• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

タンパク質の自動量子化学計算法と電子状態DBの開発

研究課題

研究課題/領域番号 25730174
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 生命・健康・医療情報学
研究機関東京大学

研究代表者

平野 敏行  東京大学, 生産技術研究所, 助教 (60451887)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円)
2014年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2013年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
キーワード量子化学 / タンパク質 / 電子状態計算 / 電子構造 / 密度汎関数法 / 電子状態
研究成果の概要

タンパク質の電子状態計算結果は、タンパク質の物性・反応性を理解する上で有益な情報を与える。タンパク質のような巨大分子の電子状態計算において、分子モデリング・電子状態計算ともに工程が複雑で達成が難しく、試行錯誤が必要であった。本研究では、分子モデリングに必要な処理を自動的に行うプログラムを作成し、また電子状態計算処理をほぼ自動的に効率良く行う計算方法を確立した。作成したプログラムはインターネット上に公開した。

報告書

(3件)
  • 2014 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2015 2014 2013

すべて 雑誌論文 (2件) (うちオープンアクセス 1件、 査読あり 1件) 学会発表 (8件) (うち招待講演 1件)

  • [雑誌論文] QCLO法によるグルコースオキシダーゼ活性中心の電子状態計算2015

    • 著者名/発表者名
      吉田洵也, 平野敏行, 佐藤文俊
    • 雑誌名

      生産研究

      巻: 67 ページ: 61-61

    • NAID

      130005074271

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] A third-generation density-functional-theory- based method for calculating canonical molecular orbitals of large molecules2014

    • 著者名/発表者名
      Toshiyuki Hirano and Fumotoshi Sato
    • 雑誌名

      Phys. Chem. Chem. Phys.

      巻: 未定 号: 28 ページ: 14496-14496

    • DOI

      10.1039/c3cp55514c

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 自由なフラグメント分割可能なQCLO法プログラムの開発2015

    • 著者名/発表者名
      平野敏行, 佐藤文俊
    • 学会等名
      理論化学討論会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2015-05-20 – 2015-05-22
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Development of a 3rd Gen DFT program: ProteinDF2014

    • 著者名/発表者名
      T. Hirano
    • 学会等名
      4th International Workshop on Massively Parallel Programming Now - Toward post-K computers
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2014-11-24
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] グリッドフリー密度汎関数計算法の進展2014

    • 著者名/発表者名
      平野敏行, 佐藤文俊
    • 学会等名
      分子科学討論会
    • 発表場所
      東広島
    • 年月日
      2014-09-21 – 2014-09-24
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 次世代スーパーコンピュータに向けたタンパク質の電子状態シミュレーション2014

    • 著者名/発表者名
      平野敏行, 佐藤文俊
    • 学会等名
      東京大学生命科学シンポジウム2014
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2014-04-26
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ProteinDF: Application Program Designed to Perform All-electron Canonical Molecular Orbital Calculation of Macromolecule2013

    • 著者名/発表者名
      Toshiyuki Hirano, Fumitoshi Sato
    • 学会等名
      International Symposium on Atomistic Modeling for Mechanics and Multiphysics of Materials (ISAM4)
    • 発表場所
      Tokyo, Japan
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Development of the unbiased density functional method for massively parallel computing2013

    • 著者名/発表者名
      Toshiyuki Hirano, Fumitoshi Sato
    • 学会等名
      15th International Conference on Density Functional Theory and its Applications
    • 発表場所
      Durham, UK
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] コレスキー分解を用いたグリッドフリー密度汎関数計算の研究2013

    • 著者名/発表者名
      平野 敏行, 樋口 恒, 佐藤 文俊
    • 学会等名
      第7回分子科学討論会
    • 発表場所
      京都
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] 量子化学シミュレーションによるタンパク質電子構造の解明2013

    • 著者名/発表者名
      平野 敏行, 佐藤 文俊
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi