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環境DNA分析によるシクリッド魚類群集の多様性把握

研究課題

研究課題/領域番号 25840144
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 生物多様性・分類
研究機関龍谷大学

研究代表者

丸山 敦  龍谷大学, 理工学部, 講師 (70368033)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2014年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
2013年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
キーワード環境DNA / シクリッド魚類 / マラウイ湖 / ITS / D-loop / 定量PCR / シクリッド / マラウイ / 国際情報交換
研究成果の概要

環境DNA技術を適応した、マラウイ湖シクリッド魚類群集の多様性把握手法の確立を目指した。研究開始早々に同所的に生息する103魚種を入手し、D-loop領域およびITS領域の配列情報を得た。D-loop領域を対象にしたユニバーサルな環境DNAプライマーを作成し、魚類由来の環境DNA採集方法を確立した。シクリッド魚類の組成や多様性が異なるマラウイ湖6地域12地点で採水・濾過を行い、DNA抽出を終えた。D-loop領域のDNA配列における種間変異が想定外に乏しかったため、ITS領域を対象としたプライマーの再設計が進行中である。

報告書

(3件)
  • 2014 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2015 2014 2013

すべて 雑誌論文 (10件) (うち査読あり 9件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (4件)

  • [雑誌論文] Techniques for the practical collection of environmental DNA: filter selection, preservation, and extraction2015

    • 著者名/発表者名
      Toshifumi Minamoto, Takafumi Naka, Kazuhiko Moji, Atsushi Maruyama
    • 雑誌名

      Limnology

      巻: 印刷中

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The Release Rate of Environmental DNA from Juvenile and Adult Fish.2015

    • 著者名/発表者名
      Maruyama, A., Nakamura, K., Yamanaka, H., Kondoh, and M., Minamoto, T.
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 9 号: 12 ページ: e114639-e114639

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0114639

    • NAID

      120006220782

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Microhabitat variations in diatom composition and stable isotope ratios of the epilithic algae in Lake Malawi2015

    • 著者名/発表者名
      Maruyama A, Shinohara K, Sakurai M, Ohtsuka T, Rusuwa B
    • 雑誌名

      Hydrobiologia

      巻: 748 号: 1 ページ: 161-169

    • DOI

      10.1007/s10750-014-1977-3

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Studying the contribution of two types of landlocked Ayu fish in Lake Biwa to the next generation using nitrogen-stable isotope ratio analysis2015

    • 著者名/発表者名
      Ito T, Matsumura K, Kozawa G, Ozawa M, Mitsuo Y, Maruyama A, Yuma M
    • 雑誌名

      Ichthyological Research

      巻: 62 号: 3 ページ: 357-362

    • DOI

      10.1007/s10228-014-0439-2

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Weight-length relationships for twelve cichlid species from Lake Malawi, Africa2014

    • 著者名/発表者名
      Maruyama A, Zatha R, Rusuwa B
    • 雑誌名

      International Journal of Fisheries and Aquatic Studies

      巻: 2 ページ: 124-127

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 環境DNAを用いた魚類群集の種多様性と現存量推定:適応放散の現場で2014

    • 著者名/発表者名
      丸山 敦,Rusuwa, B.,源利文,山中裕樹,近藤倫生
    • 雑誌名

      龍谷大学科技研ジャーナル

      巻: 21 ページ: 24-27

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [雑誌論文] Quick change in δ15N values of fish mucus confirmed in the field using a migratory goby2014

    • 著者名/発表者名
      Maruyama, A., Shimonaka, H., and Ito, T.
    • 雑誌名

      Ecology of Freshwater Fish

      巻: 24 号: 1 ページ: 162-164

    • DOI

      10.1111/eff.12124

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The relationship between an introduced predator?prey pair, largemouth2014

    • 著者名/発表者名
      Noda, H. and Maruyama, A.
    • 雑誌名

      Ichthyological Research

      巻: 61 号: 1 ページ: 159-164

    • DOI

      10.1111/pre.12036

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The relationship between an introduced predator?prey pair, largemouth bass and bluegill, and the chlorophyll concentration in farm ponds2014

    • 著者名/発表者名
      Noda, H. and Maruyama, A.
    • 雑誌名

      Ichthyological Research

      巻: 61 号: 2 ページ: 159-164

    • DOI

      10.1007/s10228-013-0380-9

    • NAID

      40020049185

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Ligula intestinalis (Cestoda: Pseudophyllidea) infection of Engraulicypris sardella (Pisces: Cyprinidae) in Lake Malawi2014

    • 著者名/発表者名
      Rusuwa, B., Ngochera, M. and Maruyama, A.
    • 雑誌名

      Malawi Journal of Science and Technology

      巻: 10 ページ: 8-14

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Environmental DNA release velocity from different sized fish2014

    • 著者名/発表者名
      Maruyama A, Nakamura K, Yamanaka H, Kondoh M, Minamoto T.
    • 学会等名
      日本生態学会
    • 発表場所
      広島市
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] 水田に生物がいると水質とイネはどう変化するか ~ドジョウ、タニシ、オタマ ジャクシが果たす役割~2014

    • 著者名/発表者名
      小山奈々・辻咲恵・池田町農業公社・ネイチャースケープ・丸山敦・岩井紀子
    • 学会等名
      日本生態学会
    • 発表場所
      広島市
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] 生物がいると水田の群集組成はどう変化するか ~ドジョウ、タニ シ、オタマジャクシが果たす役割~2014

    • 著者名/発表者名
      辻咲恵・小山奈々・大塚泰介・池田町農業公社・ネイチャースケープ・岩井紀 子・丸山敦
    • 学会等名
      日本生態学会
    • 発表場所
      広島市
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Taxonomic revision of three diatoms found in Lake Malawi; Afrocymbella brunii (Fricke) comb. nov., Afrocymbella rossii (Kociolek & Stoermer) comb. nov., and Aulacoseira euareolata (O.Muller) comb. nov. et nom. nov.2013

    • 著者名/発表者名
      篠原耕平・丸山敦・Bosco Rusuwa・大塚泰介
    • 学会等名
      日本珪藻学会
    • 発表場所
      那覇市
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書

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公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

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