異数性による種分化の機構が存在するか？(II) 比較ゲノム解析と再現系からの検証

• 研究課題/領域番号: 25711024
• 研究種目: 若手研究(A)
• 配分区分: 一部基金
• 研究分野: 生物多様性・分類
• 研究機関: 千葉大学
• 研究代表者: 菊池 真司 千葉大学, 大学院園芸学研究科, 助教 (80457168)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2018-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2017年度)
• 配分額: 27,430千円 (直接経費: 21,100千円、間接経費: 6,330千円); 2016年度: 3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円); 2015年度: 2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円); 2014年度: 3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円); 2013年度: 17,940千円 (直接経費: 13,800千円、間接経費: 4,140千円)
• キーワード: 異数体 / トレニア / 染色体 / 種分化 / FISH解析 / 遺伝資源 / 核型 / ゲノム分析 / 異数性 / ゲノム / 比較ゲノム解析

研究成果の概要

トレニア・フルニエリ（2n=2x=18）とトレニア・バイロニー（2n=2x=16）の種間雑種の減数分裂で、異種の染色体が対合した8本の二価染色体とフルニエリ染色体由来の1本の一価染色体が観察される。分子系統解析の結果、2n=18から2n=16への染色体減数が生じた可能性が高いことが分かっている。2種の種分化の過程において一価染色体を形成するフルニエリ染色体が与えた影響を考察するために、2種の全ゲノム配列を比較した。その結果、バイロニーのゲノムDNAに類似する配列がフルニエリの9本の染色体に散在して検出され、特定の染色体が脱落して種分化に至った可能性は低くなった。

