迅速な適応を可能にする遺伝子変異の由来の判定

• 研究課題/領域番号: 25840161
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 生態・環境
• 研究機関: 玉川大学
• 研究代表者: 三村 真紀子 玉川大学, 農学部, 准教授 (60451689)
• 研究協力者: 國武 久登 宮崎大学, 農学部, 教授 (80289628) ; 今西 弘幸 秋田県立大学, 生物資源科学部, 准教授 (10320607)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円); 2015年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円); 2014年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円); 2013年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
• キーワード: local adaptation / common garden experiment / RADseq / 局所適応 / 相互移植実験 / 分布域 / 気候変動 / ゲノムスキャン / 環境適応 / 適応関連遺伝子 / standing variation / new mutation / introgression

研究成果の概要

本研究では、東北から屋久島（南九州）まで分布し、すでにドラフトゲノムが決定しているモミジイチゴを対象として、ゲノム変異解析と相互移植実験から分布域の維持に貢献する遺伝的変異の由来を検証した。相互移植実験では、明瞭な形態的・形質的な地域間変異が検出されている。また、RADseqによるゲノムワイド変異解析では、初期解析において複数の適応関連候補SNPsが検出された。形質的には同地域間で類似しているものの、選択下にあると推定されたSNPsは同一地域内集団間で異なるものもあり、環境へ対する類似の形質変化への既存の遺伝的変異の寄与が示唆された。今後、形質との関連を精査する。

研究成果

• [雑誌論文] キイチゴたちが屋久島で出会うとき：気候変動と遺伝的交流 (2015)
  • 著者名/発表者名: 三村真紀子
  • 雑誌名: 屋久島学 巻: 2 ページ: 97-99
• [雑誌論文] Range shift and introgression of the rear and leading populations in two ecologically distinct Rubus species (2014)
  • 著者名/発表者名: Makiko Mimura, Misako Mishima, Martin Lascoux and Tetsukazu Yahara
  • 雑誌名: BMC Evolutionary Biology 巻: 14 号: 1 ページ: 209-209
  • DOI: 10.1186/s12862-014-0209-9
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Biodiversity only makes sense in the light of evolution (2014)
  • 著者名/発表者名: R Geeta, Lucia G Lohmann, Susana Magallon, Daniel P Faith, Andrew Hendry, Keith Crandall, Luc de Meester, Cam Webb, Anne-Helene Prieur-Richard, Makiko Mimura, Elena Conti, Joel Cracraft, Felix Forest, Carlos Jaramillo, Michael Donoghue, Tetsukazu Yahara
  • 雑誌名: Journal of Biosciences 巻: 39 号: 3 ページ: 333-337
  • DOI: 10.1007/s12038-014-9427-y
  • 査読あり
• [学会発表] 標高帯における適応的浸透交雑 (2015)
  • 著者名/発表者名: 三村真紀子
  • 学会等名: 日本生態学会第62回全国大会
  • 発表場所: 鹿児島大学郡元キャンパス（鹿児島県）
  • 年月日: 2015-03-18 – 2015-03-22
• [学会発表] 気候変動による種の接触と浸透交雑 (2014)
  • 著者名/発表者名: 三村真紀子・矢原徹一
  • 学会等名: 日本生態学会第61回全国大会
  • 発表場所: 広島国際会議場（広島市）
• [学会発表] 野生キイチゴのde novo アセンブリ (2014)
  • 著者名/発表者名: 三村真紀子・山口勝司・重信秀治
  • 学会等名: 第 125 回日本森林学会大会
  • 発表場所: 大宮ソニックシティ（大宮市）