| 研究課題/領域番号 |
25730011
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| 研究種目 |
若手研究(B)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 研究分野 |
統計科学
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| 研究機関 | 東北大学 |
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研究代表者 |
小島 要 東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構, 講師 (10646988)
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| 研究期間 (年度) |
2013-04-01 – 2015-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2014年度)
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| 配分額 *注記 |
2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
2014年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2013年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
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| キーワード | 細胞内制御ネットワーク / エピジェネティクス / 次世代シークエンサー / 遺伝子発現 / 次世代シークエンサ / 遺伝子制御ネットワーク / 変異コール / 遺伝子発現量定量 |
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| 研究成果の概要 |
細胞内システムの解析において、遺伝子発現量のみを考慮した制御関係ネットワークが考えられてきたが、細胞分化の過程において遺伝子だけでなくDNAメチル化やヒストン修飾等のエピゲノム状態の変化により、制御関係が変化し、異なる機能を持つ細胞へ分化すると考えられている。本研究では、遺伝子とエピゲノムによる制御ネットワークの解析に用いられる、遺伝子発現量の高精度な推定手法の開発、並びにエピゲノム状態推定の高精度化のための基盤手法の開発を行う。さらに、細胞内制御ネットワークの解析を目的として、マウスの細胞分化過程における遺伝子発現量データならびにヒストン修飾データからの転写因子の結合予測手法の開発を行う。
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