研究成果

• [国際共同研究] カセサート大学(タイ)
• [雑誌論文] High genomic affinity between Torenia baillonii and Torenia fournieri revealed by genome analysis using a triploid hybrid. (2017)
  • 著者名/発表者名: Buntarika NUNTHA, Shinj KIKUCHI, Thuya TAYCHASINPITAK, Hidenori SASSA, Takato KOBA
  • 雑誌名: Cytologia 巻: 82(2)
  • NAID: 130006769799
  • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] New karyotypes of an interspecific hybrid of Torenia fournieri and Torenia baillonii and its progenies. (2016)
  • 著者名/発表者名: Buntarika NUNTHA, Shinji KIKUCHI, Thunya TAYCHASINPITAK, Hidenori SASSA, Takato KOBA
  • 雑誌名: Chromosome Science 巻: 19
  • NAID: 130006837149
  • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Mutation breeding of Thai native torenia (Torenia fournieri Lind.) by gamma-ray irradiation. (2016)
  • 著者名/発表者名: Thunya TAYCHASINPITAK, Shinji KIKUCHI, Anchalee JALA, Theerachai THANANANTA, Nattapong CHANCHULA
  • 雑誌名: Thai Journal of Science and Technology 巻: 5 ページ: 190-199
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Chromosome number increasing in Torenia hybrid by application of colchicine tablet. (2016)
  • 著者名/発表者名: Lucia RAGASOVA, Ivo ONDRASEK, Thunya TAYCHASINPITAK, Suthasinee PINTHONG, Banthita PENSURIYA, Valerie Web SUWANSEREE, Shinji KIKUCHI
  • 雑誌名: Thai Journal of Science and Technology 巻: 5 ページ: 200-212
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Radiosensitivity of in vitro cultured Torenia fournieri Lind. from Thailand by γ-ray irradiation. (2015)
  • 著者名/発表者名: Nattapong Chanchula, Thunya Taychasinpitak, Anchalee Jala, Theerachai Thanananta, Shinji Kikuchi
  • 雑誌名: International Transaction Journal of Engineering, Management, & Applied Science & Technologies. 巻: 6 ページ: 157-164
  • DOI: 10.14456/itjemast.2015.8
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Induction of somatic embryogenesis in Torenia fournieri Lind. (2015)
  • 著者名/発表者名: Nattapong Chanchula, Thunya Taychasinpitak, Anchalee Jala, Theerachai Thanananta, Shinji Kikuchi.
  • 雑誌名: International Transaction Journal of Engineering, Management, & Applied Science & Technologies. 巻: 6 ページ: 165-171
  • DOI: 10.14456/itjemast.2015.7
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Effect of gout drug treatments on survival rate and morphological change of Lindernia sp. in vitro. (2015)
  • 著者名/発表者名: Kamontip Sungkaew, Thunya Taychasinpitak, Shermarl Wongchaochant, Patana Sukprasert, Shinji Kikuchi
  • 雑誌名: International Transaction Journal of Engineering, Management, & Applied Science & Technologies. 巻: 6 ページ: 191-201
  • DOI: 10.14456/itjemast.2015.5
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Seed formation in triploid loquat (<i>Eriobotrya japonica</i>) through cross-hybridization with pollen of diploid cultivars (2014)
  • 著者名/発表者名: Kikuchi, S., Iwasuna, M., Kobori, A., Tsutaki, Y., Yoshida, A., Murota, Y., Nishino, E., Sassa, H. and Koba, T.
  • 雑誌名: Ｂｒｅｅｄｉｎｇ Ｓｃｉｅｎｃｅ 巻: 64 号: 2 ページ: 176-182
  • DOI: 10.1270/jsbbs.64.176
  • NAID: 130004146436
  • ISSN: 1344-7610, 1347-3735
  • 査読あり
• [学会発表] トレニアの種間雑種における染色体行動の解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 菊池真司
  • 学会等名: 第67回 染色体学会 年会
  • 発表場所: 東京大学（東京都、文京区）
  • 招待講演
• [学会発表] Genomic affinity level between Torenia baillonii and Torenia fournieri measured by genome analysis with a triploid hybrid (2016)
  • 著者名/発表者名: Buntarika NUNTHA, Shinji KIKUCHI, Hidenori SASSA, Takato KOBA
  • 学会等名: 第67回 染色体学会 年会
  • 発表場所: 東京大学（東京都、文京区）
• [学会発表] Application of detached-leaf technique and gout drug treatment to induced tetraploid in Torenia hybrida (T. fournieri x T. asiatica) (2015)
  • 著者名/発表者名: Chanchula, N., Taychasinpitak, T., Jala, A., Thanananta, T., Kikuchi, S.
  • 学会等名: The 5th Asian Chromosome Colloquium
  • 発表場所: カセサート大学（バンコク, タイ）
  • 年月日: 2015-04-29
  • 国際学会
• [学会発表] Torenia fournieriにおける各染色体の識別及び核型解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 小澤翔太、菊池真司、鈴木孝征、豊田敦、藤山秋佐夫、東山哲也、佐々英徳、木庭卓人
  • 学会等名: 染色体学会 第65回年会
  • 発表場所: 岡山県倉敷市芸文館
  • 年月日: 2014-10-24 – 2014-10-25
• [学会発表] 野生アズキ・東日本集団の相互転座と氷河期レフュジアからの分布変遷 (2014)
  • 著者名/発表者名: Wang Lixia、 菊池真司、武藤千秋、内藤健、伊勢村武久、石本政男、Xuzhen Cheng、加賀秋人、友岡憲彦
  • 学会等名: 染色体学会 第65回年会
  • 発表場所: 岡山県倉敷市芸文館
  • 年月日: 2014-10-24 – 2014-10-25
• [学会発表] Comparative karyotype analysis in cucmber, Cucumis sativus, by fluorescence in situ hybridization technique (2014)
  • 著者名/発表者名: Nguyen Anh Duc, Shinji Kikuchi, Hidenori Sassa, Takato Koba
  • 学会等名: 染色体学会 第65回年会
  • 発表場所: 岡山県倉敷市芸文館
  • 年月日: 2014-10-24 – 2014-10-25