花粉化石のDNA多型に基づく最終氷期以降のスギの分布変遷の解明

• 研究課題/領域番号: 25850113
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 森林科学
• 研究機関: 秋田県立大学
• 研究代表者: 長谷川 陽一 秋田県立大学, 付置研究所, 研究員 (30634034)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円); 2014年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円); 2013年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
• キーワード: スギ / 花粉化石 / 葉緑体DNA / マイクロサテライトマーカー

研究成果の概要

本研究では、東北地方の湿地の堆積物からスギ花粉化石を採集し、DNAを増幅して、これを現生のスギ天然林集団のDNAと比較することを試みた。花粉化石からのDNA増幅に使用する葉緑体マイクロサテライトマーカー17座の遺伝的多様性は十分に高く、花粉DNA分析に使用できることが明らかになった。また、これらの葉緑体マーカーを使用して、青森県八甲田山の湿地に隣接する2つのスギ孤立林では、伏条更新によって生じた同一クローンに由来する幹が多数分布することが明らかになった。しかし、湿地から採集した堆積物から、DNAの増幅は見られなかった。堆積物からのDNAの抽出方法を改良する必要があると考えられた。

研究成果

• [雑誌論文] Isolation and characterization of 22 EST-SSR markers for the genus Thujopsis (Cupressaceae) (2015)
  • 著者名/発表者名: Sato, M., Hasegawa, Y., Mishima, K., Takata, K.
  • 雑誌名: Applications in Plant Sciences 巻: 3 号: 2 ページ: 1400101-1400101
  • DOI: 10.3732/apps.1400101
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Variation in pollen-donor composition among pollinators in an entomophilous tree species, Castanea crenata, revealed by single-pollen genotyping. (2015)
  • 著者名/発表者名: Hasegawa Y, Suyama Y, Seiwa K.
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 10 号: 3 ページ: e0120393-e0120393
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0120393
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Draft sequences of the radish (Raphanus sativus L.) genome. (2014)
  • 著者名/発表者名: Kitashiba H, Li F, Hirakawa H, Kawanabe T, Zou Z, Hasegawa Y, Tonosaki K, Shirasawa S, Fukushima A, Yokoi S, Takahata Y, Kakizaki T, Ishida M, Okamoto S, Sakamoto K, Shirasawa K, Tabata S, Nishio T.
  • 雑誌名: DNA Research 巻: 21 号: 5 ページ: 481-490
  • DOI: 10.1093/dnares/dsu014
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] 仙台市富沢遺跡のモミ属花粉化石からのDNA増幅と種同定に関する試み (2013)
  • 著者名/発表者名: 長谷川陽一、鈴木三男
  • 雑誌名: 植生史研究 巻: 22 ページ: 3-12
  • NAID: 130007999556
  • 査読あり
• [学会発表] リンゴ花粉一粒からのPCR法による遺伝子解析. (2015)
  • 著者名/発表者名: 中村桃子, 長谷川陽一, 佐藤奈美子, 髙橋秀和, 渡辺明夫, 赤木宏守, 岡田和馬, 櫻井健二.
  • 学会等名: 園芸学会
  • 発表場所: 千葉大学
  • 年月日: 2015-03-28 – 2015-03-29
• [学会発表] アスナロ属(ヒバ、アスナロ)天然林を対象としたEST-SSRマーカーによる遺伝構造解析. (2015)
  • 著者名/発表者名: 佐藤都子, 長谷川陽一, 三嶋賢太郎, 高田克彦.
  • 学会等名: 日本森林学会
  • 発表場所: 北海道大学
  • 年月日: 2015-03-27 – 2015-03-28
• [学会発表] 世代シーケンサーを用いたハチミツに含まれる花粉の種の同定. (2015)
  • 著者名/発表者名: 長谷川陽一, 浅野亮樹, 高田克彦.
  • 学会等名: 日本森林学会
  • 発表場所: 北海道大学
  • 年月日: 2015-03-27 – 2015-03-28
• [学会発表] 米の主要なトリアシルグリセロールリパーゼの同定と酵素化学的特性の解明. (2015)
  • 著者名/発表者名: 永田俊文, 長谷川陽一, 濱田茂樹, 熊丸敏博, 松坂弘明, 鈴木保宏.
  • 学会等名: 日本育種学会
  • 発表場所: 玉川大学
  • 年月日: 2015-03-21 – 2015-03-22
• [学会発表] 米の主要なトリアシルグリセロールリパーゼ候補遺伝子の推定とTILLING法による変異系統候補の選抜. (2014)
  • 著者名/発表者名: 長谷川陽一, 濱田茂樹, 熊丸敏博, 松坂弘明, 鈴木保宏.
  • 学会等名: 日本育種学会
  • 発表場所: 南九州大学
  • 年月日: 2014-09-26 – 2014-09-27
• [学会発表] スギ花粉化石のDNA解析のための、秋田スギ天然林のcpSSR多型分析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 長谷川陽一、吉田明弘、三嶋賢太郎、高田克彦
  • 学会等名: 日本森林学会
  • 発表場所: 大宮ソニックシティ
• [学会発表] EST-SSRマーカーを用いたヒノキアスナロ(ヒバ)天然林の遺伝的多様性解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 佐藤都子、長谷川陽一、三嶋賢太郎、蒔田明史、高田克彦
  • 学会等名: 日本森林学会
  • 発表場所: 大宮ソニックシティ
• [学会発表] スギ雪害抵抗性品種「出羽の雪」の成長と材質II (2014)
  • 著者名/発表者名: 小林 慧、高田克彦、長谷川陽一、織部雄一朗、古本良
  • 学会等名: 日本木材学会
  • 発表場所: 愛媛大学