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ウイルス感染動態中のタンパク質発現時間分布モデリングとデータ解析理論の構築

研究課題

研究課題/領域番号 25800092
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 数学基礎・応用数学
研究機関九州大学

研究代表者

岩見 真吾  九州大学, 理学(系)研究科(研究院), 准教授 (90518119)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2014年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
2013年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワード数理モデル / データ解析 / 偏微分方程式 / ウイルス感染実験 / パラメータ推定 / ウイルス感染 / 時間遅れを持つ微分方程式 / 時間遅れをもつ微分方程式 / 微分方程式 / 融合研究
研究成果の概要

偏微分方程式を用いて細胞内、及び、細胞間のウイルス感染動態を記述する数理モデルを開発した。また、開発した数理モデルの数理解析より、“ウイルス感染を特徴づける動的指標”の定式化を行い、数理モデルの力学系的構造・安定性を調べた。次に、培養細胞を用いたHIV-1感染実験から得られた、感染細胞内のタンパク質発現時間の累積分布データより、発現時間分布(すなわち、偏微分方程式に用いられている確率密度関数)を推定した。

報告書

(3件)
  • 2014 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2015 2014 2013

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 謝辞記載あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (4件) (うち招待講演 1件)

  • [雑誌論文] A conservation law for virus infection kinetics in vitro2015

    • 著者名/発表者名
      Yusuke Kakizoe, Satoru Morita, Shinji Nakaoka, Yasuhiro Takeuchi, Kei Sato, Tomoyuki Miura, Catherine A. A. Beauchemin, and Shingo Iwami
    • 雑誌名

      Journal of Theoretical Biology

      巻: 376 ページ: 39-47

    • DOI

      10.1016/j.jtbi.2015.03.034

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] A method to determine the duration of the eclipse phase for in vitro infection with a highly pathogenic SHIV strain2015

    • 著者名/発表者名
      Yusuke Kakizoe, Shinji Nakaoka, Catherine A. A. Beauchemin, Satoru Morita, Hiromi Mori, Tatsuhiko Igarashi, Kazuyuki Aihara, Tomoyuki Miura, Shingo Iwami
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: accepted

    • NAID

      120005689172

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] タイムラグを持つ微分方程式によるウイルス感染動態の定量的解析2014

    • 著者名/発表者名
      岩見真吾
    • 学会等名
      日本数学会 秋季総合分科会 2013
    • 発表場所
      広島大学
    • 年月日
      2014-09-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] タイムラグをもつ微分方程式を用いたデータ解析2014

    • 著者名/発表者名
      岩見 真吾
    • 学会等名
      博多駅前セミナー
    • 発表場所
      リファレンスビル駅東ビル
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Modeling ecliptic phase of SHIV infection in cell culture2014

    • 著者名/発表者名
      Yusuke Kakizoe, Shinji Nakaoka, Tomoyuki Miura and Shingo Iwami
    • 学会等名
      the 9th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology
    • 発表場所
      Chalmers Conference Centre, Gothenburg, Sweden
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] ウイルスタンパク質産生時間を考慮した数理モデルの構築2013

    • 著者名/発表者名
      柿添 友輔、岩見 真吾
    • 学会等名
      数理解析研究所研究集会「第10回生物数学の理論とその応用2013」
    • 発表場所
      京都大学数理解析研究所
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書

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公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

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