統合ゲノム解析によるパーキンソン病の遺伝子同定と個別化医療開発

• 研究課題/領域番号: 25713015
• 研究種目: 若手研究(A)
• 配分区分: 一部基金
• 研究分野: 人類遺伝学
• 研究機関: 神戸大学
• 研究代表者: 佐竹 渉 神戸大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (50467594)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2017-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2016年度)
• 配分額: 24,570千円 (直接経費: 18,900千円、間接経費: 5,670千円); 2015年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円); 2014年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円); 2013年度: 16,770千円 (直接経費: 12,900千円、間接経費: 3,870千円)
• キーワード: 神経遺伝 / パーキンソン病 / エクソーム / 個別化医療 / 孤発性神経疾患 / 神経内科学 / 人類遺伝学 / ゲノム医科学

研究成果の概要

我々は、主要な神経難病 パーキンソン病（PD）のゲノムワイド関連解析を行い、本症を引き起こす4つの遺伝子リスクを同定し、世界に先駆けて発表してきた。本研究ではエクソンに存在する疾患効果サイズの強いrare variantを発見するため、大規模エクソーム解読と関連解析をおこない、エクソンに存在するパーキンソン病リスクとなる非同義置換variantを15個リスト化することに成功した。

研究成果

• [雑誌論文] Evaluation of the interaction between LRRK2 and PARK16 loci in determining risk of Parkinson's disease: analysis of a large multicenter study. (2017)
  • 著者名/発表者名: Wang L, Heckman MG, Aasly JO,.., Satake W,.., Farrer MJ, Ross OA, Sharma M
  • 雑誌名: Neurobiol Aging. 巻: 49 ページ: 217.e1-217.e4
  • DOI: 10.1016/j.neurobiolaging.2016.09.022
  • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A novel PIGN mutation and prenatal diagnosis of inherited glycosylphosphatidylinositol deficiency. (2015)
  • 著者名/発表者名: Nakagawa T, Taniguchi-Ikeda M, Murakami Y, Nakamura S, Motooka D, Emoto T, Satake W, Nishiyama M, Toyoshima D, Morisada N, Takada S, Tairaku S, Okamoto N, Morioka I, Kurahashi H, Toda T, Kinoshita T, Iijima K.
  • 雑誌名: American Journal of Medical Genetics PartA 巻: 170 号: 1 ページ: 183-188
  • DOI: 10.1002/ajmg.a.37397
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] ABCG2 variant has opposing effects on onset ages of Parkinson's disease and gout. (2015)
  • 著者名/発表者名: Matsuo H, Tomiyama H, Satake W, Chiba T, Onoue H, Kawamura Y, Nakayama A, ShimizuS, Sakiyama M, Funayama M, Nishioka K, Shimizu T, Kaida K, Kamakura K, Toda T, Hattori N, ShinomiyaN.
  • 雑誌名: Ann Clin Transl Neurol 巻: 2 号: 3 ページ: 302-306
  • DOI: 10.1002/acn3.167
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Variants associated with Gaucher disease in multiple system atrophy (2015)
  • 著者名/発表者名: Mitsui J, Matsukawa T, Sasaki H, Yabe I, Nakahara Y, Momose Y, Takahashi Y, Hara K, Kakita A, Yamada M, Takahashi H, Onodera O, Nishizawa M, Watanabe H, Nakashima K, Ito H, Izumi Y, Kaji R, Kato T, Tsuji S, et al.
  • 雑誌名: Ann Clin Transl Neurol. 巻: 2 号: 4 ページ: 417
  • DOI: 10.1002/acn3.185
  • URL: https://localhost/en/publications/c946bad2-a238-4d0e-a396-6d33b3922ab7
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] CHCHD2 mutations in autosomal dominant late-onset Parkinson’s disease: a genome-wide linkage and sequencing study. (2015)
  • 著者名/発表者名: Funayama M, Ohe K, Amo T, Furuya N, Yamaguchi J, Saiki S, Yuanzhe L, Ogaki K, Ando M, Yoshinon H, Tomiyama H, Nishioka K, Hasegawa K, Saiki H, Satake W, Mogushi K, Sasaki R, Kokubo Y, Kuzuhara S, Toda T, Mizuno Y, Uchiyama Y, Ohno K, Hattori N.
