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小分子化合物によるマイクロRNA生成効率の調節

研究課題

研究課題/領域番号 25750393
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 ケミカルバイオロジー
研究機関大阪大学

研究代表者

村田 亜沙子  大阪大学, 産業科学研究所, 助教 (50557121)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2014年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2013年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
キーワードマイクロRNA / 小分子化合物 / 核酸 / 発現制御 / バイオテクロノジー / バイオテクノロジー
研究成果の概要

本研究では,「pre-miRNA(miRNA前駆体)の切断反応を小分子化合物により調節する」ことを目指した.pre-miRNAの末端ループ配列をランダム化した末端ループ変異体ライブラリーから,当研究室で新規に合成されたナフチジリン誘導体RNDに結合する末端ループ配列をセレクション法により選別した.得られた末端ループ配列を導入したヘアピン型RNAは,RNDの結合によりその切断反応が顕著に阻害されることが分かった.また,ゲルシフトアッセイにより,RNDによる切断阻害効果は,RNDが変異体の末端ループに結合してループ間相互作用を誘起し,変異体ダイマーを形成することによることが分かった.

報告書

(4件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (19件)

すべて 2015 2014 2013

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (15件) (うち国際学会 4件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Exploratory Study on the RNA-Binding Structural Motifs by Library Screening Targeting pre-miRNA-29a.2015

    • 著者名/発表者名
      Fukuzumi, T.; Murata, A.; Aikawa, H.; Harada, Y.: Nakatani, K.
    • 雑誌名

      Chem. Eur. J.

      巻: 21 号: 47 ページ: 16859-16867

    • DOI

      10.1002/chem.201502913

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Synthesis of 8-substituted adenine and adenosine libraries and the binding to pre-miR-29a2014

    • 著者名/発表者名
      Fukuzumi, T.; Aikawa, H.; Harada, Y.; Sugai, A.; Murata, A.; Nakatani, K.
    • 雑誌名

      Bull. Chem. Soc. Jpn.

      巻: 87 号: 9 ページ: 1013-1015

    • DOI

      10.1246/bcsj.20140137

    • NAID

      130004687252

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Ligand-inducible formation of RNA pseudoknot2013

    • 著者名/発表者名
      Matsumoto, S., Hong, C; Otabe, T.; Murata, A.; Nakatani, K.
    • 雑誌名

      Bioorg. Med. Chem. Lett.

      巻: 23 号: 12 ページ: 3539-3541

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2013.04.037

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Fluorescent indicator displacement assay of ligands targeting 10 microRNA precursors2013

    • 著者名/発表者名
      Murata, A.; Harada, Y.; Fukuzumi, T.; Nakatani, K.
    • 雑誌名

      Bioorg. Med. Chem.

      巻: 21 号: 22 ページ: 7101-7106

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2013.09.007

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] SPR-based in vitro selection of pre-miRNA loop mutant molecules that bind to the restrained naphthyridine dimer2015

    • 著者名/発表者名
      Yuki Mori, Yue Di, Ayako Sugai, Asako Murata, Kazuhiko Nakatani
    • 学会等名
      Pacifichem2015
    • 発表場所
      Hawaii, USA
    • 年月日
      2015-12-15
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] A small-molecule inhibitor of pre-miR-29 maturation2015

    • 著者名/発表者名
      Asako Murata, Takahiro Otabe, Jinhua Zhang, Kazuhiko Nakatani
    • 学会等名
      Pacifichem2015
    • 発表場所
      Hawaii, USA
    • 年月日
      2015-12-15
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Small molecule-Loop Interaction that interferes the maturation on process of pre-miRNA by Dicer2015

    • 著者名/発表者名
      Yuki Mori, Yue Di, Ayako Sugai, Asako Murata, Kazuhiko Nakatani
    • 学会等名
      ISNAC2015
    • 発表場所
      姫路
    • 年月日
      2015-09-23
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] In vitro selection of pre-miRNA loop mutant molecules that bind to the restrained naphthyridine dimer2015

