転移因子を抑制する新規小分子RNA機能の解析

• 研究課題/領域番号: 25830134
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: ゲノム生物学
• 研究機関: 慶應義塾大学
• 研究代表者: 岩崎 由香 慶應義塾大学, 医学部, 助教 (80612647)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円); 2014年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円); 2013年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
• キーワード: 小分子RNA / トランスポゾン / 遺伝子発現抑制 / 生殖組織 / 非コードRNA / RNAサイレンシング / 転移因子 / 遺伝子発現制御 / Argonauteタンパク質

研究成果の概要

霊長類生殖組織における小分子RNAを介したトランスポゾンの発現抑制に関しては未知の部分が大きい。そこで、霊長類モデル生物マーモセットの小分子RNAを次世代シーケンサにより網羅的に解析した。その結果、マーモセット精巣において、トランスポゾン領域由来の新規miRNAなどを同定すると同時に、発現している小分子RNAの大部分がpiRNAに占められていることを見いだした。piRNAについて詳細な解析を進めたところ、多くがトランスポゾン類似配列やトランスポゾン自身に由来していた。さらに、トランスポゾンの転移能と発現するpiRNA量などの特徴を解析し、piRNAによるトランスポゾン抑制モデルを提唱した。

研究成果

• [雑誌論文] Respective functions of two distinct Siwi complexes assembled during piRNA biogenesis in insect germ cells. (2015)
  • 著者名/発表者名: Nishida, KM., Iwasaki, YW., Murota, Y., Nagao, A., Mannen, T., Kato, Y., Siomi, H., and Siomi, MC.
  • 雑誌名: Cell Reports 巻: 10 号: 2 ページ: 193-203
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2014.12.013
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] PIWI-interacting RNA: Its Biogenesis and Functions (2015)
  • 著者名/発表者名: Iwasaki Y.W., Siomi M.C., Siomi H.
  • 雑誌名: Annual Review of Biochemistry 巻: 84 号: 1 ページ: 405-433
  • DOI: 10.1146/annurev-biochem-060614-034258
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Small RNA profiling and characterization of piRNA clusters in the adult testes of the common marmoset, a model primate. (2014)
  • 著者名/発表者名: Hirano T, Iwasaki YW, Lin ZY, Imamura M, Seki NM, Sasaki E, Saito K, Okano H, Siomi MC, *Siomi H.
  • 雑誌名: RNA 巻: 20 号: 8 ページ: 1223-1237
  • DOI: 10.1261/rna.045310.114
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Yb Integrates piRNA Intermediates and Processing Factors into Perinuclear Bodies to Enhance piRISC Assembly. (2014)
  • 著者名/発表者名: Murota Y, Ishizu H, Nakagawa S, Iwasaki YW, Shibata S, Kamatani MK, Saito K, Okano H, Siomi H, Siomi MC.
  • 雑誌名: Cell Rep. 巻: 8 号: 1 ページ: 103-113
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2014.05.043
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Epigenetic silencing of miR-210 increases the proliferation of gastric epithelium during chronic Helicobacter pylori infection (2014)
  • 著者名/発表者名: Kiga K et.al
  • 雑誌名: Nat Commun 巻: 5 号: 1 ページ: 4497-4497
  • DOI: 10.1038/ncomms5497
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] miRNA regulatory ecosystem in early embryogenesis (2014)
  • 著者名/発表者名: Iwasaki, YW and Siomi, H
  • 雑誌名: Molecular Cell 巻: 56 号: 5 ページ: 615-616
  • DOI: 10.1016/j.molcel.2014.11.010
  • オープンアクセス
• [雑誌論文] DmGTSF1 is necessary for Piwi–piRISC-mediated transcriptional transposon silencing in the Drosophila ovary (2013)
  • 著者名/発表者名: Ohtani H et al.
  • 雑誌名: Genes Dev. 巻: 27 号: 15 ページ: 1693-1705
  • DOI: 10.1101/gad.221150.113
  • 査読あり
• [雑誌論文] Global microRNA elevation by inducible Exportin 5 regulates cell cycle entry (2013)
  • 著者名/発表者名: Iwasaki, Y. W.; Kiga, K.; Kayo, H.; Fukuda-Yuzawa, Y.; Weise, J.; Inada, T.; Tomita, M.; Ishihama, Y..; Fukao, T.
  • 雑誌名: RNA 巻: 19 (4) 号: 4 ページ: 490-7
  • DOI: 10.1261/rna.036608.112
  • 査読あり
• [雑誌論文] 小分子RNAを介したゲノムレベルの自己と非自己の認識 (2013)
  • 著者名/発表者名: 岩崎由香、齋藤都暁
  • 雑誌名: 実験医学 巻: 31 ページ: 98-106
• [学会発表] Piwi-piRNA regulates association of linker histone H1 with target transposon loci in Drosophila (2015)
  • 著者名/発表者名: Iwasaki Y.W., Ishizu H., Shibuya A., Iyoda Y., Siomi M.C., Siomi H., Saito K.
  • 学会等名: The Twentieth Annual Meeting of the RNA Society (RNA2015)
  • 発表場所: Madison, Wisconsin, USA
  • 年月日: 2015-05-26 – 2015-05-31
• [学会発表] Piwi-piRNA regulates association of histone H1 with target chromatin loci (2014)
  • 著者名/発表者名: Iwasaki Y.W., Shibuya A., Ohtani H., Siomi M.C., Siomi H., Saito K.
  • 学会等名: Cell Symposia Regulatory RNAs
  • 発表場所: Berkeley, California, USA
  • 年月日: 2014-10-19 – 2014-10-24
• [学会発表] 霊長類生殖組織におけるトランスポゾン抑制小分子RNAの解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 岩崎由香、平野孝昌、Lin Zachary Yu-Ching, 今村公紀、關菜央美、佐々木えりか、齋藤都暁、岡野栄之、塩見美喜子、塩見春彦
  • 学会等名: 日本遺伝学会第86回大会
  • 発表場所: 長浜バイオ大学、長浜
  • 年月日: 2014-09-17 – 2014-09-19
  • 招待講演
• [学会発表] 霊長類生殖組織における小分子RNAの統合的解析
  • 著者名/発表者名: 岩崎由香、平野孝昌、Zachary Yu-Ching Lin, 今村公紀、佐々木えりか、岡野栄之、齋藤都暁、塩見美喜子、塩見春彦
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
  • 招待講演