  • 雑誌名: Lancet Neurol 巻: 14 号: 3 ページ: 274-282
  • DOI: 10.1016/s1474-4422(14)70266-2
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] The first nationwide survey and genetic analyses of Bardet-Biedl syndrome in Japan (2015)
  • 著者名/発表者名: Hirano M, Satake W, Ihara K, Tsug I, Kondo S, Saida K, Betsui H, Okubo K, Sakamoto H, Ueno S, Ikuno Y, Ishihara R, Iwahashi H, Ohishi M, Mano T, Yamashita T, Suzuki Y, Nakamura Y, Kusunoki S, Toda T
  • 雑誌名: PLOS ONE 巻: 10 号: 9 ページ: e0136317-e0136317
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0136317
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Exome Analyses of Long QT Syndrome Reveal Candidate Pathogenic Mutations in Calmodulin-Interacting Genes. (2015)
  • 著者名/発表者名: Shigemizu D, Aiba T, Nakagawa H, Ozaki K, Miya F, Satake W, Toda T, Miyamoto Y, Fujimoto A, Suzuki Y, Kubo M, Tsunoda T, Shimizu W, Tanaka T.
  • 雑誌名: PLoS One. 巻: 10 (7) 号: 7 ページ: e0130329-e0130329
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0130329
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] A de novo mutation of the MYH7 gene in a large Chinese family with autosomal dominant myopathy (2015)
  • 著者名/発表者名: Oda T, Xiong H, Kobayashi K, Wang S, Satake W, Jiao H, Yang Y, Cha PC, Hayashi Y, Nishino I, Suzuki Y, Sugano S, Wu X, Toda T.
  • 雑誌名: Human Genome Variation 巻: 2 号: 1 ページ: 15022-15022
  • DOI: 10.1038/hgv.2015.22
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Novel calmodulin mutations associated with congenital arrhythmia susceptibility. (2014)
  • 著者名/発表者名: Makita N, Tsuji Y（39人中21番目）et al
  • 雑誌名: Circ Cardiovasc Genet. 巻: 7 号: 4 ページ: 466-474
  • DOI: 10.1161/circgenetics.113.000459
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A case of Bardet-Biedl syndrome complicated with intracranial hypertension in a Japanese child. (2014)
  • 著者名/発表者名: Saida K, Inaba Y, Hirano M, Satake W, Toda T, Suzuki Y, Sudo A, Noda S, Hidaka Y, Hirabayashi K, Imai H, Kurokawa T, Koike K.
  • 雑誌名: Brain Dev 巻: 印刷中 号: 8 ページ: 721-724
  • DOI: 10.1016/j.braindev.2013.10.013
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] YY1 binds to α-synuclein 3'-flanking region SNP and stimulates antisense noncoding RNA expression. (2013)
  • 著者名/発表者名: Mizuta I, Takafuji K, Ando Y, Satake W, Kanagawa M, Kobayashi K, Nagamori S, Shinohara T, Ito C, Yamamoto M, Hattori N, Murata M, Kanai Y, Murayama S, Nakagawa M, Toda T.
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 58 号: 11 ページ: 711-719
  • DOI: 10.1038/jhg.2013.90
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mutations in COQ2 in familial and sporadic multiple-system atrophy the multiple-system atrophy research collaboration (2013)
  • 著者名/発表者名: Mitsui J, et. al.
  • 雑誌名: N Engl J Med 巻: 369 号: 3 ページ: 233
  • DOI: 10.1056/nejmoa1212115
  • 査読あり
• [雑誌論文] 神経・精神疾患の動向 神経疾患と遺伝子 (2013)
  • 著者名/発表者名: 佐竹 渉ら
  • 雑誌名: 日本医師会雑誌神経・精神疾患診療マニュアル 巻: 142
• [雑誌論文] 遺伝性疾患の遺伝子検査 (2013)
  • 著者名/発表者名: 佐竹 渉
  • 雑誌名: Modern Physician 巻: 33 ページ: 625-628
• [雑誌論文] ゲノム多様性と神経変性疾患 (2013)
  • 著者名/発表者名: 佐竹 渉ら
  • 雑誌名: 細胞 巻: 45 ページ: 120-123
• [雑誌論文] ゲノムワイド関連解析からの知見とさらなる孤発性パーキンソン病遺伝子の発見へ向けて PARK16、BST1、α-synuclein、LRRK2、Tau (2013)
  • 著者名/発表者名: 佐竹 渉ら
  • 雑誌名: 医学のあゆみ 巻: 247 ページ: 1075-1078
• [学会発表] Genetics-based approach for understanding Parkinson's disease (2016)
  • 著者名/発表者名: Satake W, Toda T.
