真核生物における小分子RNA作用機序の構造基盤の解明

• 研究課題/領域番号: 25840019
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 構造生物化学
• 研究機関: 新潟大学
• 研究代表者: 三好 智博 新潟大学, 研究推進機構超域学術院, 助教 (60534550)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円); 2015年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2014年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2013年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
• キーワード: Argonaute / small RNA / 小分子RNA / 遺伝子発現制御 / X線結晶構造解析 / RNAサイレンシング / 小分子核酸 / non-coding RNA

研究成果の概要

Argonauteは、バクテリアから真核生物にまで全ての生物界に存在し、核酸の配列依存的なサイレンシング機構において必要不可欠なタンパク質である。これまでに多くの研究により、Argonaute-核酸複合体の構造的知見が得られてきた。しかしながら、Argonauteによるガイド鎖とターゲット鎖の認識メカニズムの詳細は、未だ不明のままである。本研究では、ガイド鎖をRNAとし、ターゲット鎖をDNAとするArgonauteタンパク質複合体をX線結晶構造解析により、明確に示すことに成功した。

研究成果

• [雑誌論文] Crystal structure of translation initiation factor 5B from the crenarchaeon Aeropyrum pernix. (2016)
  • 著者名/発表者名: Murakami R, Miyoshi T, Uchiumi T, Ito K.
  • 雑誌名: Proteins 巻: in press 号: 5 ページ: 712-717
  • DOI: 10.1002/prot.25009
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Functional role of the C-terminal tail of the archaeal ribosomal stalk in recruitment of two elongation factors to the sarcin/ricin loop of 23S rRNA. (2015)
  • 著者名/発表者名: Imai, H, Miyoshi, T, Murakami, R, Ito, K, Ishino, Y, and Uchiumi, T.
  • 雑誌名: Genes. Cells 巻: 20 号: 7 ページ: 613-624
  • DOI: 10.1111/gtc.12256
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Solution structure of human P1-P2 heterodimer provides insights into the role of eukaryotic stalk in recruiting the ribosome-inactivating protein trichosanthin to the ribosome (2013)
  • 著者名/発表者名: Lee, K.M., Yusa, K., Chu, L.O., Yu, C.W., Oono, M., Miyoshi, T., Ito, K., Shaw, P.C., Wong, K.B., and Uchiumi, T
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 41 号: 18 ページ: 8776-8787
  • DOI: 10.1093/nar/gkt636
  • 査読あり
• [学会発表] アルゴノート蛋白質によるガイド/ターゲット二本鎖の新結合様式 (2015)
  • 著者名/発表者名: 三好智博、伊東孝介、村上僚、内海利男
  • 学会等名: 第38回日本分子生物学学会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2015-12-01
• [学会発表] Recognition mechanism of guide RNA-target DNA heterodupulex by Argonaute (2015)
  • 著者名/発表者名: Tomohiro Miyoshi, Kosuke Ito, Ryo Murakami, Toshio Uchiumi
  • 学会等名: EMBL Symposium
  • 発表場所: EMBL Advanced Training Centre (Germany)
  • 年月日: 2015-10-18
  • 国際学会
• [学会発表] Rhodobacter sphaeroides ArgonauteによるガイドRNA/ターゲットDNA認識機構の構造基盤 (2015)
  • 著者名/発表者名: 三好智博、伊東孝祐、村上僚、内海利男
  • 学会等名: 第17回日本RNA学会年会
  • 発表場所: ホテルライフォート札幌
  • 年月日: 2015-07-15
• [学会発表] RNA-guided DNA interferenceを担うArgonauteタンパク質 (2015)
  • 著者名/発表者名: 三好智博、伊東孝祐、村上僚、内海利男
  • 学会等名: 平成27年度日本生化学会関東支部例会
  • 発表場所: 新潟日報メディアシップ
  • 年月日: 2015-06-20
• [学会発表] リボトキシン作用に関与するリボソームP1/P2ダイマーの柔軟な機能構造 (2013)
  • 著者名/発表者名: 遊佐和之、三好智博、Ka-Ming Lee、Lai-On Chu, Conny Wing-Heng Yu, 大野萌、伊東孝祐、Pang-Chui Shaw, Kam-Bo Wong、内海利男
  • 学会等名: 第8回 無細胞生命科学研究会
  • 発表場所: 新潟大学