一細胞シークエンシングによる、超早期発がん過程におけるがん細胞進化の解明

• 研究課題/領域番号: 25830141
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: ゲノム医科学
• 研究機関: 独立行政法人国立がん研究センター
• 研究代表者: 加藤 護 独立行政法人国立がん研究センター, 研究所, ユニット長 (40391916)
• 連携研究者: 柴田 龍弘 独立行政法人国立がん研究センター, 研究所, 分野長 (90311414)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円); 2014年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円); 2013年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
• キーワード: 一細胞シークエンス / 次世代シークエンサー / がんゲノム / がん細胞進化 / 発がん

研究成果の概要

がんがどのように生成され、進展していくのかが解明されれば、がんの適切な予防法や治療法に将来つながっていく。がんの生成・進展は、細胞レベルで見れば1細胞が細胞分裂を経てより強いものが生き残っていくため、ダーウィン進化にたとえられる。この進化を解明するには、経時的に1細胞ごとの遺伝的変化を追っていけばよい。我々は本研究において、ヒト大腸癌の進展を模すマウス小腸発がん系において、がん進展3時刻点の各時刻点30 細胞ほど、一細胞ごとのゲノムを抽出した。ゲノムを分析にするには変異を同定する分析アルゴリズムが必要であるが、我々はこれを、アルゴリズム調整用に測定した一細胞ごとのゲノムデータを用いて開発した。

研究成果

• [雑誌論文] Development of Lung Adenocarcinomas with Exclusie Dependence on Oncogene Fusions. (2015)
  • 著者名/発表者名: Motonobu Saito, Yoko Shimada, Kouya Shiraishi, Hiromi Sakamoto, Koji Tsuta, Hirohiko Totsuka, Suenori Chiku, Hitoshi Ichikawa, Mamoru Kato, Shun-ichi Watanabe, Teruhiko Yoshida, Jun Yokota, Takashi Kohno
  • 雑誌名: Cancer Research 巻: - 号: 11 ページ: 2264-2271
  • DOI: 10.1158/0008-5472.can-14-3282
  • 査読あり
• [雑誌論文] Profiling of actionable gene alterations in ovarian cancer by targeted deep sequencing. (2015)
  • 著者名/発表者名: Masataka Takenaka, Motonobu Saito, Reika Iwakawa, Nozomu Yanaihara, Misato Saito, Mamoru Kato, Hitoshi Ichikawa, Tatsuhiro Shibata, Jun Yokota, Aikou Okamoto, Takashi Kohno
  • 雑誌名: International Journal of Oncology 巻: 46 号: 6 ページ: 2389-2398
  • DOI: 10.3892/ijo.2015.2951
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comprehensive DNA adduct analysis reveals pulmonary inflammatory response contributes to genotoxic action of magnetite nanoparticles (2015)
  • 著者名/発表者名: Kousuke Ishino, Tatsuya Kato, Mamoru Kato, Tatsuhiro Shibata, Masatoshi Watanabe, Keiji Wakabayashi, Hitoshi Nakagama, Yukari Totsuka
  • 雑誌名: Int.J.Mol.Sci 巻: 16 ページ: 3474-3492
  • 査読あり
• [雑誌論文] Trans-ancestry mutational landscape of hepatocellular carcinoma genomes. (2014)
  • 著者名/発表者名: Yasushi Totoki, Kenji Tatsuno, Kyle R Covington, Hiroki Ueda, Chad J Creighton, Mamoru Kato, Shingo Tsuji, Lawrence A Donehower, Betty L Slagle, Hiromi Nakamura, Shogo Yamamoto, Eve Shinbrot, Natsuko Hama, Megan Lehmkuhl, Fumie Hosoda, Yasuhito Arai, Kim Walker, ・・・・ Hiroyuki Aburatani & Tatsuhiro Shibata
  • 雑誌名: Nature Genetics 巻: 46 ページ: 1267-1273
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular mechanisms underlying oncogenic RET fusion in lung adenocarcinoma. (2014)
  • 著者名/発表者名: Tatsuji Mizukami, Kouya Shiraishi, Yoko Shimada, Hideaki Ogiwara, Koji Tsuta, Hitoshi Ichikawa, Hiromi Sakamoto, Mamoru Kato, Tatsuhiro Shibata, Takashi Nakano, Takashi Kohno,
  • 雑誌名: Journal of Thoracic Oncology 巻: 9 ページ: 622-630
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mutually exclusive mutations of KIT and RAS are associated with KIT mRNA expression and chromosomal instability in primary intracranial pure germinomas (2014)
  • 著者名/発表者名: Shintaro Fukushima, Ayaka Otsuka, Tomonari Suzuki, Takaaki Yanagisawa, Kazuhiko Mishima, Akitake Mukasa, Nobuhito Saito, Toshihiro Kumabe, ・・・・Mamoru Kato, Tatsuhiro Shibata, ・・・・ Koichi Ichimura, On behalf of the Intracranial Germ Cell Tumor Genome Analysis Consortium (iGCT Consortium)
  • 雑誌名: Acta Neuropathologica 巻: 127 ページ: 911-925
  • 査読あり
• [雑誌論文] NCYM, a de novo evolved protein, stabilizes MYCN and characterizes human neuroblastoma. (2014)
  • 著者名/発表者名: Yusuke Suenaga, S. M. Rafiqul Islam, Jennifer Alagu, Yoshiki Kaneko, Mamoru Kato, Yukichi Tanaka, Hidetada Kawana, Shamim Hossain, Daisuke Matsumoto, Mami Yamamoto, Wataru Shoji, Makiko Itami, Tatsuhiro Shibata, Yohko Nakamura, Miki Ohira, Seiki Haraguchi, Atsushi Takatori, Akira Nakagawara.
  • 雑誌名: PLoS Genetics 巻: 10
  • 査読あり
• [雑誌論文] 一細胞ゲノム解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 加藤護
  • 雑誌名: 医学の歩み 巻: 249 ページ: 1088-1092
• [雑誌論文] 発がんドライバー変異の同定 (2014)
  • 著者名/発表者名: David Tamborero, Abel Gonzalez-Perez, and Nuria Lopez-Bigas; 加藤護（訳）
  • 雑誌名: 実験医学 巻: 32 ページ: 213-219
• [学会発表] Cancer-cell evolution revealed by observations at different time points (2013)
  • 著者名/発表者名: Mamoru Kato
  • 学会等名: 72nd Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
  • 発表場所: 横浜、パシフィコ横浜
• [学会発表] Case report on wet-dry fusion by a dry researcher who aims at wet research goals (2013)
  • 著者名/発表者名: Mamoru Kato
  • 学会等名: The 36th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan
  • 発表場所: 神戸、神戸国際会議場
• [図書] 一細胞ゲノム解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 加藤 護
  • 総ページ数: 5
  • 出版者: 医学の歩み