや、特定の癌種で重要な相互作用候補を同定することができ、候補分子のいくつかについては実際の臨床組織で腫瘍や間質特異的な局在等を確認できた。

研究成果

• [雑誌論文] The role of HGF/MET and FGF/FGFR in fibroblast-derived growth stimulation and lapatinib-resistance of esophageal squamous cell carcinoma (2015)
  • 著者名/発表者名: Shin Saito, Kazue Morishima, Takashi Ui, Hiroko Hoshino, Daisuke Matsubara, Shumpei Ishikawa, Hiroyuki Aburatani, Masashi Fukayama, Yoshinori Hosoya, Naohiro Sato, Alan K Lefor, Yoshikazu Yasuda and Toshiro Niki
  • 雑誌名: BMC cancer 巻: 15 号: 1 ページ: 1-12
  • DOI: 10.1186/s12885-015-1065-8
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] がんと間質のインタラクトーム解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 石川俊平
  • 雑誌名: 病理と臨床 ゲノム創薬と病理 巻: 32(8) ページ: 850-856
• [雑誌論文] Clinicopathological and prognostic significance of EZH2 expression in upper urinary tract carcinoma. (2014)
  • 著者名/発表者名: Hayashi A, Morikawa T, Kawai T, Kume H, Ishikawa S, Homma Y, Fukayama M.
  • 雑誌名: Virchows Arch 巻: 464 号: 4 ページ: 463-471
  • DOI: 10.1007/s00428-014-1541-6
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Prognostic significance of CD204-positive macrophages in upper urinary tract cancer (2014)
  • 著者名/発表者名: Ichimura T, Morikawa T, Kawai T, Nakagawa T, Matsushita H, Kakimi K, Kume H, Ishikawa S, Homma Y, Fukayama M.
  • 雑誌名: Ann Surg Oncol. 巻: 21 号: 6 ページ: 2105
  • DOI: 10.1245/s10434-014-3503-2
  • 査読あり
• [学会発表] Comprehensive analysis of tumor - stromal interactome (2015)
  • 著者名/発表者名: D. Komura, T. Isagawa, R. Sato, K. Kishi, R. Suzuki, S. Ishikawa
  • 学会等名: CSH-ASIA/AACR JOINT MEETING: BIG DATA, COMPUTATION, AND SYSTEMS BIOLOGY IN CANCER
  • 発表場所: Suzhou, China
  • 年月日: 2015-12-02
  • 国際学会
• [学会発表] シーケンシングによるがん間質間相 互作用の網羅的解析. (2015)
  • 著者名/発表者名: 砂河 孝行、河村 大輔、佐藤 玲子、 貴志 一樹、鈴木 良平、石川 俊平.
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会 第 60 回大会
  • 発表場所: 京王プラザ 東京
  • 年月日: 2015-10-14
• [学会発表] Visualizing whole cancer-stromal interactome (2014)
  • 著者名/発表者名: Kazuki Kishi, Daisuke Komura, Takayuki Isagawa, Shumpei Ishikawa
  • 学会等名: 13th European Conference on Computational Biology
  • 発表場所: Strasbourg, France
  • 年月日: 2014-09-07 – 2014-09-10
• [学会発表] がん治療標的探索のための細胞間相互作用のゲノミクス (2013)
  • 著者名/発表者名: 石川俊平、河村大輔、佐藤玲子、砂河孝行、加藤洋人、油谷浩幸。深山正久
  • 学会等名: 第102回日本病理学会総会
  • 発表場所: 札幌（ロイトンホテル）
• [学会発表] Systematic profiling of cancer-microenvironment interactome in cancer tissue (2013)
  • 著者名/発表者名: Shumpei Ishikawa, Daisuke Komura, Ryohei Suzuki, Reiko Sato, Masashi Fukayama, Hiroyuki Aburatani
  • 学会等名: 第72回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 横浜（パシフィコ横浜）
• [学会発表] がんと間質の相互作用の包括的解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 石川俊平、河村大輔、貴志一樹、佐藤玲子、砂河孝行、油谷浩幸
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会 第58回大会
  • 発表場所: 仙台（江陽グランドホテル）
• [学会発表] Sequencing-base approach for cancer-sromal interaction (2013)
  • 著者名/発表者名: Shumpei Ishikawa
  • 学会等名: 2013SNUCRI Cancer Symposium: Innovative Approaches to Explore Novel Druggable Targets
  • 発表場所: チェジュ（フェニックスアイランド）、韓国
  • 招待講演
• [備考] 東京医科歯科大学 ゲノム病理学分野 研究内容
  • URL: http://www.tmd.ac.jp/gpat/research/index.html
• [備考] 研究室ホームページ
  • URL: http://www.tmd.ac.jp/gpat/