  • 学会等名: 第57回日本神経学会学術大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2016-05-18
  • 招待講演
• [学会発表] Exome Association study and 2nd SNP-GWAS of Parkinson’s disease in Japan (2016)
  • 著者名/発表者名: Satake W, Suzuki Y, Shigemizu D, .., Kubo M, Sugano S, Matsumoto N, Toda T.
  • 学会等名: The 13th International Congress of human Genetics
  • 発表場所: Kyoto
  • 年月日: 2016-04-03
  • 国際学会
• [学会発表] パーキンソン病のゲノム解析研究 (2016)
  • 著者名/発表者名: 佐竹渉
  • 学会等名: ニューロサイエンスネットワーク
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2016-03-18
• [学会発表] Genomic study and subsequent in silico drug discovery for Parkinson’s disease (2016)
  • 著者名/発表者名: Satake W, Uenaka T, Cha PC, Okada Y, Kashihara K, Murayama S, Hasegawa K, Mochizuki H, Takeda A, Yamamoto M, Murata M, Hattori N, Toda T
  • 学会等名: 5th Asian and Oceanian Parkinson’s Disease and Movement Disorders Congress
  • 発表場所: Manila
  • 年月日: 2016-03-11
  • 国際学会
• [学会発表] Parkinson’s disease Genomics and its Application (2016)
  • 著者名/発表者名: Satake W, Toda T.
  • 学会等名: 第4回これからのパーキンソン病治療を考える会
  • 発表場所: 東京
  • 招待講演
• [学会発表] パーキンソン病の遺伝背景解明とその応用 (2016)
  • 著者名/発表者名: Satake W, Toda T.
  • 学会等名: 兵庫医科大学インテンシブコースセミナー
  • 発表場所: 西宮
  • 招待講演
• [学会発表] Next step of GWAS and Exome study for Parkinson’s disease (2015)
  • 著者名/発表者名: Satake W, Takeda A, Mochizuki H, Hasegawa K, Yamamoto M, Murata M, Hattori N, Toda T
  • 学会等名: 10th Annual Meeting Genetic Epidemiology of Parkinson's disease
  • 発表場所: Tokyo
  • 年月日: 2015-10-01
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Genome-wide association study (GWAS) in neurodegenerative disorders (2015)
  • 著者名/発表者名: Satake W
  • 学会等名: International Parkinson and Movement Disorder Society Basic Summer School
  • 発表場所: Tokyo
  • 年月日: 2015-08-06
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Exome Association Study and 2nd SNP-GWAS of Japanese Parkinson's disease (2015)
  • 著者名/発表者名: Satake W, Ando Y, Suzuki M, Tomiyama H, Nagai Y, Kashihara K, Murayama S, Mochizuki H, Nakashima K, Hasegawa K, Takeda A, Wada K, Tsuji S, Yamamoto M, Murata M, Hattori N, and Toda T.
  • 学会等名: 19th International Congress of Parkinson's Disease and Movement Disorders
  • 発表場所: San Diego
  • 年月日: 2015-06-14
  • 国際学会
• [学会発表] Exome Association Study and 2nd SNP-GWAS of Parkinson's disease (2015)
  • 著者名/発表者名: Satake W， Ando Y， Suzuki M， Tomiyama H， Nagai Y， Murayama S， Mochizuki H， Nakashima K， Obata F， Hasegawa K， Takeda A， Wada K， Tsuji S， Yamamoto M， Murata M， Hattori N， Toda T
  • 学会等名: 第56回日本神経学会学術大会
  • 発表場所: 新潟
  • 年月日: 2015-05-20
• [学会発表] Exome Association study and SNP-GWAS of Parkinson’s disease (2015)
  • 著者名/発表者名: Satake W, Suzuki Y, Shigemizu D, Cha PC, Tsuji S, Tsunoda T, Kubo M, Sugano S, Matsumoto N, Toda T
  • 学会等名: The 11th International workshop on Advanced Genomics; 国際ゲノム会議
  • 発表場所: Tokyo
  • 年月日: 2015-05-20
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 孤発性パーキンソン病のエクソーム関連解析と第2期SNP-GWAS (2014)
  • 著者名/発表者名: 佐竹渉、重水大智、鈴木穣 、山本健、富山弘幸、高橋篤、村田美穂、服部信孝、田中敏博 、角田達彦 、久保充明、辻省次、松本直通 、菅野純夫、戸田 達史
  • 学会等名: 日本人類伝学会第59回大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2014-11-20 – 2014-11-22
• [学会発表] Risk genes and genome research of sporadic Parkinson’s disease (2014)
  • 著者名/発表者名: Satake W, Toda T
  • 学会等名: The 20th International Congress of Personalized Medicine
  • 発表場所: Tokyo
  • 年月日: 2014-11-15
  • 招待講演
• [学会発表] Exome Association Study and 2nd SNP-GWAS of Japanese Parkinson’s disease (2014)
  • 著者名/発表者名: Satake W, Shigemizu D, Suzuki Y, Yamamoto K, Tomiyama H, Yamamoto M, Murata M, Hattori N, Tsunoda T, Kubo M, Tsuji S, Nakamura Y, Sugano S, Toda T.
