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高感度遺伝子トランジスタによる長鎖塩基配列解析を目指した機能性界面ゲートの構築

研究課題

研究課題/領域番号 25790012
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 ナノ材料化学
研究機関東京医科歯科大学

研究代表者

三條 舞  東京医科歯科大学, 生体材料工学研究所, 助教 (60588797)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 中途終了 (2014年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2015年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2014年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2013年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
キーワードピロリン酸 / ピリジルボロン酸 / 分子認識 / ボロン酸 / トランジスタ / シーケンシング
研究実績の概要

本研究は、電界効果トランジスタ(FET)の原理を用いた電気化学的測定によるDNAシーケンシング技術をベースに、トランジスタゲート表面の徹底的な造り込みによって、新しい手法に基づくFET型DNAシーケンサを開発する事を目的とする。ここではDNA伸長反応により放出されるピロリン酸(PPi)を特異的に認識結合する人工レセプターの設計・合成・分子認識能の評価を通して、最適化された機能性界面ゲートを構築する。具体的には、水溶性が高く、かつ多くの誘導体のなかでも顕著に低い酸解離定数(pKa)を有するピリジルボロン酸(PyBA)に着目し、 PPi認識レセプトーとしての有用性を検討した。11B-および31P-核磁気共鳴(NMR)測定の結果から、PyBAとPPiの間で可逆的かつ比較的安定な結合を形成することが確認され、特に酸性領域で安定なコンプレックスを形成することが明らかとなった。また質量分析(MS)測定の結果から、PyBAとPPiの結合においては、解離型(4価)のボロン酸基が安定な結合をもたらすことが判明した。さらに一リン酸、三リン酸、dATPをはじめ他のリン酸化合物とは殆ど結合を示さないことから、PyBAのPPiへの選択性は極めて高いと言える。このPPiを選択的に認識結合するPyBAレセプターの発見は本研究で初めて明らかにされ、実用的観点だけでなく、基礎学問の観点からも興味深い重要な知見を与えた。PyBAを用いた機能性界面ゲートの構築により長鎖塩基配列解析が達成された暁には、これまで以上に簡便、高速、安価に遺伝子配列解析を可能にする技術として、広く社会に貢献できると考える。

報告書

(2件)
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2015 2014 2013

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (8件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Boronate Based Metal-Free Platform for Diphosphate-Specific Molecular Recognitions2015

    • 著者名/発表者名
      Mai Sanjoh, Daisuke Iizuka, Akira Matsumoto, Yuji Miyahara
    • 雑誌名

      Organic Letters

      巻: 17 号: 3 ページ: 588-591

    • DOI

      10.1021/ol5036003

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Phenylboronic Acids-based Diagnostic and Therapeutic Applications2014

    • 著者名/発表者名
      Mai Sanjoh, Yuji Miyahara, Kazunori Kataoka, Akira Matsumoto
    • 雑誌名

      Analytical Sciences

      巻: 30 号: 1 ページ: 111-117

    • DOI

      10.2116/analsci.30.111

    • NAID

      130004442231

    • ISSN
      0910-6340, 1348-2246
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] ボロン酸誘導体の分子認識能を利用したピロリン酸の選択的検出2015

    • 著者名/発表者名
      三條 舞
    • 学会等名
      第24回インテリジェント材料・システムシンポジウム
    • 発表場所
      東京女子医大
    • 年月日
      2015-01-19
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 二リン酸特異的な結合能を示すボロン酸誘導体による分子認識場の構築2014

    • 著者名/発表者名
      三條 舞
    • 学会等名
      第63回高分子討論会等
    • 発表場所
      長崎大学
    • 年月日
      2014-09-24 – 2014-09-26
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] A new molecular basis for specific pyrophosphate chemosencing2014

    • 著者名/発表者名
      三條 舞
    • 学会等名
      The 7th Asia-Pacific Conference on Transducers and Micro/Nano Technologies: APCOT 2014
    • 発表場所
      Hotel Inter-Burgo EXCO
    • 年月日
      2014-06-29 – 2014-07-02
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ボロン酸誘導体による二リン酸特異的結合様式の発見と新規ピロリン酸検出法への展開2014

    • 著者名/発表者名
      三條舞,松元亮,宮原裕二
    • 学会等名
      第16回電気学会全国大会
    • 発表場所
      愛媛(愛媛大学)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Molecular recognition by boronic acid derivertive for effective pyrophosphate chemosensing2013

    • 著者名/発表者名
      Mai Sanjoh, Akira Matsumoto, Yuji Miyahara
    • 学会等名
      The 7th International Conference on Microtechnologies in Medicine and Biology
    • 発表場所
      USA, California, (Marina del Rey)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] ピリジルボロン酸による分子認識能を利用したピロリン酸の選択的検出2013

    • 著者名/発表者名
      三條舞,松元亮,宮原裕二
    • 学会等名
      第62回高分子討論会
    • 発表場所
      金沢(金沢大学)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] 核酸増幅の電気化学的モニタリング2013

    • 著者名/発表者名
      山田恵梨子,野上こずえ,田畑美幸,三條舞,前田康弘,合田達郎,松元亮,宮原裕二
    • 学会等名
      第35回日本バイオマテリアル学会大会
    • 発表場所
      東京(タワーホール船堀)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Electrochemical Monitoring of Nucleic Acid Amplification2013

    • 著者名/発表者名
      Eriko Yamada, Kozue Nogami, Miyuki Tabata, Mai Sanjoh, Yasuhiro Maeda, Taturo Goda, Akira Matsumoto, Yuji Miyahara
    • 学会等名
      International Symposium on EcoTopia Science 2013
    • 発表場所
      Nagoya(Nagoya University)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [産業財産権] 二リン酸化合物検出器、及び二リン酸化合物検出方法2014

    • 発明者名
      宮原 裕二、松元 亮、三條 舞
    • 権利者名
      宮原 裕二、松元 亮、三條 舞
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2014-03-27
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書

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公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

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