    • 著者名/発表者名
      Asako Murata, Yuki Mori, Yue Di, Ayako Sugai, Kazuhiko Nakatani
    • 学会等名
      RNA2015, The 20th Annual Meeting of the RNA Society
    • 発表場所
      Wisconsin, USA
    • 年月日
      2015-05-26
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] SPRを用いたin vitro selectionによるRND(the restrained naphthyridine dimer)結合性RNAアプタマーの探索2015

    • 著者名/発表者名
      森友紀、邸つき、須貝亜矢子、李金星、小田部尭広、相川春夫、村田亜沙子、中谷和彦
    • 学会等名
      日本化学会第95春季年会
    • 発表場所
      日本大学(千葉県、船橋)
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] RNA結合性小分子の創成を指向したエンタルピー駆動型分子の設計と合成2015

    • 著者名/発表者名
      夏原望、邸つき、Mukherjee Sanjukta、村田亜沙子、中谷和彦
    • 学会等名
      日本化学会第95春季年会
    • 発表場所
      日本大学(千葉県、船橋)
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] BzDANPによるRNAプロセシング阻害の速度論的解析2015

    • 著者名/発表者名
      小田部尭広、村田亜沙子、中谷和彦
    • 学会等名
      日本化学会第95春季年会
    • 発表場所
      日本大学(千葉県、船橋)
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] Suppression of miR-29a maturation by synthetic ligand2014

    • 著者名/発表者名
      Takahiro Otabe, Jinxin Li, Asako Murata, Kazuhiko Nakatani
    • 学会等名
      ISNAC2014
    • 発表場所
      北九州国際会議場(福岡県、小倉)
    • 年月日
      2014-11-05 – 2014-11-07
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] In vitro selection of pre-miR-29a loop mutant library against the restrained naphthyridine dimer2014

    • 著者名/発表者名
      Yuki Mori, Yue Di, Ayako Sugai, Takahiro Otabe, Jinxin Li, Haruo Aikawa, Asako Murata, Kazuhiko Nakatani
    • 学会等名
      ISNAC2014
    • 発表場所
      北九州国際会議場(福岡県、小倉
    • 年月日
      2014-11-05 – 2014-11-07
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] 小分子によるmiR-29a成熟過程の阻害2014

    • 著者名/発表者名
      小田部尭広、村田亜沙子、武井史恵、中谷和彦
    • 学会等名
      日本ケミカルバイオロジー学会 第9回年会
    • 発表場所
      大阪大学(大阪府,豊中)
    • 年月日
      2014-06-11 – 2014-06-13
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] RNAの構造・機能を制御する小分子化合物の開発2014

    • 著者名/発表者名
      村田亜沙子
    • 学会等名
      日本化学会第94春季年会
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知県名古屋市)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Targeting secondary structures of pre-miRNA by small molecules : Development of potential inhibitors of pre-miRNA processing2013

    • 著者名/発表者名
      Asako Murata, Ayako Sugai, Takeo Fukuzumi, Shiori Umemoto, Chikara Dohno, Kazuhiko Nakatani
    • 学会等名
      RNA 2013, the 18th Annual Meeting of the RNA Society
    • 発表場所
      Congress Center Davos (Davos, Switzerland)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Suppression of miR-29a maturation by ligand binding2013

    • 著者名/発表者名
      Takahiro Otabe, Asako Murata, Fumie Takei, Kazuhiko Nakatani
    • 学会等名
      RNA 2013, the 18th Annual Meeting of the RNA Society
    • 発表場所
      Congress Center Davos (Davos, Switzerland)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Translational regulation by ligand-inducible formation of RNA pseudoknot2013

    • 著者名/発表者名
      Saki Matsumoto, Changfeng Hong, Asako Murata, Kazuhiko Nakatani
    • 学会等名
      RNA 2013, the 18th Annual Meeting of the RNA Society
    • 発表場所
      Congress Center Davos (Davos, Switzerland)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Synthesis of the restrained naphthyridine dimer and the exploration for binding RNA by in vitro selection2013

    • 著者名/発表者名
      Yue Di, Takahiro Otabe, Jinxing Li, Asako Murata, Kazuhiko Nakatani
    • 学会等名
      ISNAC2013
    • 発表場所
      神奈川大学(神奈川県横浜市)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書

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公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

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