  • 学会等名: American Society of Human Genetics Annual meeting
  • 発表場所: San Diego
  • 年月日: 2014-10-18 – 2014-10-22
• [学会発表] Exome Association Study and 2nd SNP-GWAS of Japanese Parkinson’s disease (2014)
  • 著者名/発表者名: Satake W, Hasegawa K, Murata M, Hattori N, Toda T.
  • 学会等名: Genetic Epidemiology of Parkinson's disease Annual meeting
  • 発表場所: Vancouver
  • 年月日: 2014-09-10 – 2014-09-12
• [学会発表] Exome sequencing of Parkinson's disease in order to identify genetic variants with high disease-risk (2014)
  • 著者名/発表者名: Satake W, Ando Y, Tomiyama H, Kashihara K, Mochizuki H, Murayama S, Takeda A, Hasegawa K, Tsuji S, Yamamoto M, Murata M, Hattori N, Toda T.
  • 学会等名: The MDS 18th International Congress of Parkinson's Disease and Movement Disorders
  • 発表場所: Stockholm
  • 年月日: 2014-06-08 – 2014-06-12
• [学会発表] パーキンソン病感受性遺伝子α-synuiclein SNPとnoncoding RNA (2014)
  • 著者名/発表者名: 水田依久子、佐竹渉、村山繁雄、金川基、小林千浩、高藤和輝、永森収志、山本光利、服部信孝、村田美穂、金井好克、水野敏樹、中川正法、戸田達史
  • 学会等名: 第55回日本神経学会学術大会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2014-05-21 – 2014-05-24
• [学会発表] Exome sequencing of Parkinson's disease in order to identify genetic variants with high disease-risk (2014)
  • 著者名/発表者名: Satake W et al
  • 学会等名: New Frontier of Molecular Neuropathology
  • 発表場所: Tokyo, Japan
• [学会発表] Search for rare-variant risks of Parkinson’s disease by sequencing of candidate genes and exome sequencing (2013)
  • 著者名/発表者名: Satake W et al
  • 学会等名: The MDS 17th International Congress of Parkinson's Disease and Movement Disorders
  • 発表場所: Sydney, Australia
• [学会発表] Exome sequencing of Parkinson's disease in order to identify genetic variants with high disease-risk (2013)
  • 著者名/発表者名: Satake W et al
  • 学会等名: American Society of Human Genetics Annual meeting
  • 発表場所: Boston, USA
• [学会発表] エクソーム解読・一塩基多型解析によるパーキンソン病の遺伝背景の解明 (2013)
  • 著者名/発表者名: 佐竹渉ら
  • 学会等名: 2013年度包括脳ネットワーク夏のワークショップ
  • 発表場所: 名古屋
• [学会発表] 剖検脳を用いた孤発性パーキンソン病感受性遺伝子の解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 上田健博ら
  • 学会等名: 第54回日本神経学会学術大会
  • 発表場所: 東京
• [備考] 神戸大学神経内科
  • URL: http://www.med.kobe-u.ac.jp/im3/rinsyo/shinkei/index.html
• [備考] 神戸大学分子脳科学
  • URL: http://www.med.kobe-u.ac.jp/clgene/
• [備考] 神戸大学遺伝子診療部
  • URL: http://www.hosp.kobe-u.ac.jp/consultation/guide/department/idenshi.html