• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

Nodalシグナルによるepiblastの未分化維持機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 25840087
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 発生生物学
研究機関九州大学

研究代表者

沖 真弥  九州大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (90452713)

連携研究者 目野 主税  九州大学, 大学院医学研究院, 教授 (20311764)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2014年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2013年度: 3,120千円 (直接経費: 2,400千円、間接経費: 720千円)
キーワードNodal / エピブラスト / 中胚葉誘導 / 原条形成 / 多分化能 / ChIP-seq
研究成果の概要

本研究ではマウス初期発生において極めて重要な役割を演じるNodalシグナルの直接的な標的遺伝子を同定し、エピブラストの多分化能維持機構、神経上皮への分化抑制、または原条形成に関わる遺伝子を特定した。またChIP-seqデータを簡易的に利活用できるためのソフトウェア(SraTailor)とデータベース(ChIP-Atlas)を作成し、ウェブを通じて公開した。

報告書

(4件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (21件)

すべて 2016 2015 2014 2013 その他

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 6件、 オープンアクセス 3件、 謝辞記載あり 3件) 学会発表 (12件) (うち国際学会 1件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Chd5 Regulates MuERV-L/MERVL Expression in Mouse Embryonic Stem Cells Via H3K27me3 Modification and Histone H3.1/H3.2.2015

    • 著者名/発表者名
      Hayashi M, Maehara K, Harada A, Semba Y, Kudo K, Takahashi H, Oki S, Meno C, Ichiyanagi K, Akashi K, Ohkawa Y.
    • 雑誌名

      J Cell Biochem

      巻: 117 号: 3 ページ: 780-792

    • DOI

      10.1002/jcb.25368

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Hyperglycemia impairs left-right axis formation and thereby disturbs heart morphogenesis in mouse embryos.2015

    • 著者名/発表者名
      Hachisuga M, Oki S, Kitajima K, Ikuta S, Sumi T, Kato K, Wake N, Meno C.
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci U S A.

      巻: 112 号: 38 ページ: 5300-5307

    • DOI

      10.1073/pnas.1504529112

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] SraTailor: graphical user interface software for processing and visualizing ChIP-seq data.2014

    • 著者名/発表者名
      Oki S, Maehara K, Ohkawa Y, Meno C
    • 雑誌名

      Genes to Cells

      巻: 19 号: 12 ページ: 919-926

    • DOI

      10.1111/gtc.12190

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Self-regulated left-right asymmetric expression of Pitx2c in the developing limb2014

    • 著者名/発表者名
      Shiratori, H., Yashiro, Iwai, N., Oki, S., Ikawa, Y., Kanata, K., and Hamada, H.
    • 雑誌名

      Dev. Biol.

      巻: 395 号: 2 ページ: 331-341

    • DOI

      10.1016/j.ydbio.2014.09.002

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] SraTailor: 誰でも使えるChIP-seqデータの可視化ツール2014

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 雑誌名

      実験医学

      巻: 19 ページ: 3101-06

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Wnt signaling regulates left-right axis formation in the node of mouse embryos2013

    • 著者名/発表者名
      Kitajima, Oki, Ohkawa, Sumi, Meno
    • 雑誌名

      Dev Biol

      巻: 380 号: 2 ページ: 222-32

    • DOI

      10.1016/j.ydbio.2013.05.011

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Epiblast ground state is controlled by canonical Wnt/ β-catenin signaling in the postimplantation mouse embryo and epiblast stem cells2013

    • 著者名/発表者名
      Sumi, Oki, Kitajima, Meno
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 8 号: 5 ページ: e63378-e63378

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0063378

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] ChIP-Atlas: Comprehensive and integrative database for visualizing and mining all published ChIP-seq data2016

    • 著者名/発表者名
      Shinya Oki, Tazro Ohta, Go Shioi, Ryo Nakaki, Osamu Ogasawara, Yoshihiro Okuda, Hideki Hatanaka, Chikara Meno
    • 学会等名
      SYSTEMS BIOLOGY: GLOBAL REGULATION OF GENE EXPRESSION
    • 発表場所
      Cold spring harbor laboratory
    • 年月日
      2016-03-17
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 既報のChIP-seqデータをフル活用するための統合データベース2015

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥, 大田 達郎, 塩井 剛, 仲木 竜, 目野 主税
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜市
    • 年月日
      2015-12-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ChIP-seq データベースのためのメタ情報アノテーション2015

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      Annotathon 2015
    • 発表場所
      三島市
    • 年月日
      2015-11-12
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 既報のChIP-seqデータをフル活用するための統合データベース2015

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      生命情報科学若手の会 第7回研究会
    • 発表場所
      鶴岡市
    • 年月日
      2015-10-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ChIP-seq SRA を利活用するための統合データベース2015

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥, 大田 達郎, 塩井 剛, 目野 主税
    • 学会等名
      NGS現場の会第四回研究会
    • 発表場所
      つくば市
    • 年月日
      2015-07-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ChIP-Atlas: Comprehensive database for visualizing all published ChIP-seq data2015

    • 著者名/発表者名
      Shinya Oki, Tazro Ohta, Go Shioi, Chikara Meno
    • 学会等名
      48th Annual Meeting of JSDB
    • 発表場所
      つくば市
    • 年月日
      2015-06-02
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 誰でも使えるChIP-seqデータの可視化ツール2015

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      定量生物学の会 第7回年会
    • 発表場所
      春日市 九州大学筑紫キャンパス
    • 年月日
      2015-01-11 – 2015-01-12
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] SraTailor: 誰でも使えるChIP-seqデータの可視化ツール2014

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥, 前原 一満, 大川 恭行, 目野 主税
    • 学会等名
      第37回日本分子生物学会
    • 発表場所
      横浜市 パシフィコ横浜
    • 年月日
      2014-11-25
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] SraTailor: GUI software for visualizing high-throughput sequence read archives2014

    • 著者名/発表者名
      Shinya Oki, Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa, Chikara Meno
    • 学会等名
      47th Annual Meeting for the Japanese Society of Developmental Biologists
    • 発表場所
      名古屋市 ウインクあいち
    • 年月日
      2014-05-28
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] Development of a Mac GUI Application to Visualize Published Raw ChIP-seq data2013

    • 著者名/発表者名
      Shinya Oki and Chikara Meno
    • 学会等名
      The 61st NIBB Conference "Cellular Community in Mammalian Embryogenesis"
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] 既報の次世代シーケンサ解析データを可視化するための簡易ソフトウェア2013

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      定量生物学の会 第六回年会
    • 発表場所
      大阪大学吹田キャンパス 銀杏会館
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Development of a GUI software to visualize high through-put sequence read archives2013

    • 著者名/発表者名
      Shinya Oki, Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa, Chikara Meno
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸国際会議場
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [備考] ChIP-Atlas

    • URL

      http://chip-atlas.org

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [備考] SraTailor

    • URL

      http://www.devbio.med.kyushu-u.ac.jp/sra_tailor/

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi